RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 DLK2Q6UY11 383 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 CBLL1Q75N03 491 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 MUL1Q969V5 352 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 MUS81Q96NY9 551 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 CHRDQ9H2X0 955 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 SEMA6CQ9H3T2 930 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 RPL34P49207 117 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 NUDT6P53370 316 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 SLC35A1P78382 337 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 C1orf61Q13536 156 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 GSG1LQ6UXU4 331 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 SAMD12Q8N8I0 201 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 OR52E2Q8NGJ4 325 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 OR9A2Q8NGT5 310 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 ISL2Q96A47 359 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 PBDC1Q9BVG4 233 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 KCNN3Q9UGI6 736 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 LRP5LA4QPB2 252 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 ANTXRLA6NF34 631 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 C12orf71A8MTZ7 269 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 SYT7O43581 403 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 IGHG1P01857 330 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 CD27P26842 260 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 RACK1P63244 317 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 HYAL2Q12891 473 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 RAB31Q13636 194 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 KCTD11Q693B1 232 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 OR5H2Q8NGV7 314 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 SLC2A12Q8TD20 617 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 ITPKCQ96DU7 683 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 TCEAL4Q96EI5 215 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 OR4K3Q96R72 315 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 SOCS2O14508 198 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 BPNT1O95861 308 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 POU2F2P09086 479 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 PRKACBP22694 351 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 VAMP1P23763 118 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 CERS1P27544 350 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 CDKN2CP42773 168 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 ETV4P43268 484 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 ARG2P78540 354 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 BTBD16Q32M84 506 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 FAM78AQ5JUQ0 283 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 SLC46A1Q96NT5 459 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 MARCH7Q9H992 704 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 WDR37Q9Y2I8 494 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 MYH8P13535 1937 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 CHD4Q14839 1912 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 EPHA4P54764 986 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 CDH15P55291 814 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 ARF5P84085 180 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 GRK1Q15835 563 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 PM20D2Q8IYS1 436 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 MAP3K3Q99759 626 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 A4GALTQ9NPC4 353 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 KLF15Q9UIH9 416 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 TLCD2A6NGC4 264 aa8□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 TARM1B6A8C7 271 aa8□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 FBP2O00757 339 aa8□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 SDC1P18827 310 aa8□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 OR1E2P47887 323 aa8□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 PDE7AQ13946 482 aa8□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 CEACAM7Q14002 265 aa8□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 KMT5CQ86Y97 462 aa8□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 SNX29P2Q8IUI4 249 aa8□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 CMTM1Q8IZ96 169 aa8□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 OR52B6Q8NGF0 335 aa8□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 INTS14Q96SY0 518 aa8□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 SPHK1Q9NYA1 384 aa8□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 PRDM4Q9UKN5 801 aa8□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa8□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 PAPPAQ13219 1627 aa8□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 AGAP5A6NIR3 686 aa8□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 M0R233 179 aa8□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 CELP19835 753 aa8□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 DUSP6Q16828 381 aa8□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 RAB12Q6IQ22 244 aa8□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 SLC22A16Q86VW1 577 aa8□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 TMPRSS12Q86WS5 348 aa8□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.6 ms