RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533451.1

UBASH3B-208, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

TSL 2

Gene UBASH3B, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-208ENST00000533451 ANKRD28O15084 1053 aa10.45□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 CBR3O75828 277 aa10.45□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 KCNK2O95069 426 aa10.45□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 ANP32DO95626 131 aa10.45□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 HPNP05981 417 aa10.45□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 GSNP06396 782 aa10.45□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 MATN1P21941 496 aa10.45□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 UQCRC2P22695 453 aa10.45□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 ACVR2AP27037 513 aa10.45□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 PTGDSP41222 190 aa10.45□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 GSTA3Q16772 222 aa10.45□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 TIGD2Q4W5G0 525 aa10.45□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 DCST2Q5T1A1 773 aa10.45□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 CDC73Q6P1J9 531 aa10.45□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 TMEM81Q6P7N7 255 aa10.45□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa10.45□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 EPGNQ6UW88 154 aa10.45□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 RPTNQ6XPR3 784 aa10.45□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 C16orf62Q7Z3J2 963 aa10.45□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 C6orf120Q7Z4R8 191 aa10.45□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 IFNEQ86WN2 208 aa10.45□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 TRIML2Q8N7C3 387 aa10.45□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 WDSUB1Q8N9V3 476 aa10.45□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa10.45□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 SFXN2Q96NB2 322 aa10.45□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 OR7D2Q96RA2 312 aa10.45□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 STACQ99469 402 aa10.45□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 VKORC1Q9BQB6 163 aa10.45□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 SLC35A5Q9BS91 424 aa10.45□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 DSN1Q9H410 356 aa10.45□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 PIGUQ9H490 435 aa10.45□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 PTGES2Q9H7Z7 377 aa10.45□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 NPHS2Q9NP85 383 aa10.45□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 ACKR4Q9NPB9 350 aa10.45□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 TAS2R10Q9NYW0 307 aa10.45□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 MED11Q9P086 117 aa10.45□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 NTMQ9P121 344 aa10.45□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 FBXL2Q9UKC9 423 aa10.45□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 CACNA1CQ13936 2221 aa10.45□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa10.44□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 A0A1B0GVC2 190 aa10.44□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 NPIPA7E9PJI5 369 aa10.44□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 H0Y3Z8 333 aa10.44□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 SCDO00767 359 aa10.44□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 NDUFB5O43674 189 aa10.44□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 FADS1O60427 444 aa10.44□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 TGDSO95455 350 aa10.44□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 ANGPTL1O95841 491 aa10.44□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 PGRP06401 933 aa10.44□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 NPIPA8P0DM63 369 aa10.44□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 HK1P19367 917 aa10.44□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 DPP4P27487 766 aa10.44□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 IL12AP29459 219 aa10.44□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 KHKP50053 298 aa10.44□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 IDH3AP50213 366 aa10.44□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 WNT3P56703 355 aa10.44□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 HPCAP84074 193 aa10.44□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 SRYQ05066 204 aa10.44□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 C6orf10Q5SRN2 563 aa10.44□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 ATAD3BQ5T9A4 648 aa10.44□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 RAET1LQ5VY80 246 aa10.44□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 ZNF621Q6ZSS3 439 aa10.44□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa10.44□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 OR9I1Q8NGQ6 314 aa10.44□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 PSMA8Q8TAA3 256 aa10.44□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 DUSP19Q8WTR2 217 aa10.44□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 SDCCAG3Q96C92 435 aa10.44□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 EBF4Q9BQW3 602 aa10.44□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 INPP5KQ9BT40 448 aa10.44□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 OR51I1Q9H343 314 aa10.44□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 UBQLN3Q9H347 655 aa10.44□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 RMND5AQ9H871 391 aa10.44□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 DUSP22Q9NRW4 184 aa10.44□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 GPATCH2Q9NW75 528 aa10.44□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 FBXO34Q9NWN3 711 aa10.44□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 COQ3Q9NZJ6 369 aa10.44□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 DCTN4Q9UJW0 460 aa10.44□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 HRH3Q9Y5N1 445 aa10.44□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 KCNE3Q9Y6H6 103 aa10.44□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 A0A0G2JND7 137 aa10.43□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 CCDC154A6NI56 674 aa10.43□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 DUXAA6NLW8 204 aa10.43□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa10.43□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 PRSS44E7EML9 344 aa10.43□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 NR5A2O00482 541 aa10.43□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 RFXANKO14593 260 aa10.43□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 ZNF195O14628 629 aa10.43□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 WDR1O75083 606 aa10.43□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 NUDT14O95848 222 aa10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.5 ms