RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532181.5

SSH3-208, Transcript of slingshot protein phosphatase 3, human

TSL 3

Gene SSH3, Length 948 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSH3-208	ENST00000532181	COX18	Q8N8Q8	333 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SSH3-208	ENST00000532181	GATS	Q8NAP1	163 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SSH3-208	ENST00000532181	FAM98A	Q8NCA5	519 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
SSH3-208	ENST00000532181	ZFP90	Q8TF47	636 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SSH3-208	ENST00000532181	MED12	Q93074	2177 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SSH3-208	ENST00000532181	CCDC120	Q96HB5	630 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SSH3-208	ENST00000532181	TMEM41A	Q96HV5	264 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SSH3-208	ENST00000532181	PHF12	Q96QT6	1004 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SSH3-208	ENST00000532181	STAC	Q99469	402 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SSH3-208	ENST00000532181	ZBTB18	Q99592	522 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SSH3-208	ENST00000532181	NPAS1	Q99742	590 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SSH3-208	ENST00000532181	RSPO3	Q9BXY4	272 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
SSH3-208	ENST00000532181	TRIM8	Q9BZR9	551 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SSH3-208	ENST00000532181	IKZF5	Q9H5V7	419 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SSH3-208	ENST00000532181	SAR1A	Q9NR31	198 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SSH3-208	ENST00000532181	C15orf41	Q9Y2V0	281 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SSH3-208	ENST00000532181	PCDHB14	Q9Y5E9	798 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SSH3-208	ENST00000532181	TRBV5-3	A0A0A0MS03	114 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SSH3-208	ENST00000532181		A0A1B0GVC2	190 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SSH3-208	ENST00000532181	TTC36	A6NLP5	189 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SSH3-208	ENST00000532181	PRSS44	E7EML9	344 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SSH3-208	ENST00000532181	HMGN4	O00479	90 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SSH3-208	ENST00000532181	FBP2	O00757	339 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SSH3-208	ENST00000532181	RFXANK	O14593	260 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SSH3-208	ENST00000532181	ZIC3	O60481	467 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SSH3-208	ENST00000532181	CDC40	O60508	579 aa	Known RBP eCLIP	11.21	□□□□□ -0.61
SSH3-208	ENST00000532181	SLC19A2	O60779	497 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SSH3-208	ENST00000532181	BCAS1	O75363	584 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
SSH3-208	ENST00000532181	SNX4	O95219	450 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SSH3-208	ENST00000532181	OXSR1	O95747	527 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
SSH3-208	ENST00000532181	CA7	P43166	264 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SSH3-208	ENST00000532181	ARFIP2	P53365	341 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SSH3-208	ENST00000532181	PLAUR	Q03405	335 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SSH3-208	ENST00000532181	SNTA1	Q13424	505 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SSH3-208	ENST00000532181	EFR3A	Q14156	821 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SSH3-208	ENST00000532181	MAPK14	Q16539	360 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SSH3-208	ENST00000532181	CPEB4	Q17RY0	729 aa	Known RBP eCLIP	11.21	□□□□□ -0.61
SSH3-208	ENST00000532181	NDUFAF6	Q330K2	333 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SSH3-208	ENST00000532181	KRTCAP3	Q53RY4	240 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SSH3-208	ENST00000532181	DCST1	Q5T197	706 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SSH3-208	ENST00000532181	DCST2	Q5T1A1	773 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SSH3-208	ENST00000532181	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
SSH3-208	ENST00000532181	DLEU7	Q6UYE1	221 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SSH3-208	ENST00000532181	C3P1	Q6ZMU1	363 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SSH3-208	ENST00000532181		Q6ZPB1	254 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
SSH3-208	ENST00000532181	YRDC	Q86U90	279 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
SSH3-208	ENST00000532181	SLC22A16	Q86VW1	577 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SSH3-208	ENST00000532181	DOLPP1	Q86YN1	238 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SSH3-208	ENST00000532181	FAM109A	Q8N4B1	249 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SSH3-208	ENST00000532181	RPRML	Q8N4K4	120 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SSH3-208	ENST00000532181	ANKFN1	Q8N957	763 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SSH3-208	ENST00000532181	FADS6	Q8N9I5	356 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SSH3-208	ENST00000532181	CHDH	Q8NE62	594 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
SSH3-208	ENST00000532181	ADAMTS15	Q8TE58	950 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SSH3-208	ENST00000532181	DUSP19	Q8WTR2	217 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SSH3-208	ENST00000532181	ITLN2	Q8WWU7	325 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
SSH3-208	ENST00000532181	MOAP1	Q96BY2	351 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SSH3-208	ENST00000532181	TMCO6	Q96DC7	493 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SSH3-208	ENST00000532181	SPDL1	Q96EA4	605 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SSH3-208	ENST00000532181	ARSG	Q96EG1	525 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SSH3-208	ENST00000532181	SLC35G5	Q96KT7	338 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SSH3-208	ENST00000532181	ZNF597	Q96LX8	424 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SSH3-208	ENST00000532181	RABEP2	Q9H5N1	569 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SSH3-208	ENST00000532181	RYDEN	Q9NUL5	291 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
SSH3-208	ENST00000532181	KLRF1	Q9NZS2	232 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SSH3-208	ENST00000532181	MED11	Q9P086	117 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SSH3-208	ENST00000532181	PCDHGB4	Q9UN71	923 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SSH3-208	ENST00000532181	FAF1	Q9UNN5	650 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
SSH3-208	ENST00000532181	WIF1	Q9Y5W5	379 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SSH3-208	ENST00000532181	FREM3	P0C091	2139 aa		11.21	□□□□□ -0.62
SSH3-208	ENST00000532181	TEX15	Q9BXT5	2789 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSH3-208	ENST00000532181	KDM4E	B2RXH2	506 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
SSH3-208	ENST00000532181	KCNH1	O95259	989 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSH3-208	ENST00000532181	NUDT7	P0C024	238 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSH3-208	ENST00000532181	ZCCHC18	P0CG32	403 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSH3-208	ENST00000532181	ETFA	P13804	333 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSH3-208	ENST00000532181	TBXA2R	P21731	343 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSH3-208	ENST00000532181	LSP1	P33241	339 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSH3-208	ENST00000532181	B3GALT5-AS1	P59052	145 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSH3-208	ENST00000532181	ADORA2A-AS1	P86434	159 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSH3-208	ENST00000532181	RBPJ	Q06330	500 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSH3-208	ENST00000532181	STX5	Q13190	355 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSH3-208	ENST00000532181	SLC10A1	Q14973	349 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSH3-208	ENST00000532181	SYPL1	Q16563	259 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSH3-208	ENST00000532181	KLHL26	Q53HC5	615 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSH3-208	ENST00000532181	WIPI1	Q5MNZ9	446 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
SSH3-208	ENST00000532181	TBCEL	Q5QJ74	424 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSH3-208	ENST00000532181	PACS2	Q86VP3	889 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSH3-208	ENST00000532181	GHDC	Q8N2G8	530 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSH3-208	ENST00000532181	VPS37A	Q8NEZ2	397 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSH3-208	ENST00000532181	OR2M3	Q8NG83	312 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSH3-208	ENST00000532181	XAGE5	Q8WWM1	108 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSH3-208	ENST00000532181	CHMP6	Q96FZ7	201 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSH3-208	ENST00000532181	ITCH	Q96J02	903 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSH3-208	ENST00000532181	ELAC2	Q9BQ52	826 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
SSH3-208	ENST00000532181	DSN1	Q9H410	356 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSH3-208	ENST00000532181	RUBCNL	Q9H714	662 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSH3-208	ENST00000532181	VAPA	Q9P0L0	249 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSH3-208	ENST00000532181	KLHL14	Q9P2G3	628 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSH3-208	ENST00000532181	BOK	Q9UMX3	212 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62

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