RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 ZNF550Q7Z398 422 aa15.22■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
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HERC3-211ENST00000513325 METTL25Q8N6Q8 603 aa15.22■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 ZNF610Q8N9Z0 462 aa15.22■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 GPR151Q8TDV0 419 aa15.22■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 PIK3IP1Q96FE7 263 aa15.22■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 OXSMQ9NWU1 459 aa15.22■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa15.22■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 AP4B1Q9Y6B7 739 aa15.22■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 PCNX3Q9H6A9 2034 aa15.22■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa15.21■□□□□ 0.03
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HERC3-211ENST00000513325 C16orf97H3BN30 126 aa15.21■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 PDPK1O15530 556 aa15.21■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 AQP8O94778 261 aa15.21■□□□□ 0.03
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HERC3-211ENST00000513325 PRPH2P23942 346 aa15.21■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
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HERC3-211ENST00000513325 TMEM44Q2T9K0 475 aa15.21■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 GALNT10Q86SR1 603 aa15.21■□□□□ 0.03
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HERC3-211ENST00000513325 PROCRQ9UNN8 238 aa15.21■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 VDAC3Q9Y277 283 aa15.21■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP15.2■□□□□ 0.02
HERC3-211ENST00000513325 SLC28A1O00337 649 aa15.2■□□□□ 0.02
HERC3-211ENST00000513325 ARHGEF9O43307 516 aa15.2■□□□□ 0.02
HERC3-211ENST00000513325 AKAP10O43572 662 aa15.2■□□□□ 0.02
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HERC3-211ENST00000513325 NKX2-2O95096 273 aa15.2■□□□□ 0.02
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HERC3-211ENST00000513325 CPA3P15088 417 aa15.2■□□□□ 0.02
HERC3-211ENST00000513325 MAP3K8P41279 467 aa15.2■□□□□ 0.02
HERC3-211ENST00000513325 PRKAG1P54619 331 aa15.2■□□□□ 0.02
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HERC3-211ENST00000513325 FGFBP1Q14512 234 aa15.2■□□□□ 0.02
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HERC3-211ENST00000513325 ZNF385BQ569K4 471 aa15.2■□□□□ 0.02
HERC3-211ENST00000513325 Q5PR19 223 aa15.2■□□□□ 0.02
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HERC3-211ENST00000513325 C22orf34Q6ZV56 151 aa15.2■□□□□ 0.02
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HERC3-211ENST00000513325 GGNQ86UU5 652 aa15.2■□□□□ 0.02
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HERC3-211ENST00000513325 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
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HERC3-211ENST00000513325 PIP5K1AQ99755 562 aa15.2■□□□□ 0.02
HERC3-211ENST00000513325 UBTD1Q9HAC8 227 aa15.2■□□□□ 0.02
HERC3-211ENST00000513325 C1orf109Q9NX04 203 aa15.2■□□□□ 0.02
HERC3-211ENST00000513325 FIS1Q9Y3D6 152 aa15.2■□□□□ 0.02
HERC3-211ENST00000513325 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa15.19■□□□□ 0.02
HERC3-211ENST00000513325 NPIPB8E9PQR5 432 aa15.19■□□□□ 0.02
HERC3-211ENST00000513325 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
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HERC3-211ENST00000513325 RGS14O43566 566 aa15.19■□□□□ 0.02
HERC3-211ENST00000513325 FCGR2AP12318 317 aa15.19■□□□□ 0.02
HERC3-211ENST00000513325 TBXA2RP21731 343 aa15.19■□□□□ 0.02
HERC3-211ENST00000513325 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
HERC3-211ENST00000513325 SLC6A8P48029 635 aa15.19■□□□□ 0.02
HERC3-211ENST00000513325 ACKR1Q16570 336 aa15.19■□□□□ 0.02
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HERC3-211ENST00000513325 Q6ZSR9 355 aa15.19■□□□□ 0.02
HERC3-211ENST00000513325 SZRD1Q7Z422 152 aa15.19■□□□□ 0.02
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HERC3-211ENST00000513325 OR2T11Q8NH01 316 aa15.19■□□□□ 0.02
HERC3-211ENST00000513325 OR4C3Q8NH37 302 aa15.19■□□□□ 0.02
HERC3-211ENST00000513325 CEP70Q8NHQ1 597 aa15.19■□□□□ 0.02
HERC3-211ENST00000513325 FBXO30Q8TB52 745 aa15.19■□□□□ 0.02
HERC3-211ENST00000513325 PPCDCQ96CD2 204 aa15.19■□□□□ 0.02
HERC3-211ENST00000513325 GIMAP5Q96F15 307 aa15.19■□□□□ 0.02
HERC3-211ENST00000513325 MARK4Q96L34 752 aa15.19■□□□□ 0.02
HERC3-211ENST00000513325 TSSK3Q96PN8 268 aa15.19■□□□□ 0.02
HERC3-211ENST00000513325 HS3ST6Q96QI5 342 aa15.19■□□□□ 0.02
HERC3-211ENST00000513325 CCT7Q99832 543 aa15.19■□□□□ 0.02
HERC3-211ENST00000513325 PRRG4Q9BZD6 226 aa15.19■□□□□ 0.02
HERC3-211ENST00000513325 KLHL4Q9C0H6 718 aa15.19■□□□□ 0.02
HERC3-211ENST00000513325 REEP4Q9H6H4 257 aa15.19■□□□□ 0.02
HERC3-211ENST00000513325 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
HERC3-211ENST00000513325 SH3BP4Q9P0V3 963 aa15.19■□□□□ 0.02
HERC3-211ENST00000513325 NAV3Q8IVL0 2385 aa15.19■□□□□ 0.02
HERC3-211ENST00000513325 SMIM23A6NLE4 172 aa15.18■□□□□ 0.02
HERC3-211ENST00000513325 ALG1L2C9J202 215 aa15.18■□□□□ 0.02
HERC3-211ENST00000513325 COPEO14579 308 aa15.18■□□□□ 0.02
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