RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504458.1

SERF1A-204, Transcript of small EDRK-rich factor 1A, human

TSL 4 BASIC

Gene SERF1A, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SERF1A-204	ENST00000504458	NTM	Q9P121	344 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	SLC23A2	Q9UGH3	650 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	ENTPD4	Q9Y227	616 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	GSTK1	Q9Y2Q3	226 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	CMAHP	Q9Y471	501 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	ASB4	Q9Y574	426 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	HEBP2	Q9Y5Z4	205 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	REV3L	O60673	3130 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	TRDV1	A0A1B0GX56	115 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	KDM4E	B2RXH2	506 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458		H7BY64	318 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	SLC30A4	O14863	429 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	TLX2	O43763	284 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	PRICKLE3	O43900	615 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	TRIM3	O75382	744 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	SOX30	O94993	753 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	OR5F1	O95221	314 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	HMGN1	P05114	100 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	HOXC4	P09017	264 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	HBQ1	P09105	142 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	TSPAN19	P0C672	248 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	OR12D1	P0DN82	309 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	CKMT1A	P12532	417 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	GLUL	P15104	373 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	CD53	P19397	219 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	C5AR1	P21730	350 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	HIST1H1T	P22492	207 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	MMP11	P24347	488 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	FPR3	P25089	353 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	NDUFS1	P28331	727 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	GABRA5	P31644	462 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	MPI	P34949	423 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	RPS19	P39019	145 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	GDNF	P39905	211 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	CASP3	P42574	277 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	MAN2A2	P49641	1150 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	SEPHS1	P49903	392 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	CLCNKA	P51800	687 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	NCBP2	P52298	156 aa	Known RBP eCLIP	5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	GAS1	P54826	345 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	STARD6	P59095	220 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	STXBP1	P61764	594 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	CYP4F2	P78329	520 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	NTHL1	P78549	312 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	BDH1	Q02338	343 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	SCN1B	Q07699	218 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	ASAH1	Q13510	395 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	GPR50	Q13585	617 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	RIN1	Q13671	783 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	ENPP2	Q13822	863 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	LARS2	Q15031	903 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	SYPL1	Q16563	259 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	DECR1	Q16698	335 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	WSCD2	Q2TBF2	565 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	GLYR1	Q49A26	553 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	CCDC92	Q53HC0	331 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	SYT14P1	Q58G82	188 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	ARMC4	Q5T2S8	1044 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	DDI2	Q5TDH0	399 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	NDUFAF5	Q5TEU4	345 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	SLC48A1	Q6P1K1	146 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	SLC27A4	Q6P1M0	643 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	ABHD17C	Q6PCB6	329 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	PARM1	Q6UWI2	310 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	USP30	Q70CQ3	517 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	MTSS1L	Q765P7	747 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	RAB43	Q86YS6	212 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	SNX29P2	Q8IUI4	249 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	MMAA	Q8IVH4	418 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	UBQLNL	Q8IYU4	475 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	MMP21	Q8N119	569 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	ZNF366	Q8N895	744 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	MFSD9	Q8NBP5	474 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	FAM83F	Q8NEG4	500 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	OR2L5	Q8NG80	312 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	OR4D11	Q8NGI4	311 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	OR52I1	Q8NGK6	324 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	OR2A1	Q8NGT9	310 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	TEX47	Q8TBZ9	253 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	XAGE5	Q8WWM1	108 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	ASB12	Q8WXK4	309 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	FAM168A	Q92567	244 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	HTRA1	Q92743	480 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	OSTF1	Q92882	214 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	UFD1	Q92890	307 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	SMARCD2	Q92925	531 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	RAB8B	Q92930	207 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	SLC35B4	Q969S0	331 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	MS4A6E	Q96DS6	147 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	OTUB1	Q96FW1	271 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	EAF1	Q96JC9	268 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	LRR1	Q96L50	414 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	KCTD7	Q96MP8	289 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	SLC6A18	Q96N87	628 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	ZNF582	Q96NG8	517 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	PRAP1	Q96NZ9	151 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	OR2A14	Q96R47	310 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	SNX18	Q96RF0	628 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	FERD3L	Q96RJ6	166 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SERF1A-204	ENST00000504458	IL4I1	Q96RQ9	567 aa		5.76	□□□□□ -1.49

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