RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 PTHP01270 115 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 H1F0P07305 194 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 CHRM4P08173 479 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 CMPK1P30085 196 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 PPP2R1BP30154 601 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 IDUAP35475 653 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 MC3RP41968 323 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 OR3A3P47888 321 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 CRISP1P54107 249 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 CDC42P60953 191 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 OLR1P78380 273 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 HOXC5Q00444 222 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 TIGD6Q17RP2 521 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 PRSS42Q7Z5A4 293 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 KMT5CQ86Y97 462 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 SIMC1Q8NDZ2 872 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 OR9A2Q8NGT5 310 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 SLC7A13Q8TCU3 470 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 YIPF6Q96EC8 236 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 SRMSQ9H3Y6 488 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 A4GALTQ9NPC4 353 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 ASB4Q9Y574 426 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 SEC16AO15027 2179 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 A8MV72 311 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 EFCAB9A8MZ26 197 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 DNAJB6O75190 326 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 OR7A10O76100 309 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 PVRP15151 417 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 GADD45AP24522 165 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 KCNJ5P48544 419 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 MED22Q15528 200 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 DEFB134Q4QY38 66 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 TMEM151BQ8IW70 566 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 FAM109AQ8N4B1 249 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 B3GNT7Q8NFL0 401 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 OR2L5Q8NG80 312 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 OR6T1Q8NGN1 323 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 GRPEL2Q8TAA5 225 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 MYDGFQ969H8 173 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 NT5DC2Q9H857 520 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 BRD7Q9NPI1 651 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 FANCFQ9NPI8 374 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 USP34Q70CQ2 3546 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 FAM25AB3EWG3 89 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 FAM25CB3EWG5 89 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 FAM25GB3EWG6 89 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 M0R082 166 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 AIREO43918 545 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 UGT2B17O75795 530 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 PDE9AO76083 593 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 CDK1P06493 297 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 ADRA2AP08913 450 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 DRD2P14416 443 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 ACVR2AP27037 513 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 LIMS1P48059 325 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 HMGA2P52926 109 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 GALK2Q01415 458 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 PRRT3Q5FWE3 981 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 KRT73Q86Y46 540 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 TTLQ8NG68 377 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 SUN3Q8TAQ9 357 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 ZNF675Q8TD23 568 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 HMGB4Q8WW32 186 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 ZNF354BQ96LW1 612 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 OR5M11Q96RB7 305 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 FNDC11Q9BVV2 318 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 ITPAQ9BY32 194 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 UCK2Q9BZX2 261 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 EPHA6Q9UF33 1036 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 ADAM29Q9UKF5 820 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 A6NCN8 305 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 A8MUA0 341 aa6.54□□□□□ -1.36
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