RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486840.1

CCZ1B-211, Transcript of CCZ1 homolog B, vacuolar protein trafficking and biogenesis associated, humanhuman

TSL 2

Gene CCZ1B, Length 545 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCZ1B-211ENST00000486840 HOXD1Q9GZZ0 328 aa24.39■■□□□ 1.49
CCZ1B-211ENST00000486840 UBQLN4Q9NRR5 601 aa24.39■■□□□ 1.49
CCZ1B-211ENST00000486840 GIN1Q9NXP7 522 aa24.39■■□□□ 1.49
CCZ1B-211ENST00000486840 MED11Q9P086 117 aa24.39■■□□□ 1.49
CCZ1B-211ENST00000486840 FAM215AQ9Y5M1 114 aa24.39■■□□□ 1.49
CCZ1B-211ENST00000486840 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa24.38■■□□□ 1.49
CCZ1B-211ENST00000486840 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
CCZ1B-211ENST00000486840 EPPINO95925 133 aa24.38■■□□□ 1.49
CCZ1B-211ENST00000486840 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
CCZ1B-211ENST00000486840 GAS1P54826 345 aa24.38■■□□□ 1.49
CCZ1B-211ENST00000486840 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP24.38■■□□□ 1.49
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CCZ1B-211ENST00000486840 OGFOD2Q6N063 350 aa24.38■■□□□ 1.49
CCZ1B-211ENST00000486840 OR5AK3PQ8NH89 298 aa24.38■■□□□ 1.49
CCZ1B-211ENST00000486840 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
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CCZ1B-211ENST00000486840 HBA1P69905 142 aa24.37■■□□□ 1.49
CCZ1B-211ENST00000486840 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
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CCZ1B-211ENST00000486840 OR2M3Q8NG83 312 aa24.37■■□□□ 1.49
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CCZ1B-211ENST00000486840 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
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CCZ1B-211ENST00000486840 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa24.36■■□□□ 1.49
CCZ1B-211ENST00000486840 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
CCZ1B-211ENST00000486840 E9PBE3 544 aa24.36■■□□□ 1.49
CCZ1B-211ENST00000486840 LINC01387J3KSC0 135 aa24.36■■□□□ 1.49
CCZ1B-211ENST00000486840 DVL2O14641 736 aa24.36■■□□□ 1.49
CCZ1B-211ENST00000486840 TBXA2RP21731 343 aa24.36■■□□□ 1.49
CCZ1B-211ENST00000486840 MATN1P21941 496 aa24.36■■□□□ 1.49
CCZ1B-211ENST00000486840 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
CCZ1B-211ENST00000486840 TRIML2Q8N7C3 387 aa24.36■■□□□ 1.49
CCZ1B-211ENST00000486840 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
CCZ1B-211ENST00000486840 NUDT8Q8WV74 236 aa24.36■■□□□ 1.49
CCZ1B-211ENST00000486840 PIGQQ9BRB3 760 aa24.36■■□□□ 1.49
CCZ1B-211ENST00000486840 VIPAS39Q9H9C1 493 aa24.36■■□□□ 1.49
CCZ1B-211ENST00000486840 CALHM2Q9HA72 323 aa24.36■■□□□ 1.49
CCZ1B-211ENST00000486840 EXD2Q9NVH0 621 aa24.36■■□□□ 1.49
CCZ1B-211ENST00000486840 PCNX1Q96RV3 2341 aa24.36■■□□□ 1.49
CCZ1B-211ENST00000486840 A0A0G2JNJ9 132 aa24.35■■□□□ 1.49
CCZ1B-211ENST00000486840 GMFGO60234 142 aa24.35■■□□□ 1.49
CCZ1B-211ENST00000486840 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
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CCZ1B-211ENST00000486840 IGKV1D-16P01601 117 aa24.35■■□□□ 1.49
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CCZ1B-211ENST00000486840 IDO1P14902 403 aa24.35■■□□□ 1.49
CCZ1B-211ENST00000486840 CPN1P15169 458 aa24.35■■□□□ 1.49
CCZ1B-211ENST00000486840 MSX1P28360 303 aa24.35■■□□□ 1.49
CCZ1B-211ENST00000486840 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
CCZ1B-211ENST00000486840 OCRLQ01968 901 aa24.35■■□□□ 1.49
CCZ1B-211ENST00000486840 LRRC74AQ0VAA2 488 aa24.35■■□□□ 1.49
CCZ1B-211ENST00000486840 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa24.35■■□□□ 1.49
CCZ1B-211ENST00000486840 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa24.35■■□□□ 1.49
CCZ1B-211ENST00000486840 CCNJQ5T5M9 372 aa24.35■■□□□ 1.49
CCZ1B-211ENST00000486840 ATAD3BQ5T9A4 648 aa24.35■■□□□ 1.49
CCZ1B-211ENST00000486840 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa24.35■■□□□ 1.49
CCZ1B-211ENST00000486840 C6orf120Q7Z4R8 191 aa24.35■■□□□ 1.49
CCZ1B-211ENST00000486840 CLECL1Q8IZS7 167 aa24.35■■□□□ 1.49
CCZ1B-211ENST00000486840 MEIOBQ8N635 442 aa24.35■■□□□ 1.49
CCZ1B-211ENST00000486840 ZPLD1Q8TCW7 415 aa24.35■■□□□ 1.49
CCZ1B-211ENST00000486840 SLC35G5Q96KT7 338 aa24.35■■□□□ 1.49
CCZ1B-211ENST00000486840 UCK2Q9BZX2 261 aa24.35■■□□□ 1.49
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CCZ1B-211ENST00000486840 Q9UFV3 132 aa24.35■■□□□ 1.49
CCZ1B-211ENST00000486840 NKX2-6A6NCS4 301 aa24.34■■□□□ 1.49
CCZ1B-211ENST00000486840 ALG1L2C9J202 215 aa24.34■■□□□ 1.49
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CCZ1B-211ENST00000486840 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
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CCZ1B-211ENST00000486840 TIMP3P35625 211 aa24.34■■□□□ 1.49
CCZ1B-211ENST00000486840 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
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CCZ1B-211ENST00000486840 DCST2Q5T1A1 773 aa24.34■■□□□ 1.49
CCZ1B-211ENST00000486840 ANKRD46Q86W74 232 aa24.34■■□□□ 1.49
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CCZ1B-211ENST00000486840 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
CCZ1B-211ENST00000486840 OR4C3Q8NH37 302 aa24.34■■□□□ 1.49
CCZ1B-211ENST00000486840 FAM110BQ8TC76 370 aa24.34■■□□□ 1.49
CCZ1B-211ENST00000486840 SLC24A3Q9HC58 644 aa24.34■■□□□ 1.49
CCZ1B-211ENST00000486840 CD8B2A6NJW9 211 aa24.33■■□□□ 1.49
CCZ1B-211ENST00000486840 AK1P00568 194 aa24.33■■□□□ 1.49
CCZ1B-211ENST00000486840 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
CCZ1B-211ENST00000486840 CDSNQ15517 529 aa24.33■■□□□ 1.49
CCZ1B-211ENST00000486840 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
CCZ1B-211ENST00000486840 FLYWCH1Q4VC44 716 aa24.33■■□□□ 1.49
CCZ1B-211ENST00000486840 SPANXN4Q5MJ08 99 aa24.33■■□□□ 1.49
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