RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484880.1

SERBP1-206, Transcript of SERPINE1 mRNA binding protein 1, human

TSL 2

Gene SERBP1, Length 628 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SERBP1-206	ENST00000484880	RBMXL2	O75526	392 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SERBP1-206	ENST00000484880	C1QL1	O75973	258 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SERBP1-206	ENST00000484880	KRT33A	O76009	404 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SERBP1-206	ENST00000484880	NDUFB8	O95169	186 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SERBP1-206	ENST00000484880	CA1	P00915	261 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SERBP1-206	ENST00000484880	SERPINE2	P07093	398 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SERBP1-206	ENST00000484880	HSMCR30	P0CW71	290 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SERBP1-206	ENST00000484880	NEFH	P12036	1026 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SERBP1-206	ENST00000484880	HLA-DOB	P13765	273 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SERBP1-206	ENST00000484880	STOM	P27105	288 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SERBP1-206	ENST00000484880	SLC1A4	P43007	532 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SERBP1-206	ENST00000484880	FHIT	P49789	147 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SERBP1-206	ENST00000484880	ACLY	P53396	1101 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SERBP1-206	ENST00000484880	OGDH	Q02218	1023 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SERBP1-206	ENST00000484880	CCDC173	Q0VFZ6	552 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SERBP1-206	ENST00000484880	ATXN7L3	Q14CW9	347 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SERBP1-206	ENST00000484880	ETFDH	Q16134	617 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SERBP1-206	ENST00000484880	KNOP1	Q1ED39	458 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SERBP1-206	ENST00000484880	TMEM52B	Q4KMG9	183 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SERBP1-206	ENST00000484880	HSP90AA4P	Q58FG1	418 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SERBP1-206	ENST00000484880	TRNP1	Q6NT89	227 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SERBP1-206	ENST00000484880	ACSM5	Q6NUN0	579 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SERBP1-206	ENST00000484880	BHLHB9	Q6PI77	547 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SERBP1-206	ENST00000484880	PAQR6	Q6TCH4	344 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SERBP1-206	ENST00000484880	GCNT7	Q6ZNI0	430 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SERBP1-206	ENST00000484880	C19orf35	Q6ZS72	473 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SERBP1-206	ENST00000484880	NDUFAF7	Q7L592	441 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SERBP1-206	ENST00000484880	TRIM69	Q86WT6	500 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SERBP1-206	ENST00000484880	GPC2	Q8N158	579 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SERBP1-206	ENST00000484880	PGBD5	Q8N414	524 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SERBP1-206	ENST00000484880	CCDC185	Q8N715	623 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SERBP1-206	ENST00000484880		Q8N9G6	341 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SERBP1-206	ENST00000484880	TRPV1	Q8NER1	839 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SERBP1-206	ENST00000484880	OR2T12	Q8NG77	320 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SERBP1-206	ENST00000484880	OR4F17	Q8NGA8	305 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SERBP1-206	ENST00000484880	OR13C9	Q8NGT0	318 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SERBP1-206	ENST00000484880	OR4F5	Q8NH21	305 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SERBP1-206	ENST00000484880	ANGPTL6	Q8NI99	470 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SERBP1-206	ENST00000484880	CCDC12	Q8WUD4	166 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SERBP1-206	ENST00000484880	BAD	Q92934	168 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SERBP1-206	ENST00000484880	ART5	Q96L15	291 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SERBP1-206	ENST00000484880	TRNT1	Q96Q11	434 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SERBP1-206	ENST00000484880	OR4F4	Q96R69	305 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SERBP1-206	ENST00000484880	PRRG3	Q9BZD7	231 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SERBP1-206	ENST00000484880	GAL3ST2	Q9H3Q3	398 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SERBP1-206	ENST00000484880	FNDC4	Q9H6D8	234 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SERBP1-206	ENST00000484880	PXMP2	Q9NR77	195 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SERBP1-206	ENST00000484880	ZDHHC18	Q9NUE0	388 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SERBP1-206	ENST00000484880	STOX2	Q9P2F5	926 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SERBP1-206	ENST00000484880	PURG	Q9UJV8	347 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SERBP1-206	ENST00000484880	IKZF2	Q9UKS7	526 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SERBP1-206	ENST00000484880		A0A087WZ39	114 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SERBP1-206	ENST00000484880	SNURFL	B1AK76	121 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SERBP1-206	ENST00000484880	LAT	O43561	262 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SERBP1-206	ENST00000484880	RAMP3	O60896	148 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SERBP1-206	ENST00000484880	STX11	O75558	287 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SERBP1-206	ENST00000484880	BCAR3	O75815	825 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SERBP1-206	ENST00000484880	OR2J3	O76001	311 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SERBP1-206	ENST00000484880	DIRAS1	O95057	198 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SERBP1-206	ENST00000484880	F10	P00742	488 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SERBP1-206	ENST00000484880	ALOX5	P09917	674 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SERBP1-206	ENST00000484880	FAM157C	P0CG43	387 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SERBP1-206	ENST00000484880	XRCC1	P18887	633 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SERBP1-206	ENST00000484880	EFNA1	P20827	205 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SERBP1-206	ENST00000484880	BDKRB1	P46663	353 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SERBP1-206	ENST00000484880	PGF	P49763	221 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SERBP1-206	ENST00000484880	SLC26A2	P50443	739 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SERBP1-206	ENST00000484880	ELL	P55199	621 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SERBP1-206	ENST00000484880	MYL6	P60660	151 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SERBP1-206	ENST00000484880	RPL27	P61353	136 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SERBP1-206	ENST00000484880	ITPK1	Q13572	414 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SERBP1-206	ENST00000484880	STK38	Q15208	465 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SERBP1-206	ENST00000484880	FNBP1L	Q5T0N5	605 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SERBP1-206	ENST00000484880	GPR157	Q5UAW9	335 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SERBP1-206	ENST00000484880	OTUD1	Q5VV17	481 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SERBP1-206	ENST00000484880	TWF2	Q6IBS0	349 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SERBP1-206	ENST00000484880	CCDC137	Q6PK04	289 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SERBP1-206	ENST00000484880		Q71RC1	249 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SERBP1-206	ENST00000484880	GPR142	Q7Z601	462 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SERBP1-206	ENST00000484880	PLD3	Q8IV08	490 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SERBP1-206	ENST00000484880	ZNF843	Q8N446	348 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SERBP1-206	ENST00000484880	DNAJC22	Q8N4W6	341 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SERBP1-206	ENST00000484880	SMRP1	Q8NCR6	262 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SERBP1-206	ENST00000484880	DMBX1	Q8NFW5	382 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SERBP1-206	ENST00000484880	OR1B1	Q8NGR6	318 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SERBP1-206	ENST00000484880	C8orf46	Q8TAG6	207 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SERBP1-206	ENST00000484880	PNPLA2	Q96AD5	504 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SERBP1-206	ENST00000484880	SLC47A1	Q96FL8	570 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SERBP1-206	ENST00000484880	TIMD4	Q96H15	378 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SERBP1-206	ENST00000484880	ELMO2	Q96JJ3	720 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SERBP1-206	ENST00000484880	CYTH2	Q99418	400 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SERBP1-206	ENST00000484880	FMO2	Q99518	471 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SERBP1-206	ENST00000484880	TMEM246	Q9BRR3	403 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SERBP1-206	ENST00000484880	SLC25A33	Q9BSK2	321 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SERBP1-206	ENST00000484880	APOO	Q9BUR5	198 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SERBP1-206	ENST00000484880	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SERBP1-206	ENST00000484880	DUSP16	Q9BY84	665 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SERBP1-206	ENST00000484880	MFF	Q9GZY8	342 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SERBP1-206	ENST00000484880	NT5M	Q9NPB1	228 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SERBP1-206	ENST00000484880	FZD3	Q9NPG1	666 aa		4.96	□□□□□ -1.62

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