RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483164.5

GIGYF2-238, Transcript of GRB10 interacting GYF protein 2, human

TSL 5

Gene GIGYF2, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GIGYF2-238	ENST00000483164	GAL3ST2	Q9H3Q3	398 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	RHOJ	Q9H4E5	214 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	APOBEC3G	Q9HC16	384 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	NT5M	Q9NPB1	228 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	POLE4	Q9NR33	117 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	HIF1AN	Q9NWT6	349 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	MTCH1	Q9NZJ7	389 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	POLK	Q9UBT6	870 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	CTSF	Q9UBX1	484 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	C19orf25	Q9UFG5	118 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	OR2W1	Q9Y3N9	320 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	ZNF559-ZNF177	A0A0A6YYI6	481 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	LOC101059948	A0A1B0GTJ6	334 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	CCDC182	A6NF36	153 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	PDZK1P1	A8MUH7	402 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	NR5A2	O00482	541 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	MID1	O15344	667 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	KDELR3	O43731	214 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	PRKAB2	O43741	272 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	XPNPEP2	O43895	674 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	STX11	O75558	287 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	NXPH2	O95156	264 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	ANXA3	P12429	323 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	EFNA1	P20827	205 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	CDKN2A	P42771	156 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	P2RY1	P47900	373 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	FHIT	P49789	147 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	NDST2	P52849	883 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	ATP1B3	P54709	279 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	CLDN18	P56856	261 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	HERV-K104	P61576	105 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	EWSR1	Q01844	656 aa	Known RBP eCLIP	4.85	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	ASPH	Q12797	758 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	4.85	□□□□□ -1.63	3e-7	■■■■□ 24.1
GIGYF2-238	ENST00000483164	ZNF177	Q13360	481 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	C1orf61	Q13536	156 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	GK3P	Q14409	553 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	ANGPT1	Q15389	498 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	C3AR1	Q16581	482 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	BEX5	Q5H9J7	111 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	BEND3	Q5T5X7	828 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	SLX4IP	Q5VYV7	408 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	H3F3C	Q6NXT2	135 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	UNQ6126/PRO20091	Q6UXV3	157 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	RAD9B	Q6WBX8	426 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	UTS2B	Q765I0	119 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	PIWIL4	Q7Z3Z4	852 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	SERPINA9	Q86WD7	417 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	PLD3	Q8IV08	490 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	FBXL16	Q8N461	479 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	LMNTD1	Q8N9Z9	388 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	OR5T3	Q8NGG3	340 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	OR13C3	Q8NGS6	347 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	ZNF596	Q8TC21	504 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	GPR148	Q8TDV2	347 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	SMPDL3A	Q92484	453 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	TANK	Q92844	425 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	SLC38A2	Q96QD8	506 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	IL4I1	Q96RQ9	567 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	CYTH2	Q99418	400 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	IL12RB2	Q99665	862 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	SLC25A33	Q9BSK2	321 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	TEKT3	Q9BXF9	490 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	EGLN3	Q9H6Z9	239 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	GPN2	Q9H9Y4	310 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	PNO1	Q9NRX1	252 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	C2orf42	Q9NWW7	574 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	LYAR	Q9NX58	379 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	MRPL39	Q9NYK5	338 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	MBD2	Q9UBB5	411 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	CYTH4	Q9UIA0	394 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	PURG	Q9UJV8	347 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	STAP1	Q9ULZ2	295 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	STARD10	Q9Y365	291 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	TIMM10B	Q9Y5J6	103 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	GAK	O14976	1311 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	ARID2	Q68CP9	1835 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	EVPL	Q92817	2033 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	SYNJ2	O15056	1496 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	RSPH10B2	B2RC85	870 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	WWP2	O00308	870 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	TAPBP	O15533	448 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	CRTAP	O75718	401 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	ECD	O95905	644 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	SYF2	O95926	243 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	RSPH10B	P0C881	870 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	PRKAR1A	P10644	381 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	FGF5	P12034	268 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	MMP11	P24347	488 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	CDH5	P33151	784 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	HPCAL1	P37235	193 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	RPL13A	P40429	203 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	DUSP3	P51452	185 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	NOVA1	P51513	510 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	DNA2	P51530	1060 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	ACLY	P53396	1101 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GIGYF2-238	ENST00000483164	PLTP	P55058	493 aa		4.84	□□□□□ -1.63

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