RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481231.5

SMARCE1-210, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 695 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-210ENST00000481231 A0A096LNT2 108 aa8.44□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 SHISA8B8ZZ34 492 aa8.44□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 H3BML4 177 aa8.44□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 LINC01387J3KSC0 135 aa8.44□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 TMCC2O75069 709 aa8.44□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 COQ9O75208 318 aa8.44□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 ULK1O75385 1050 aa8.44□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 THBDP07204 575 aa8.44□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 SOD3P08294 240 aa8.44□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 TBXA2RP21731 343 aa8.44□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 CASQ1P31415 396 aa8.44□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP8.44□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 SLC6A8P48029 635 aa8.44□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 GANABQ14697 944 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 HEPACAMQ14CZ8 416 aa8.44□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 PON3Q15166 354 aa8.44□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 PRSS53Q2L4Q9 553 aa8.44□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa8.44□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa8.44□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 CYP27C1Q4G0S4 372 aa8.44□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 SPIN4Q56A73 249 aa8.44□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 TEX35Q5T0J7 233 aa8.44□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 GALNT18Q6P9A2 607 aa8.44□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 DNM1P46Q6ZS02 220 aa8.44□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 FAM214BQ7L5A3 538 aa8.44□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 MARCH3Q86UD3 253 aa8.44□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 RELL1Q8IUW5 271 aa8.44□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 METTL25Q8N6Q8 603 aa8.44□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 METTL6Q8TCB7 284 aa8.44□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 DCAKDQ8WVC6 231 aa8.44□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa8.44□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 C1orf159Q96HA4 380 aa8.44□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 TMEM237Q96Q45 408 aa8.44□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 BBS4Q96RK4 519 aa8.44□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 L2HGDHQ9H9P8 463 aa8.44□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 TAS2R9Q9NYW1 312 aa8.44□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 A0A087WV62 115 aa8.43□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 MYO1GB0I1T2 1018 aa8.43□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa8.43□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 OVOL3O00110 214 aa8.43□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 KLF4O43474 513 aa8.43□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 DLX3O60479 287 aa8.43□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 SUPT7LO94864 414 aa8.43□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 PSMG1O95456 288 aa8.43□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 JUNP05412 331 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 PGRP06401 933 aa8.43□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 FCGR2AP12318 317 aa8.43□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 DDCP20711 480 aa8.43□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 IGFBP5P24593 272 aa8.43□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 HMOX2P30519 316 aa8.43□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 MPIP34949 423 aa8.43□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP8.43□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 ETF1P62495 437 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 BTKQ06187 659 aa8.43□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 DECR1Q16698 335 aa8.43□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 TMEM44Q2T9K0 475 aa8.43□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 BEX5Q5H9J7 111 aa8.43□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF678Q5SXM1 525 aa8.43□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 LGSNQ5TDP6 509 aa8.43□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 C8orf74Q6P047 294 aa8.43□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 TMEM107Q6UX40 140 aa8.43□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 SYT10Q6XYQ8 523 aa8.43□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 GGNQ86UU5 652 aa8.43□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 CDC26Q8NHZ8 85 aa8.43□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 DUSP19Q8WTR2 217 aa8.43□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP8.43□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 KCNA7Q96RP8 456 aa8.43□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa8.43□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 PTGES2Q9H7Z7 377 aa8.43□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 SDHAF3Q9NRP4 125 aa8.43□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF180Q9UJW8 692 aa8.43□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 CLEC4AQ9UMR7 237 aa8.43□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 LIPT1Q9Y234 373 aa8.43□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 TIMM22Q9Y584 194 aa8.43□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 AP4B1Q9Y6B7 739 aa8.43□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 HEATR5AQ86XA9 2040 aa8.42□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 CADP27708 2225 aa8.42□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa8.42□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 A0A0G2JK05 382 aa8.42□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 UPK1AO00322 258 aa8.42□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 GMFGO60234 142 aa8.42□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 UTS2O95399 124 aa8.42□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 IL33O95760 270 aa8.42□□□□□ -1.06
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