RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480420.5

CTPS1-209, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 750 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-209ENST00000480420 PIGQQ9BRB3 760 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 MED18Q9BUE0 208 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 SFXN3Q9BWM7 321 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 KLHL4Q9C0H6 718 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 ACBD3Q9H3P7 528 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 TMEM185BQ9H7F4 350 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 PPCSQ9HAB8 311 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 GIN1Q9NXP7 522 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 KLHL28Q9NXS3 571 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 NDRG3Q9UGV2 375 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 PACSIN3Q9UKS6 424 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 CLEC4AQ9UMR7 237 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 HEATR5AQ86XA9 2040 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 A0A1W2PNV4 684 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 SERTM1A2A2V5 107 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 OR2M5A3KFT3 312 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 SH3D21A4FU49 640 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 TMEM114B3SHH9 223 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 NPIPA7E9PJI5 369 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 SCDO00767 359 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 EMC8O43402 210 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 FADS1O60427 444 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 SLITRK5O94991 958 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 HSPA4LO95757 839 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 IGKV1D-16P01601 117 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 NPIPA8P0DM63 369 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 ACP2P11117 423 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 BCKDHAP12694 445 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 CD99P14209 185 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 ATP6V1C1P21283 382 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 CHMP24386 653 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 MAPK1P28482 360 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 ASMTP46597 345 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 GAS1P54826 345 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 CTBP2P56545 445 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 CLDN20P56880 219 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 VSNL1P62760 191 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 PSPHP78330 225 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 PRR5P85299 388 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 SLC18A2Q05940 514 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 FAM27E3Q08E93 113 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 C17orf67Q0P5P2 114 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 CPTPQ5TA50 214 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 KANK2Q63ZY3 851 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 OR2A2Q6IF42 318 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 VWA1Q6PCB0 445 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 POMZP3Q6PJE2 187 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 Q6ZSR9 355 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 SH2D5Q6ZV89 423 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 TRABD2AQ86V40 505 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 TDRPQ86YL5 185 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 CNPY4Q8N129 248 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 CDRT4Q8N9R6 151 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 FNDC5Q8NAU1 212 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 SLC16A11Q8NCK7 471 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 FNDC9Q8TBE3 224 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 TCP10LQ8TDR4 215 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 NUDT8Q8WV74 236 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 CDS1Q92903 461 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 TUBGCP3Q96CW5 907 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 PPP3R2Q96LZ3 170 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 ZFP3Q96NJ6 502 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 MS4A4EQ96PG1 132 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 CCT7Q99832 543 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 G6PC3Q9BUM1 346 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 RTN4RQ9BZR6 473 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 PIGMQ9H3S5 423 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 TUBB1Q9H4B7 451 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 SIRT5Q9NXA8 310 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 TAS2R7Q9NYW3 318 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 CLCF1Q9UBD9 225 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 STOML1Q9UBI4 398 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 ABCG2Q9UNQ0 655 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 DNHD1Q96M86 4753 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 A0A1W2PRB8 838 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 B4DXG7 233 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms