RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471880.5

SSR4-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, human

TSL 5

Gene SSR4, Length 785 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSR4-208	ENST00000471880	SCD	O00767	359 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	HDAC3	O15379	428 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	NDUFB5	O43674	189 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	FADS1	O60427	444 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	KCNK2	O95069	426 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	IL2RA	P01589	272 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	KRT16	P08779	473 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	PRF1	P14222	555 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	EPHA3	P29320	983 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	ADH7	P40394	386 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	KIR3DL1	P43629	444 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	RNF144A	P50876	292 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	DGKQ	P52824	942 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	DSCR4	P56555	118 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	AGBL2	Q5U5Z8	902 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	PPP4R4	Q6NUP7	873 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	ZCCHC12	Q6PEW1	402 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	CHMP1B	Q7LBR1	199 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	WDR75	Q8IWA0	830 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	RIMKLA	Q8IXN7	391 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	CLEC4F	Q8N1N0	589 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF614	Q8N883	585 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	VPS37A	Q8NEZ2	397 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	LILRB4	Q8NHJ6	448 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	WDYHV1	Q96HA8	205 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	SH3YL1	Q96HL8	342 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	MARK4	Q96L34	752 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	G6PC3	Q9BUM1	346 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	ACTRT3	Q9BYD9	372 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	ASIC5	Q9NY37	505 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	CREBBP	Q92793	2442 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	DCHS2	Q6V1P9	2916 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	ADGRG4	Q8IZF6	3080 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	NPIPA5	A0A0B4J1W7	369 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	KDM4E	B2RXH2	506 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880		C9JVG2	144 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	NPIPA7	E9PJI5	369 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880		H3BML4	177 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	SDHD	O14521	159 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	SEC14L5	O43304	696 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	OXSR1	O95747	527 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	NPIPA8	P0DM63	369 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	POU3F2	P20265	443 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	BMP5	P22003	454 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	S100A3	P33764	101 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	GAS1	P54826	345 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	CASP9	P55211	416 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	RPS26	P62854	115 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	HBA1	P69905	142 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	C17orf67	Q0P5P2	114 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	RIPPLY2	Q5TAB7	128 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	CDC73	Q6P1J9	531 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	BHLHB9	Q6PI77	547 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	HDX	Q7Z353	690 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	ZAR1	Q86SH2	424 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	LACC1	Q8IV20	430 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	TNIP2	Q8NFZ5	429 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	OR2M3	Q8NG83	312 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	RAB3IL1	Q8TBN0	382 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	SFXN5	Q8TD22	340 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	MOAP1	Q96BY2	351 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	SLC35G5	Q96KT7	338 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	DOCK7	Q96N67	2140 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	ZBTB18	Q99592	522 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	BTBD2	Q9BX70	525 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	RTN4R	Q9BZR6	473 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	PRDM14	Q9GZV8	571 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	FBXO34	Q9NWN3	711 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	NTM	Q9P121	344 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	HAO1	Q9UJM8	370 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	VDAC3	Q9Y277	283 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	PCDHGB3	Q9Y5G1	929 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	HSPB2	A8KAH6	182 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	SLCO1B7	G3V0H7	640 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	DIAPH2	O60879	1101 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	SNN	O75324	88 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	NUDT14	O95848	222 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	CHI3L1	P36222	383 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	AGFG1	P52594	562 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	CLNS1A	P54105	237 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	SLC18A1	P54219	525 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	HSPB2	Q16082	182 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	FAM174B	Q3ZCQ3	159 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	NHSL2	Q5HYW2	709 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	SPANXN4	Q5MJ08	99 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	DCST2	Q5T1A1	773 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	ANXA8L1	Q5VT79	327 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	PLXDC2	Q6UX71	529 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	P4HA3	Q7Z4N8	544 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	GDF7	Q7Z4P5	450 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	OR5D16	Q8NGK9	328 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	OR4C3	Q8NH37	302 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	LRRC8C	Q8TDW0	803 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF75CP	Q92670	426 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	NTNG2	Q96CW9	530 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	ATP6V1G3	Q96LB4	118 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	STAC	Q99469	402 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	TUBA1C	Q9BQE3	449 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	PIGU	Q9H490	435 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	POLQ	O75417	2590 aa		13.42	□□□□□ -0.26

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