RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 TFF3Q07654 80 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 STX5Q13190 355 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 ART3Q13508 389 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 EFR3AQ14156 821 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 TOMM20Q15388 145 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP6.36□□□□□ -1.393e-6■■■■■ 26.9
RABGEF1-206ENST00000461017 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP6.36□□□□□ -1.39
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RABGEF1-206ENST00000461017 CDC73Q6P1J9 531 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 POMZP3Q6PJE2 187 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 PAOXQ6QHF9 649 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 RPTNQ6XPR3 784 aa6.36□□□□□ -1.39
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RABGEF1-206ENST00000461017 SZRD1Q7Z422 152 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 C6orf120Q7Z4R8 191 aa6.36□□□□□ -1.39
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RABGEF1-206ENST00000461017 CEP70Q8NHQ1 597 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 ZFP28Q8NHY6 868 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 GPR151Q8TDV0 419 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 DUSP19Q8WTR2 217 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
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RABGEF1-206ENST00000461017 OR7D2Q96RA2 312 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 EBF4Q9BQW3 602 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 INPP5KQ9BT40 448 aa6.36□□□□□ -1.39
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RABGEF1-206ENST00000461017 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 EXO5Q9H790 373 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 C3orf14Q9HBI5 128 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 Q9N2J8 555 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 GIN1Q9NXP7 522 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa6.36□□□□□ -1.39
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RABGEF1-206ENST00000461017 Q9UFV3 132 aa6.36□□□□□ -1.39
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RABGEF1-206ENST00000461017 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 CSMD2Q7Z408 3487 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa6.35□□□□□ -1.39
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RABGEF1-206ENST00000461017 CFLARO15519 480 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 CBR3O75828 277 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 ANGPTL1O95841 491 aa6.35□□□□□ -1.39
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RABGEF1-206ENST00000461017 MATN1P21941 496 aa6.35□□□□□ -1.39
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RABGEF1-206ENST00000461017 RPP38P78345 283 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
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RABGEF1-206ENST00000461017 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 TP53BP2Q13625 1128 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 CD226Q15762 336 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 DECR1Q16698 335 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 NDUFAF6Q330K2 333 aa6.35□□□□□ -1.39
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RABGEF1-206ENST00000461017 NHSL2Q5HYW2 709 aa6.35□□□□□ -1.39
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RABGEF1-206ENST00000461017 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 XKRXQ6PP77 449 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 EPGNQ6UW88 154 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 ARSKQ6UWY0 536 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 C9orf106Q8NAJ2 232 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 TNIP2Q8NFZ5 429 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 OR4A15Q8NGL6 344 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 CKAP2Q8WWK9 683 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 TESCQ96BS2 214 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 SARAFQ96BY9 339 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 ZG16BQ96DA0 208 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 MS4A4EQ96PG1 132 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 SDF2Q99470 211 aa6.35□□□□□ -1.39
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