RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460160.5

HOXB3-202, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,525 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-202ENST00000460160 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 NATD1Q8N6N6 113 aa21.46■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 DUSP19Q8WTR2 217 aa21.46■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 C14orf79Q96F83 325 aa21.46■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa21.46■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 CXorf36Q9H7Y0 433 aa21.46■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 AKAP9Q99996 3911 aa21.46■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa21.46■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 TMEM120BA0PK00 339 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 ERLIN1O75477 346 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 C6orf47O95873 294 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 IL2RAP01589 272 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 ALOX5P09917 674 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 CHMP24386 653 aa21.45■■□□□ 1.02
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HOXB3-202ENST00000460160 CLDN18P56856 261 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 SRYQ05066 204 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 RCAN2Q14206 197 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 HHATQ5VTY9 493 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 FIGNL1Q6PIW4 674 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 CAMKMTQ7Z624 323 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 ZAR1Q86SH2 424 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
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HOXB3-202ENST00000460160 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 FBXO34Q9NWN3 711 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 H0Y3Z8 333 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 ANGPTL1O95841 491 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF708P17019 499 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 BMP5P22003 454 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 PRIM2P49643 509 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF136P52737 540 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP21.45■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 KIRREL3Q8IZU9 778 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 COX18Q8N8Q8 333 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 C9orf106Q8NAJ2 232 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 OR4C3Q8NH37 302 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 JADE3Q92613 823 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 DUSP26Q9BV47 211 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 PNPOQ9NVS9 261 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa21.44■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 DVL2O14641 736 aa21.44■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 NGFRP08138 427 aa21.44■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 CCT3P49368 545 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 DLX5P56178 289 aa21.44■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 GANABQ14697 944 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
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HOXB3-202ENST00000460160 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa21.44■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 LURAP1Q96LR2 239 aa21.44■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 NUF2Q9BZD4 464 aa21.44■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 NEUROD4Q9HD90 331 aa21.44■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 DUSP22Q9NRW4 184 aa21.44■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 GPATCH2Q9NW75 528 aa21.44■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 ALG1L2C9J202 215 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 HK1P19367 917 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 TBXA2RP21731 343 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 C17orf67Q0P5P2 114 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 TP53BP2Q13625 1128 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 CCNJQ5T5M9 372 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 OR56A1Q8NGH5 318 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 SFXN5Q8TD22 340 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 TLCD1Q96CP7 247 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 UCN2Q96RP3 112 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 STACQ99469 402 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 BTBD2Q9BX70 525 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 PTGES2Q9H7Z7 377 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 CLCA1A8K7I4 914 aa21.42■■□□□ 1.02
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HOXB3-202ENST00000460160 HBA1P69905 142 aa21.42■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 TLE4Q04727 773 aa21.42■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 PGS1Q32NB8 556 aa21.42■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 SPDYE7PQ495Y7 208 aa21.42■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 RAET1LQ5VY80 246 aa21.42■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 PLXDC2Q6UX71 529 aa21.42■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 MGARPQ8TDB4 240 aa21.42■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 CDS1Q92903 461 aa21.42■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 ACTRT3Q9BYD9 372 aa21.42■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 PIGUQ9H490 435 aa21.42■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 MEAF6Q9HAF1 191 aa21.42■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 TMBIM4Q9HC24 238 aa21.42■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 GIN1Q9NXP7 522 aa21.42■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 CLCF1Q9UBD9 225 aa21.42■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 ABCA4P78363 2273 aa21.42■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 LCN1P31025 176 aa21.41■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 SLC18A1P54219 525 aa21.41■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 KRTAP10-9P60411 292 aa21.41■■□□□ 1.02
HOXB3-202ENST00000460160 BCL2A1Q16548 175 aa21.41■■□□□ 1.02
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