RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
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PRAME-210ENST00000442481 GLIPR2Q9H4G4 154 aa10.62□□□□□ -0.71
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PRAME-210ENST00000442481 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
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PRAME-210ENST00000442481 ZFP28Q8NHY6 868 aa10.61□□□□□ -0.71
PRAME-210ENST00000442481 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP10.61□□□□□ -0.71
PRAME-210ENST00000442481 STON2Q8WXE9 905 aa10.61□□□□□ -0.71
PRAME-210ENST00000442481 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
PRAME-210ENST00000442481 CTHRC1Q96CG8 243 aa10.61□□□□□ -0.71
PRAME-210ENST00000442481 OMA1Q96E52 524 aa10.61□□□□□ -0.71
PRAME-210ENST00000442481 COX4I2Q96KJ9 171 aa10.61□□□□□ -0.71
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PRAME-210ENST00000442481 FOLH1BQ9HBA9 442 aa10.61□□□□□ -0.71
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PRAME-210ENST00000442481 ZNF226Q9NYT6 803 aa10.61□□□□□ -0.71
PRAME-210ENST00000442481 JKAMPQ9P055 326 aa10.61□□□□□ -0.71
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PRAME-210ENST00000442481 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
PRAME-210ENST00000442481 TRIM33Q9UPN9 1127 aa10.61□□□□□ -0.71
PRAME-210ENST00000442481 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
PRAME-210ENST00000442481 C15orf41Q9Y2V0 281 aa10.61□□□□□ -0.71
PRAME-210ENST00000442481 OR10H1Q9Y4A9 318 aa10.61□□□□□ -0.71
PRAME-210ENST00000442481 TLN2Q9Y4G6 2542 aa10.61□□□□□ -0.71
PRAME-210ENST00000442481 NINQ8N4C6 2090 aa10.61□□□□□ -0.71
PRAME-210ENST00000442481 COL6A5A8TX70 2615 aa10.6□□□□□ -0.71
PRAME-210ENST00000442481 FN1P02751 2386 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
PRAME-210ENST00000442481 FRG2CA6NGY1 282 aa10.6□□□□□ -0.71
PRAME-210ENST00000442481 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
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