RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441222.7

USP46-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 46, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP46, Length 7,954 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-201ENST00000441222 SVILO95425 2214 aa6.33□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa6.33□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 BTBD17A6NE02 478 aa6.33□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 F6UZH7 168 aa6.33□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 SNAP29O95721 258 aa6.33□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 S1PR4O95977 384 aa6.33□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 TK1P04183 234 aa6.33□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 SLC2A5P22732 501 aa6.33□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 MLLT10P55197 1068 aa6.33□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 SCAPQ12770 1279 aa6.33□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 TCEAL1Q15170 157 aa6.33□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 MPEG1Q2M385 716 aa6.33□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 Q6ZVL8 140 aa6.33□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 OR4N4Q8N0Y3 316 aa6.33□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 ZNF516Q92618 1163 aa6.33□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 ENKD1Q9H0I2 346 aa6.33□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 SMCO4Q9NRQ5 59 aa6.33□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 EGFP01133 1207 aa6.33□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 HSD17B1P14061 328 aa6.33□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 HNF1BP35680 557 aa6.33□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 GPR4P46093 362 aa6.33□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 IL13RA1P78552 427 aa6.33□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 KCNA7Q96RP8 456 aa6.33□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 ZNF286AQ9HBT8 521 aa6.33□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 POT1Q9NUX5 634 aa6.33□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 MYOTQ9UBF9 498 aa6.33□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa6.33□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 ARID1AO14497 2285 aa6.33□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 PEAK1Q9H792 1746 aa6.33□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa6.33□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 SMIM30A4D0T7 59 aa6.33□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 SLC35F4A4IF30 521 aa6.33□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 GOSR2O14653 212 aa6.33□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 LILRB3O75022 631 aa6.33□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 STSP08842 583 aa6.33□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 RAB40ALP0C0E4 278 aa6.33□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 ACRP10323 421 aa6.33□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 KEAP1Q14145 624 aa6.33□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 ENPP6Q6UWR7 440 aa6.33□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa6.33□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 GATSQ8NAP1 163 aa6.33□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa6.33□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 FRS2Q8WU20 508 aa6.33□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 RAB40AQ8WXH6 277 aa6.33□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 SNX18Q96RF0 628 aa6.33□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 ALG8Q9BVK2 526 aa6.33□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 CHRDQ9H2X0 955 aa6.33□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 OPA3Q9H6K4 179 aa6.33□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 RPS10P5Q9NQ39 176 aa6.33□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 SCN8AQ9UQD0 1980 aa6.33□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 ZNF254O75437 659 aa6.33□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 SNCGO76070 127 aa6.33□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 HTR3BO95264 441 aa6.33□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 DCNP07585 359 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 PCGF2P35227 344 aa6.33□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 CD79BP40259 229 aa6.33□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 AGTR2P50052 363 aa6.33□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 ELP2Q6IA86 826 aa6.33□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 MKXQ8IYA7 352 aa6.33□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 CDRT4Q8N9R6 151 aa6.33□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 OR13J1Q8NGT2 312 aa6.33□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 SGK3Q96BR1 496 aa6.33□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 SIGLEC10Q96LC7 697 aa6.33□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 TTTY10Q9BZA0 68 aa6.33□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 SIX2Q9NPC8 291 aa6.33□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 ASF1BQ9NVP2 202 aa6.33□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 AIG1Q9NVV5 245 aa6.33□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 ZNF225Q9UK10 706 aa6.33□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 TMEM59LQ9UK28 342 aa6.33□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa6.33□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 NUP98P52948 1817 aa6.33□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 A0A1W2PPK0 400 aa6.32□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 ANHXE9PGG2 379 aa6.32□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa6.32□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 MED6O75586 246 aa6.32□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 BEST1O76090 585 aa6.32□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 NTSR1P30989 418 aa6.32□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 RAB11AP62491 216 aa6.32□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa6.32□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 SLC6A19Q695T7 634 aa6.32□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 SLC5A8Q8N695 610 aa6.32□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 CLEC1AQ8NC01 280 aa6.32□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 ASB17Q8WXJ9 295 aa6.32□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 PELI2Q9HAT8 420 aa6.32□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 94.9 ms