RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437078.6

RABGEF1-210, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene RABGEF1, Length 4,319 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-210ENST00000437078 MVDP53602 400 aa12.71□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 IKBIPQ70UQ0 350 aa12.71□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa12.71□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 OR56A1Q8NGH5 318 aa12.71□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 OR2L8Q8NGY9 312 aa12.71□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 SLC37A2Q8TED4 501 aa12.71□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 TUBA1CQ9BQE3 449 aa12.71□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 AIFM2Q9BRQ8 373 aa12.71□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa12.71□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 SDK2Q58EX2 2172 aa12.7□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 A0A1B0GVT2 93 aa12.7□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 CDK1P06493 297 aa12.7□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 F3P13726 295 aa12.7□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 PRPH2P23942 346 aa12.7□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 FCARP24071 287 aa12.7□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 PKLRP30613 574 aa12.7□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 FOXL2P58012 376 aa12.7□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 CAMKVQ8NCB2 501 aa12.7□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 NCR1O76036 304 aa12.7□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 CTSBP07858 339 aa12.7□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 PRG2P13727 222 aa12.7□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 GABARAPL2P60520 117 aa12.7□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 BNC1Q01954 994 aa12.7□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 KCNAB1Q14722 419 aa12.7□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 LILRB4Q8NHJ6 448 aa12.7□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 RHOXF1Q8NHV9 184 aa12.7□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 ST8SIA2Q92186 375 aa12.7□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 TEX101Q9BY14 249 aa12.7□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 HDHD2Q9H0R4 259 aa12.7□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 SERHL2Q9H4I8 314 aa12.7□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 KLF15Q9UIH9 416 aa12.7□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa12.7□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 PLATP00750 562 aa12.7□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 SDHBP21912 280 aa12.7□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 FBXW4P57775 412 aa12.7□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF91Q05481 1191 aa12.7□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 ARHGAP19Q14CB8 494 aa12.7□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 FLYWCH1Q4VC44 716 aa12.7□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 ENTPD8Q5MY95 495 aa12.7□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 ZER1Q7Z7L7 766 aa12.7□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 APH1BQ8WW43 257 aa12.7□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa12.7□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa12.7□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa12.7□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa12.69□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 A8MVJ9 347 aa12.69□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 DRD2P14416 443 aa12.69□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 MAGEA2P43356 314 aa12.69□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 NFATC4Q14934 902 aa12.69□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 ALG11Q2TAA5 492 aa12.69□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 ABHD13Q7L211 337 aa12.69□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 CPOQ8IVL8 374 aa12.69□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 OR52E4Q8NGH9 312 aa12.69□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 TMEM80Q96HE8 168 aa12.69□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 COX14Q96I36 57 aa12.69□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 SLC6A18Q96N87 628 aa12.69□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 FOXN4Q96NZ1 517 aa12.69□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa12.69□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 MGAT4BQ9UQ53 548 aa12.69□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 LRRN3E7EW58 273 aa12.69□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 FAAHO00519 579 aa12.69□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 GRK5P34947 590 aa12.69□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 RGS6P49758 472 aa12.69□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 SLC27A4Q6P1M0 643 aa12.69□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP12.69□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 SUN3Q8TAQ9 357 aa12.69□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 RASSF5Q8WWW0 418 aa12.69□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 TANKQ92844 425 aa12.69□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 SLC22A18Q96BI1 424 aa12.69□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 ELP4Q96EB1 424 aa12.69□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 SAP130Q9H0E3 1048 aa12.69□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 LRRN3Q9H3W5 708 aa12.69□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP12.69□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 SEMA4GQ9NTN9 838 aa12.69□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 TMEM74BQ9NUR3 256 aa12.69□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa12.69□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 EVI2BP34910 448 aa12.69□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 ACVR1BP36896 505 aa12.69□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 HTR2BP41595 481 aa12.69□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 OR1D4P47884 311 aa12.69□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 KCNJ5P48544 419 aa12.69□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 ST3GAL3Q11203 375 aa12.69□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 CTF1Q16619 201 aa12.69□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 DUSP5Q16690 384 aa12.69□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 SWI5Q1ZZU3 235 aa12.69□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms