RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436638.5

ECHDC1-208, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene ECHDC1, Length 766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ECHDC1-208	ENST00000436638	BLACE	A4D250	179 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZSCAN5B	A6NJL1	495 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ECHDC1-208	ENST00000436638		H0Y8G0	127 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ECHDC1-208	ENST00000436638	GTPBP1	O00178	669 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
ECHDC1-208	ENST00000436638	TLX3	O43711	291 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
ECHDC1-208	ENST00000436638	GPRIN2	O60269	458 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ECHDC1-208	ENST00000436638	EDF1	O60869	148 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
ECHDC1-208	ENST00000436638	B4GALT2	O60909	372 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ECHDC1-208	ENST00000436638	ATP6AP2	O75787	350 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ECHDC1-208	ENST00000436638	ETHE1	O95571	254 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ECHDC1-208	ENST00000436638	ONECUT2	O95948	504 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ECHDC1-208	ENST00000436638	CSTA	P01040	98 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ECHDC1-208	ENST00000436638	GBA	P04062	536 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ECHDC1-208	ENST00000436638	FH	P07954	510 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ECHDC1-208	ENST00000436638	FAM58BP	P0C7Q3	252 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ECHDC1-208	ENST00000436638	C1QTNF9	P0C862	333 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ECHDC1-208	ENST00000436638	ITGA2	P17301	1181 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ECHDC1-208	ENST00000436638	LBP	P18428	481 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ECHDC1-208	ENST00000436638	PRPH2	P23942	346 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ECHDC1-208	ENST00000436638	PTPN4	P29074	926 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ECHDC1-208	ENST00000436638	PPP2R1B	P30154	601 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ECHDC1-208	ENST00000436638	TIA1	P31483	386 aa	Known RBP eCLIP	5.76	□□□□□ -1.49
ECHDC1-208	ENST00000436638	ARRB2	P32121	409 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ECHDC1-208	ENST00000436638	BSG	P35613	385 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ECHDC1-208	ENST00000436638	XCR1	P46094	333 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ECHDC1-208	ENST00000436638	GSTM5	P46439	218 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ECHDC1-208	ENST00000436638	PCYT1A	P49585	367 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ECHDC1-208	ENST00000436638	SLC7A2	P52569	658 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ECHDC1-208	ENST00000436638	EMP2	P54851	167 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ECHDC1-208	ENST00000436638	LIM2	P55344	173 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ECHDC1-208	ENST00000436638	RPL38	P63173	70 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
ECHDC1-208	ENST00000436638	GNGT1	P63211	74 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ECHDC1-208	ENST00000436638	MC1R	Q01726	317 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ECHDC1-208	ENST00000436638	FADD	Q13158	208 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ECHDC1-208	ENST00000436638	RUNX2	Q13950	521 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ECHDC1-208	ENST00000436638	CAPRIN1	Q14444	709 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
ECHDC1-208	ENST00000436638	RPS6KA2	Q15349	733 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ECHDC1-208	ENST00000436638	TGIF1	Q15583	401 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ECHDC1-208	ENST00000436638	SYT16	Q17RD7	645 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ECHDC1-208	ENST00000436638	UGT3A2	Q3SY77	523 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ECHDC1-208	ENST00000436638	SPATS1	Q496A3	300 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ECHDC1-208	ENST00000436638	VWA2	Q5GFL6	755 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ECHDC1-208	ENST00000436638	MRM1	Q6IN84	353 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
ECHDC1-208	ENST00000436638	GALNT18	Q6P9A2	607 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ECHDC1-208	ENST00000436638	SLC22A25	Q6T423	547 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ECHDC1-208	ENST00000436638	METAP1D	Q6UB28	335 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
ECHDC1-208	ENST00000436638	PET117	Q6UWS5	81 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ECHDC1-208	ENST00000436638	ATG14	Q6ZNE5	492 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ECHDC1-208	ENST00000436638	UTS2B	Q765I0	119 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ECHDC1-208	ENST00000436638	COMMD6	Q7Z4G1	85 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ECHDC1-208	ENST00000436638	GPR180	Q86V85	440 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ECHDC1-208	ENST00000436638	PDSS2	Q86YH6	399 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ECHDC1-208	ENST00000436638	RAB43	Q86YS6	212 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ECHDC1-208	ENST00000436638	TAGAP	Q8N103	731 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ECHDC1-208	ENST00000436638	CA13	Q8N1Q1	262 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ECHDC1-208	ENST00000436638	ARHGEF39	Q8N4T4	335 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ECHDC1-208	ENST00000436638	ENDOV	Q8N8Q3	282 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
ECHDC1-208	ENST00000436638	AMER3	Q8N944	861 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ECHDC1-208	ENST00000436638	FAM47B	Q8NA70	645 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ECHDC1-208	ENST00000436638	GLB1L3	Q8NCI6	653 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
ECHDC1-208	ENST00000436638	OR5T3	Q8NGG3	340 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ECHDC1-208	ENST00000436638	OR13C2	Q8NGS9	318 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ECHDC1-208	ENST00000436638	STT3B	Q8TCJ2	826 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ECHDC1-208	ENST00000436638	CAPSL	Q8WWF8	208 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZCCHC14	Q8WYQ9	949 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
ECHDC1-208	ENST00000436638	APIP	Q96GX9	242 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ECHDC1-208	ENST00000436638	ANKRD27	Q96NW4	1050 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ECHDC1-208	ENST00000436638	TRNT1	Q96Q11	434 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
ECHDC1-208	ENST00000436638	OR1F2P	Q96R84	312 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ECHDC1-208	ENST00000436638	SPRY4	Q9C004	299 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ECHDC1-208	ENST00000436638	TUBB1	Q9H4B7	451 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ECHDC1-208	ENST00000436638	DDX31	Q9H8H2	851 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
ECHDC1-208	ENST00000436638	SLCO1B3	Q9NPD5	702 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ECHDC1-208	ENST00000436638	PRTFDC1	Q9NRG1	225 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ECHDC1-208	ENST00000436638	DECR2	Q9NUI1	292 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ECHDC1-208	ENST00000436638	GIMAP4	Q9NUV9	329 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ECHDC1-208	ENST00000436638	LRFN1	Q9P244	771 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ECHDC1-208	ENST00000436638	CNOT11	Q9UKZ1	510 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
ECHDC1-208	ENST00000436638	DAPP1	Q9UN19	280 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ECHDC1-208	ENST00000436638	POLR3H	Q9Y535	204 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
ECHDC1-208	ENST00000436638	SNRNP200	O75643	2136 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
ECHDC1-208	ENST00000436638	KIF26B	Q2KJY2	2108 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ECHDC1-208	ENST00000436638		A0A0A6YYD5	115 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ECHDC1-208	ENST00000436638	C1orf226	A1L170	272 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ECHDC1-208	ENST00000436638	C5orf51	A6NDU8	294 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ECHDC1-208	ENST00000436638	ARGFX	A6NJG6	315 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ECHDC1-208	ENST00000436638	VSTM2B	A6NLU5	285 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZNF891	A8MT65	544 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
ECHDC1-208	ENST00000436638	NPIPB8	E9PQR5	432 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ECHDC1-208	ENST00000436638	PEX12	O00623	359 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ECHDC1-208	ENST00000436638	EED	O75530	441 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
ECHDC1-208	ENST00000436638	SCEL	O95171	688 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ECHDC1-208	ENST00000436638	SNAPIN	O95295	136 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ECHDC1-208	ENST00000436638	TBX6	O95947	436 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
ECHDC1-208	ENST00000436638	CYC1	P08574	325 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ECHDC1-208	ENST00000436638	ACAA1	P09110	424 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
ECHDC1-208	ENST00000436638	ANXA4	P09525	319 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
ECHDC1-208	ENST00000436638	NR2F6	P10588	404 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ECHDC1-208	ENST00000436638	LIF	P15018	202 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ECHDC1-208	ENST00000436638	PRKCA	P17252	672 aa		5.75	□□□□□ -1.49

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