RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435136.6

SH3BP2-202, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,318 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-202ENST00000435136 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP17.32■□□□□ 0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP17.32■□□□□ 0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 GINS1Q14691 196 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP17.32■□□□□ 0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 FGF11Q92914 225 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 NLGN3Q9NZ94 848 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 SELENONQ9NZV5 590 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 CDHR4A6H8M9 788 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 SNTNA6NMZ2 147 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 M0R129 80 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 FRS3O43559 492 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP17.32■□□□□ 0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 MAOBP27338 520 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 HSD17B7P56937 341 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 RHAGQ02094 409 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 GPR68Q15743 365 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 DGUOKQ16854 277 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 TMEM44Q2T9K0 475 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 SLC27A4Q6P1M0 643 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 OR52R1Q8NGF1 315 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 VMP1Q96GC9 406 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 GPA33Q99795 319 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 TEX12Q9BXU0 123 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP17.32■□□□□ 0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 TRAPPC13A5PLN9 417 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 M0R3G1 203 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP17.31■□□□□ 0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 TUBA1BP68363 451 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP17.31■□□□□ 0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 STX4Q12846 297 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 GRM7Q14831 915 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP17.31■□□□□ 0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 WDR45BQ5MNZ6 344 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 TUBA1AQ71U36 451 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 KIF18BQ86Y91 864 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 OSTF1Q92882 214 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 TMEM80Q96HE8 168 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 IL4I1Q96RQ9 567 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP17.31■□□□□ 0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 RHPN2P1A8MT19 583 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 MED26O95402 600 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 CTSBP07858 339 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP17.31■□□□□ 0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 GABRA3P34903 492 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 LIPAP38571 399 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 NBL1P41271 181 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 ENTPD1P49961 510 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 C21orf59P57076 290 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 SLC13A2Q13183 592 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 TCEANCQ8N8B7 351 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 PIK3R3Q92569 461 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 RIT1Q92963 219 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP17.31■□□□□ 0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 SLC38A2Q96QD8 506 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 FOLH1BQ9HBA9 442 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 CTPS2Q9NRF8 586 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 MED17Q9NVC6 651 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP17.3■□□□□ 0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 PRAMEF2O60811 474 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 PTHP01270 115 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 DBTP11182 482 aaKnown RBP17.3■□□□□ 0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 SERTAD2Q14140 314 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 MAPK14Q16539 360 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 DEFB133Q30KQ1 61 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 CCNJQ5T5M9 372 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP17.3■□□□□ 0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 OIT3Q8WWZ8 545 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 LGALS12Q96DT0 336 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 TVP23BQ9NYZ1 205 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 HCN3Q9P1Z3 774 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP17.3■□□□□ 0.366e-6■■□□□ 14.4
SH3BP2-202ENST00000435136 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP17.3■□□□□ 0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 KCNK2O95069 426 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 HOXA6P31267 233 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP17.3■□□□□ 0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP17.3■□□□□ 0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 ZNF91Q05481 1191 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 TMEM163Q8TC26 289 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 MVB12AQ96EY5 273 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 DGAT2Q96PD7 388 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 TGM7Q96PF1 710 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 SOHLH2Q9NX45 425 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 IL20Q9NYY1 176 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 SEMA5BQ9P283 1151 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 EFCAB9A8MZ26 197 aa17.29■□□□□ 0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 THY1P04216 161 aa17.29■□□□□ 0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP17.29■□□□□ 0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 EMDP50402 254 aa17.29■□□□□ 0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 PSG6Q00889 435 aa17.29■□□□□ 0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 OCA2Q04671 838 aa17.29■□□□□ 0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa17.29■□□□□ 0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 ZNF613Q6PF04 617 aa17.29■□□□□ 0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 C19orf48Q6RUI8 117 aa17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms