RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428892.1

APOBEC3C-202, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3C, humanhuman

TSL 3

Gene APOBEC3C, Length 1,056 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3C-202ENST00000428892 ATP6V1HQ9UI12 483 aa9.9□□□□□ -0.82
APOBEC3C-202ENST00000428892 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
APOBEC3C-202ENST00000428892 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
APOBEC3C-202ENST00000428892 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
APOBEC3C-202ENST00000428892 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa9.9□□□□□ -0.82
APOBEC3C-202ENST00000428892 DNHD1Q96M86 4753 aa9.9□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa9.89□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 FRG2CA6NGY1 282 aa9.89□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 H0YHG0 523 aa9.89□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 UPK1AO00322 258 aa9.89□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 SYT5O00445 386 aa9.89□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 ACOX3O15254 700 aa9.89□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 PDPK1O15530 556 aa9.89□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 AKAP10O43572 662 aa9.89□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 NME6O75414 186 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 LRATO95237 230 aa9.89□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 ATE1O95260 518 aa9.89□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 IL2RAP01589 272 aa9.89□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 CT45A8P0DMV1 189 aa9.89□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 CT45A9P0DMV2 189 aa9.89□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 PRPS2P11908 318 aa9.89□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 NAGAP17050 411 aa9.89□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 ABCD3P28288 659 aa9.89□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 MC3RP41968 323 aa9.89□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 IDH3AP50213 366 aa9.89□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP9.89□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 CORO7P57737 925 aa9.89□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 DCAF7P61962 342 aa9.89□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 BNIP1Q12981 228 aa9.89□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 RPS6KA2Q15349 733 aa9.89□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 CT45A2Q5DJT8 189 aa9.89□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 IL23RQ5VWK5 629 aa9.89□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 METTL21CQ5VZV1 264 aa9.89□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 TMEM198Q66K66 360 aa9.89□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 ALKBH2Q6NS38 261 aa9.89□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 NPSR1Q6W5P4 371 aa9.89□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP9.89□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 FNDC5Q8NAU1 212 aa9.89□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 TUBGCP3Q96CW5 907 aa9.89□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 ELP4Q96EB1 424 aa9.89□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 HSPBAP1Q96EW2 488 aa9.89□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 AKTIPQ9H8T0 292 aa9.89□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 MEAF6Q9HAF1 191 aa9.89□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 MRGBPQ9NV56 204 aa9.89□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 CNIH4Q9P003 139 aa9.89□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 NTMQ9P121 344 aa9.89□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 DOCK7Q96N67 2140 aa9.89□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 CFAP73A6NFT4 308 aa9.88□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 LRRC3CA6NJW4 275 aa9.88□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa9.88□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 LILRA1O75019 489 aa9.88□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 PPM1BO75688 479 aa9.88□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 HEXAP06865 529 aa9.88□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 G6PDP11413 515 aa9.88□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 NTSP30990 170 aa9.88□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 MAP3K8P41279 467 aa9.88□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 TMED10P49755 219 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 FBXW4P57775 412 aa9.88□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 PSG6Q00889 435 aa9.88□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 KRT72Q14CN4 511 aa9.88□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 MLC1Q15049 377 aa9.88□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP9.88□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 NNATQ16517 81 aa9.88□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 PRAMEF20Q5VT98 475 aa9.88□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa9.88□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 SLC22A10Q63ZE4 541 aa9.88□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 TMEM81Q6P7N7 255 aa9.88□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 EPGNQ6UW88 154 aa9.88□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 TMEM107Q6UX40 140 aa9.88□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 P3H2Q8IVL5 708 aa9.88□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 ULK2Q8IYT8 1036 aa9.88□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 PRR22Q8IZ63 422 aa9.88□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa9.88□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 SPPL2AQ8TCT8 520 aa9.88□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 RNF138Q8WVD3 245 aa9.88□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 STON2Q8WXE9 905 aa9.88□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 HGDQ93099 445 aa9.88□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 PPCDCQ96CD2 204 aa9.88□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 COQ8BQ96D53 544 aa9.88□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 NSL1Q96IY1 281 aa9.88□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 CCDC28BQ9BUN5 200 aa9.88□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 NUF2Q9BZD4 464 aa9.88□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 FOLH1BQ9HBA9 442 aa9.88□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 SPRR3Q9UBC9 169 aa9.88□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa9.87□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 CLCA1A8K7I4 914 aa9.87□□□□□ -0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 CAPN14A8MX76 684 aa9.87□□□□□ -0.83
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