RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409985.5

PMS1-205, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

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Gene PMS1, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-205ENST00000409985 SLC16A11Q8NCK7 471 aa22.17■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 FAM3CQ92520 227 aa22.17■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 WDR92Q96MX6 357 aa22.17■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 PIGUQ9H490 435 aa22.17■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 WNT16Q9UBV4 365 aa22.17■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 A0A087WV62 115 aa22.17■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 B3GALT2O43825 422 aa22.17■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 FCMRO60667 390 aa22.17■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 GLULP15104 373 aa22.17■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP22.17■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 SLC1A3P43003 542 aa22.17■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 BDH1Q02338 343 aa22.17■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 SCN1BQ07699 218 aa22.17■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 CCINQ13939 588 aa22.17■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 LTB4RQ15722 352 aa22.17■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 MANEAQ5SRI9 462 aa22.17■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa22.17■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 DDI2Q5TDH0 399 aa22.17■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 ZNF544Q6NX49 715 aa22.17■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 LAX1Q8IWV1 398 aa22.17■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 CAMKVQ8NCB2 501 aa22.17■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 OR1E3Q8WZA6 343 aa22.17■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 ASB6Q9NWX5 421 aa22.17■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 CNIH4Q9P003 139 aa22.17■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 DAPP1Q9UN19 280 aa22.17■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa22.17■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 SLC22A7Q9Y694 548 aa22.17■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 FMO6PO60774 539 aa22.16■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 AVPR1BP47901 424 aa22.16■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 FZD5Q13467 585 aa22.16■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 KCNJ8Q15842 424 aa22.16■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 C22orf42Q6IC83 251 aa22.16■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 FAM111BQ6SJ93 734 aa22.16■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 HMGN2P46Q86SG4 172 aa22.16■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 NKAIN4Q8IVV8 208 aa22.16■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 OR2T33Q8NG76 320 aa22.16■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 OR4Q3Q8NH05 313 aa22.16■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 FN3KQ9H479 309 aa22.16■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 CARD8Q9Y2G2 431 aa22.16■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 A6NCN8 305 aa22.15■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 SLC31A1O15431 190 aa22.15■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 SOX30O94993 753 aa22.15■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 AK1P00568 194 aa22.15■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 NDUFV2P19404 249 aa22.15■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 CFL1P23528 166 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 SEC13P55735 322 aa22.15■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 ASAH1Q13510 395 aa22.15■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 GPR50Q13585 617 aa22.15■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 ARMC4Q5T2S8 1044 aa22.15■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 ABHD13Q7L211 337 aa22.15■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 UBQLNLQ8IYU4 475 aa22.15■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 SIX5Q8N196 739 aa22.15■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa22.15■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 CDS1Q92903 461 aa22.15■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa22.15■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 SDF2Q99470 211 aa22.15■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 ZNF350Q9GZX5 532 aa22.15■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 C14orf119Q9NWQ9 140 aa22.15■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 PILRAQ9UKJ1 303 aa22.15■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 THY1P04216 161 aa22.15■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 DBIP07108 87 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 IL7P13232 177 aa22.15■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 GNSP15586 552 aa22.15■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 FHL5Q5TD97 284 aa22.15■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 OR2G6Q5TZ20 316 aa22.15■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 GID4Q8IVV7 300 aa22.15■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 KLHL36Q8N4N3 616 aa22.15■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 GATAD2BQ8WXI9 593 aa22.15■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 STACQ99469 402 aa22.15■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 CTRCQ99895 268 aa22.15■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 PRR14Q9BWN1 585 aa22.15■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 MIXL1Q9H2W2 232 aa22.15■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 DUSP22Q9NRW4 184 aa22.15■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 FBXL21Q9UKT6 434 aa22.15■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 POLHQ9Y253 713 aa22.15■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 TECTAO75443 2155 aa22.15■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 A0A1W2PQF6 199 aa22.14■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 FRS3O43559 492 aa22.14■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 HLA-DPB1P04440 258 aa22.14■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 TRAPPC2P0DI81 140 aa22.14■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 TRAPPC2BP0DI82 140 aa22.14■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 CPMP14384 443 aa22.14■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 RPS5P46782 204 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 ZNF136P52737 540 aa22.14■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 RPS25P62851 125 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 ZNF628Q5EBL2 1059 aa22.14■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa22.14■■□□□ 1.13
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