RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000407117.6

ANKRD54-203, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD54, Length 789 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-203ENST00000407117 CRHP06850 196 aa25.09■■□□□ 1.61
ANKRD54-203ENST00000407117 BPGMP07738 259 aa25.09■■□□□ 1.61
ANKRD54-203ENST00000407117 LCN1P31025 176 aa25.09■■□□□ 1.61
ANKRD54-203ENST00000407117 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
ANKRD54-203ENST00000407117 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP25.09■■□□□ 1.61
ANKRD54-203ENST00000407117 GRAMD1BQ3KR37 738 aa25.09■■□□□ 1.61
ANKRD54-203ENST00000407117 OR2A2Q6IF42 318 aa25.09■■□□□ 1.61
ANKRD54-203ENST00000407117 MFSD12Q6NUT3 480 aa25.09■■□□□ 1.61
ANKRD54-203ENST00000407117 NATD1Q8N6N6 113 aa25.09■■□□□ 1.61
ANKRD54-203ENST00000407117 OR6Y1Q8NGX8 325 aa25.09■■□□□ 1.61
ANKRD54-203ENST00000407117 ALG1L2C9J202 215 aa25.08■■□□□ 1.61
ANKRD54-203ENST00000407117 PEX11AO75192 247 aa25.08■■□□□ 1.61
ANKRD54-203ENST00000407117 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
ANKRD54-203ENST00000407117 GOSR1O95249 250 aa25.08■■□□□ 1.61
ANKRD54-203ENST00000407117 EPXP11678 715 aa25.08■■□□□ 1.61
ANKRD54-203ENST00000407117 DIO3P55073 304 aa25.08■■□□□ 1.61
ANKRD54-203ENST00000407117 EXOC3L1Q86VI1 746 aa25.08■■□□□ 1.61
ANKRD54-203ENST00000407117 GCNT2Q8N0V5 402 aa25.08■■□□□ 1.61
ANKRD54-203ENST00000407117 SLC16A11Q8NCK7 471 aa25.08■■□□□ 1.61
ANKRD54-203ENST00000407117 FAM110BQ8TC76 370 aa25.08■■□□□ 1.61
ANKRD54-203ENST00000407117 NINJ1Q92982 152 aa25.08■■□□□ 1.61
ANKRD54-203ENST00000407117 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
ANKRD54-203ENST00000407117 PACSIN3Q9UKS6 424 aa25.08■■□□□ 1.61
ANKRD54-203ENST00000407117 OR2M5A3KFT3 312 aa25.07■■□□□ 1.6
ANKRD54-203ENST00000407117 HSPA4LO95757 839 aa25.07■■□□□ 1.6
ANKRD54-203ENST00000407117 ACP2P11117 423 aa25.07■■□□□ 1.6
ANKRD54-203ENST00000407117 CD1EP15812 388 aa25.07■■□□□ 1.6
ANKRD54-203ENST00000407117 CREB1P16220 341 aa25.07■■□□□ 1.6
ANKRD54-203ENST00000407117 ARRB2P32121 409 aa25.07■■□□□ 1.6
ANKRD54-203ENST00000407117 ETV4P43268 484 aa25.07■■□□□ 1.6
ANKRD54-203ENST00000407117 PRIM2P49643 509 aa25.07■■□□□ 1.6
ANKRD54-203ENST00000407117 C6orf136Q5SQH8 315 aa25.07■■□□□ 1.6
ANKRD54-203ENST00000407117 APOOLQ6UXV4 268 aa25.07■■□□□ 1.6
ANKRD54-203ENST00000407117 P4HA3Q7Z4N8 544 aa25.07■■□□□ 1.6
ANKRD54-203ENST00000407117 UBQLNLQ8IYU4 475 aa25.07■■□□□ 1.6
ANKRD54-203ENST00000407117 ATAD3AQ9NVI7 634 aa25.07■■□□□ 1.6
ANKRD54-203ENST00000407117 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa25.07■■□□□ 1.6
ANKRD54-203ENST00000407117 EDARQ9UNE0 448 aa25.07■■□□□ 1.6
ANKRD54-203ENST00000407117 ZNF337Q9Y3M9 751 aa25.07■■□□□ 1.6
ANKRD54-203ENST00000407117 HIVEP1P15822 2718 aa25.06■■□□□ 1.6
ANKRD54-203ENST00000407117 SLC22A20A6NK97 555 aa25.06■■□□□ 1.6
ANKRD54-203ENST00000407117 TNFRSF21O75509 655 aa25.06■■□□□ 1.6
ANKRD54-203ENST00000407117 KCNK2O95069 426 aa25.06■■□□□ 1.6
ANKRD54-203ENST00000407117 TGM6O95932 706 aa25.06■■□□□ 1.6
ANKRD54-203ENST00000407117 ALOX5P09917 674 aa25.06■■□□□ 1.6
ANKRD54-203ENST00000407117 TBXA2RP21731 343 aa25.06■■□□□ 1.6
ANKRD54-203ENST00000407117 CPA2P48052 419 aa25.06■■□□□ 1.6
ANKRD54-203ENST00000407117 SERPINB4P48594 390 aa25.06■■□□□ 1.6
ANKRD54-203ENST00000407117 OCRLQ01968 901 aa25.06■■□□□ 1.6
ANKRD54-203ENST00000407117 DUSP5Q16690 384 aa25.06■■□□□ 1.6
ANKRD54-203ENST00000407117 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
ANKRD54-203ENST00000407117 PLXDC2Q6UX71 529 aa25.06■■□□□ 1.6
ANKRD54-203ENST00000407117 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
ANKRD54-203ENST00000407117 C3orf30Q96M34 536 aa25.06■■□□□ 1.6
ANKRD54-203ENST00000407117 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
ANKRD54-203ENST00000407117 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
ANKRD54-203ENST00000407117 STOML1Q9UBI4 398 aa25.06■■□□□ 1.6
ANKRD54-203ENST00000407117 GIMAP2Q9UG22 337 aa25.06■■□□□ 1.6
ANKRD54-203ENST00000407117 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa25.05■■□□□ 1.6
ANKRD54-203ENST00000407117 A0A1W2PNV4 684 aa25.05■■□□□ 1.6
ANKRD54-203ENST00000407117 A0A1W2PRB8 838 aa25.05■■□□□ 1.6
ANKRD54-203ENST00000407117 NDUFB5O43674 189 aa25.05■■□□□ 1.6
ANKRD54-203ENST00000407117 TNFSF13O75888 250 aa25.05■■□□□ 1.6
ANKRD54-203ENST00000407117 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
ANKRD54-203ENST00000407117 KRT71Q3SY84 523 aa25.05■■□□□ 1.6
ANKRD54-203ENST00000407117 LUZP2Q86TE4 346 aa25.05■■□□□ 1.6
ANKRD54-203ENST00000407117 COX18Q8N8Q8 333 aa25.05■■□□□ 1.6
ANKRD54-203ENST00000407117 FNDC5Q8NAU1 212 aa25.05■■□□□ 1.6
ANKRD54-203ENST00000407117 OR7A2PQ8NGA2 310 aa25.05■■□□□ 1.6
ANKRD54-203ENST00000407117 OR4C3Q8NH37 302 aa25.05■■□□□ 1.6
ANKRD54-203ENST00000407117 PSMA8Q8TAA3 256 aa25.05■■□□□ 1.6
ANKRD54-203ENST00000407117 FBXO30Q8TB52 745 aa25.05■■□□□ 1.6
ANKRD54-203ENST00000407117 OR5P2Q8WZ92 322 aa25.05■■□□□ 1.6
ANKRD54-203ENST00000407117 NRGNQ92686 78 aa25.05■■□□□ 1.6
ANKRD54-203ENST00000407117 STACQ99469 402 aa25.05■■□□□ 1.6
ANKRD54-203ENST00000407117 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
ANKRD54-203ENST00000407117 UBQLN4Q9NRR5 601 aa25.05■■□□□ 1.6
ANKRD54-203ENST00000407117 DUSP22Q9NRW4 184 aa25.05■■□□□ 1.6
ANKRD54-203ENST00000407117 GIN1Q9NXP7 522 aa25.05■■□□□ 1.6
ANKRD54-203ENST00000407117 GALNT8Q9NY28 637 aa25.05■■□□□ 1.6
ANKRD54-203ENST00000407117 ZNF175Q9Y473 711 aa25.05■■□□□ 1.6
ANKRD54-203ENST00000407117 AP4B1Q9Y6B7 739 aa25.05■■□□□ 1.6
ANKRD54-203ENST00000407117 A8MXE2 369 aa25.04■■□□□ 1.6
ANKRD54-203ENST00000407117 H3BML4 177 aa25.04■■□□□ 1.6
ANKRD54-203ENST00000407117 MSTNO14793 375 aa25.04■■□□□ 1.6
ANKRD54-203ENST00000407117 CTIFO43310 598 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
ANKRD54-203ENST00000407117 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
ANKRD54-203ENST00000407117 LAMP1P11279 417 aa25.04■■□□□ 1.6
ANKRD54-203ENST00000407117 ART1P52961 327 aa25.04■■□□□ 1.6
ANKRD54-203ENST00000407117 CLDN15P56746 228 aa25.04■■□□□ 1.6
ANKRD54-203ENST00000407117 PTGR1Q14914 329 aa25.04■■□□□ 1.6
ANKRD54-203ENST00000407117 TMEM44Q2T9K0 475 aa25.04■■□□□ 1.6
ANKRD54-203ENST00000407117 CPTPQ5TA50 214 aa25.04■■□□□ 1.6
ANKRD54-203ENST00000407117 IL23RQ5VWK5 629 aa25.04■■□□□ 1.6
ANKRD54-203ENST00000407117 NUDCD3Q8IVD9 361 aa25.04■■□□□ 1.6
ANKRD54-203ENST00000407117 MISPQ8IVT2 679 aa25.04■■□□□ 1.6
ANKRD54-203ENST00000407117 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa25.04■■□□□ 1.6
ANKRD54-203ENST00000407117 C16orf58Q96GQ5 468 aa25.04■■□□□ 1.6
ANKRD54-203ENST00000407117 ZIM3Q96PE6 472 aa25.04■■□□□ 1.6
ANKRD54-203ENST00000407117 C1orf50Q9BV19 199 aa25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms