RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398621.3

PGGT1BP2-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 2, humanhuman

BASIC

Gene PGGT1BP2, Length 1,028 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GNB5O14775 395 aa13.95□□□□□ -0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC19A2O60779 497 aa13.95□□□□□ -0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RFPL3SP0C7P2 107 aa13.95□□□□□ -0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR12D1P0DN82 309 aa13.95□□□□□ -0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP13.95□□□□□ -0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 UQCRFS1P47985 274 aa13.95□□□□□ -0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ATP12AP54707 1039 aa13.95□□□□□ -0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HPCAP84074 193 aa13.95□□□□□ -0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FADDQ13158 208 aa13.95□□□□□ -0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GANABQ14697 944 aaKnown RBP13.95□□□□□ -0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GRAMD1BQ3KR37 738 aa13.95□□□□□ -0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FLYWCH1Q4VC44 716 aa13.95□□□□□ -0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 COQ5Q5HYK3 327 aa13.95□□□□□ -0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CCNJQ5T5M9 372 aa13.95□□□□□ -0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP13.95□□□□□ -0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRILQ7L0X0 811 aa13.95□□□□□ -0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP13.95□□□□□ -0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CPLX4Q7Z7G2 160 aa13.95□□□□□ -0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SPPL2CQ8IUH8 684 aa13.95□□□□□ -0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DPP10Q8N608 796 aa13.95□□□□□ -0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 XAGE5Q8WWM1 108 aa13.95□□□□□ -0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP13.95□□□□□ -0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DEFB127Q9H1M4 99 aa13.95□□□□□ -0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LDAHQ9H6V9 325 aa13.95□□□□□ -0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PTGES2Q9H7Z7 377 aa13.95□□□□□ -0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAM53CQ9NYF3 392 aa13.95□□□□□ -0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CORO2BQ9UQ03 480 aa13.95□□□□□ -0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa13.94□□□□□ -0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 A0A1B0GUH1 482 aa13.94□□□□□ -0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BBIP1A8MTZ0 92 aa13.94□□□□□ -0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NPIPB9F8W1W9 429 aa13.94□□□□□ -0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CLIC1O00299 241 aa13.94□□□□□ -0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ADAM10O14672 748 aa13.94□□□□□ -0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BCKDKO14874 412 aa13.94□□□□□ -0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NDUFB5O43674 189 aa13.94□□□□□ -0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SCO2O43819 266 aa13.94□□□□□ -0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP13.94□□□□□ -0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ANGPTL1O95841 491 aa13.94□□□□□ -0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ABOP16442 354 aa13.94□□□□□ -0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MSX1P28360 303 aa13.94□□□□□ -0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SRD5A2P31213 254 aa13.94□□□□□ -0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PTGS2P35354 604 aa13.94□□□□□ -0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GCKP35557 465 aa13.94□□□□□ -0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DCTP40126 519 aa13.94□□□□□ -0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MVDP53602 400 aa13.94□□□□□ -0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SEC24CP53992 1094 aa13.94□□□□□ -0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GUCA2AQ02747 115 aa13.94□□□□□ -0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GNA13Q14344 377 aa13.94□□□□□ -0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP13.94□□□□□ -0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PAGE3Q5JUK9 113 aa13.94□□□□□ -0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP13.94□□□□□ -0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZAR1Q86SH2 424 aa13.94□□□□□ -0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MARCH3Q86UD3 253 aa13.94□□□□□ -0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 EID3Q8N140 333 aa13.94□□□□□ -0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FADS6Q8N9I5 356 aa13.94□□□□□ -0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR4K17Q8NGC6 315 aa13.94□□□□□ -0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NEIL3Q8TAT5 605 aa13.94□□□□□ -0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PRR7Q8TB68 274 aa13.94□□□□□ -0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SARAFQ96BY9 339 aa13.94□□□□□ -0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ROPN1LQ96C74 230 aa13.94□□□□□ -0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SCN2AQ99250 2005 aa13.94□□□□□ -0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR2B2Q9GZK3 357 aa13.94□□□□□ -0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SAP130Q9H0E3 1048 aa13.94□□□□□ -0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC6A13Q9NSD5 602 aa13.94□□□□□ -0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FBXO34Q9NWN3 711 aa13.94□□□□□ -0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CALML5Q9NZT1 146 aa13.94□□□□□ -0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FLRT3Q9NZU0 649 aa13.94□□□□□ -0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 P2RX2Q9UBL9 471 aa13.94□□□□□ -0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OSGIN2Q9Y236 505 aa13.94□□□□□ -0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP13.94□□□□□ -0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF462Q96JM2 2506 aa13.93□□□□□ -0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa13.93□□□□□ -0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 A0A1B0GTH9 108 aa13.93□□□□□ -0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TMEM247A6NEH6 219 aa13.93□□□□□ -0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PRRG2O14669 202 aa13.93□□□□□ -0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KIAA0513O60268 411 aa13.93□□□□□ -0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SNX3O60493 162 aa13.93□□□□□ -0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRAPPC6AO75865 159 aa13.93□□□□□ -0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 WISP2O76076 250 aa13.93□□□□□ -0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NPPAP01160 153 aa13.93□□□□□ -0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BMP2P12643 396 aa13.93□□□□□ -0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DRD4P21917 467 aa13.93□□□□□ -0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CRATP43155 626 aa13.93□□□□□ -0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GYS2P54840 703 aa13.93□□□□□ -0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP13.93□□□□□ -0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KLF10Q13118 480 aa13.93□□□□□ -0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF141Q15928 474 aa13.93□□□□□ -0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP13.93□□□□□ -0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GTDC1Q4AE62 458 aa13.93□□□□□ -0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KLHL26Q53HC5 615 aa13.93□□□□□ -0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NHSL2Q5HYW2 709 aa13.93□□□□□ -0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 APOOLQ6UXV4 268 aa13.93□□□□□ -0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa13.93□□□□□ -0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GALNT10Q86SR1 603 aa13.93□□□□□ -0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP13.93□□□□□ -0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 METTL25Q8N6Q8 603 aa13.93□□□□□ -0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DUSP19Q8WTR2 217 aa13.93□□□□□ -0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RAB8BQ92930 207 aa13.93□□□□□ -0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RELTQ969Z4 430 aa13.93□□□□□ -0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.1 ms