RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa19.11■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP19.11■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP19.11■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa19.11■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 CTBSQ01459 385 aa19.11■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 CTSL3PQ5NE16 218 aa19.11■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP19.11■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF597Q96LX8 424 aa19.11■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP19.11■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 ICKQ9UPZ9 632 aa19.11■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 MYH7P12883 1935 aa19.11■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa19.11■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 SGK494L7N484 410 aa19.11■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 GCAP28676 217 aa19.11■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 AGTR1P30556 359 aa19.11■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 COL28A1Q2UY09 1125 aa19.11■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 CGB2Q6NT52 195 aa19.11■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF765Q7L2R6 523 aa19.11■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 KLHL9Q9P2J3 617 aa19.11■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 CARD8Q9Y2G2 431 aa19.11■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 SOCS7O14512 581 aa19.1■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 EDIL3O43854 480 aa19.1■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 CPOXP36551 454 aa19.1■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 BEST3Q8N1M1 668 aa19.1■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa19.1■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 OR2S2Q9NQN1 319 aa19.1■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 NLKQ9UBE8 527 aa19.1■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 A6NIZ1 184 aa19.1■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 MEN1O00255 615 aa19.1■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 TOXO94900 526 aa19.1■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 IL7P13232 177 aa19.1■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 CASP6P55212 293 aa19.1■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 RAP1BP61224 184 aa19.1■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 RAP1AP62834 184 aa19.1■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 FGL1Q08830 312 aa19.1■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 MAP4K2Q12851 820 aa19.1■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 GPR149Q86SP6 731 aa19.1■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP19.1■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 ERVK-19Q9WJR5 959 aa19.1■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 CBLL1Q75N03 491 aa19.1■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 SFXN5Q8TD22 340 aa19.1■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 ARL6Q9H0F7 186 aa19.1■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa19.1■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 GGT3PA6NGU5 568 aa19.1■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 PTTG1O95997 202 aa19.1■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 F3P13726 295 aa19.1■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 CD40LGP29965 261 aa19.1■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 DEFB133Q30KQ1 61 aa19.1■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 RABEPKQ7Z6M1 372 aa19.1■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 PHC2Q8IXK0 858 aa19.1■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 HORMAD2Q8N7B1 307 aa19.1■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP19.1■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 PRSS38A1L453 326 aa19.09■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa19.09■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 SYT7O43581 403 aa19.09■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP19.09■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM225BP0DP42 221 aa19.09■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 KCTD11Q693B1 232 aa19.09■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP19.09■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 NLGN4XQ8N0W4 816 aa19.09■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 COQ8AQ8NI60 647 aa19.09■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 CPNE7Q9UBL6 633 aa19.09■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP19.09■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 MYH3P11055 1940 aa19.09■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 AHRP35869 848 aa19.09■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 ECH1Q13011 328 aa19.09■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 EFR3AQ14156 821 aa19.09■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 GPR148Q8TDV2 347 aa19.09■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 C7orf34Q96L11 122 aa19.09■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF175Q9Y473 711 aa19.09■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 BRINP1O60477 761 aa19.09■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 DCST2Q5T1A1 773 aa19.09■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 C6orf183Q5T699 404 aa19.09■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 C3P1Q6ZMU1 363 aa19.09■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 FAM217AQ8IXS0 508 aa19.09■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 GALNT6Q8NCL4 622 aa19.09■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM185BQ9H7F4 350 aa19.09■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 POU2F3Q9UKI9 436 aa19.09■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 GLO1Q04760 184 aa19.09■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa19.09■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 TRIM46Q7Z4K8 759 aa19.09■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 SLC35F2Q8IXU6 374 aa19.09■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 TCEAL3Q969E4 200 aa19.09■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 EVA1AQ9H8M9 152 aa19.09■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 HCSTQ9UBK5 93 aa19.09■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 UBQLN2Q9UHD9 624 aa19.09■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa19.09■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP19.08■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 TRAV18A0A075B6X5 111 aa19.08■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 UQCRC1P31930 480 aa19.08■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 SLC6A11P48066 632 aa19.08■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 RAB40BQ12829 278 aa19.08■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 RSU1Q15404 277 aa19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.1 ms