RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357436.4

SH3BP1-201, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP1, Length 2,852 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-201ENST00000357436 LIMS3P0CW19 117 aa17.52■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 LIMS4P0CW20 117 aa17.52■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 RPS5P46782 204 aaKnown RBP17.52■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC9A3P48764 834 aa17.52■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP17.52■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 ST3GAL3Q11203 375 aa17.52■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 XKRXQ6PP77 449 aa17.52■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF485Q8NCK3 441 aa17.52■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP17.52■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 KCTD7Q96MP8 289 aa17.52■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 CALML5Q9NZT1 146 aa17.52■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC13A4Q9UKG4 626 aa17.52■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP17.52■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP17.51■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP17.51■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 SDC2P34741 201 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 SCN1BQ07699 218 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 ASAH1Q13510 395 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 GAS6Q14393 721 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 NFATC4Q14934 902 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 PRRT3Q5FWE3 981 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 WDR92Q96MX6 357 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 GIMAP4Q9NUV9 329 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 MEIOCA2RUB1 952 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 TRAPPC2P0DI81 140 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 TRAPPC2BP0DI82 140 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 HSDL2Q6YN16 418 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 QSOX2Q6ZRP7 698 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 AMIGO1Q86WK6 493 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 PHOX2BQ99453 314 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 RERGLQ9H628 205 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 TMEM74BQ9NUR3 256 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 ASXL3Q9C0F0 2248 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF860A6NHJ4 632 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 HMX3A6NHT5 357 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 LRRTM2O43300 516 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 CMPK1P30085 196 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 PRKAR1BP31321 381 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 LTB4RQ15722 352 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 KAT2AQ92830 837 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 NECTIN4Q96NY8 510 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 ACTRT3Q9BYD9 372 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 MARCH7Q9H992 704 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC30A4O14863 429 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 FCMRO60667 390 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 SRP54P61011 504 aaKnown RBP17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 GATAD2AQ86YP4 633 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 GDPD1Q8N9F7 314 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 PIGXQ8TBF5 258 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 RNF31Q96EP0 1072 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC35A4Q96G79 324 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 TM9SF2Q99805 663 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 KATNB1Q9BVA0 655 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 SNX7Q9UNH6 387 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 FANCMQ8IYD8 2048 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 IGHV4-34P06331 123 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 CCNYL3P0C7X3 344 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 GABRA5P31644 462 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 GPR18Q14330 331 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 DECR1Q16698 335 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM131AQ6UXB0 335 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 RRM2BQ7LG56 351 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 SHFQ7M4L6 423 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 C16orf62Q7Z3J2 963 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 NRROSQ86YC3 692 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 NKAIN4Q8IVV8 208 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 POGLUT1Q8NBL1 392 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 OR4Q3Q8NH05 313 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 UFD1Q92890 307 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM131CQ96AQ9 280 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 PRRG3Q9BZD7 231 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 FOXQ1Q9C009 403 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 SRMSQ9H3Y6 488 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 MMP17Q9ULZ9 603 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 THY1P04216 161 aa17.49■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 CSF3P09919 207 aa17.49■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 TYRP1P17643 537 aa17.49■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 FPR3P25089 353 aa17.49■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 CD79BP40259 229 aa17.49■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 AVPR1BP47901 424 aa17.49■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 PDX1P52945 283 aa17.49■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 BTN3A2P78410 334 aa17.49■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 HOXC5Q00444 222 aa17.49■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 FABP5Q01469 135 aa17.49■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 AADACL4Q5VUY2 407 aa17.49■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 Q7L0L9 218 aa17.49■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 SYT14Q8NB59 555 aa17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms