RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 SLC30A6Q6NXT4 461 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 MARCH3Q86UD3 253 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 PLCZ1Q86YW0 608 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 FBXL14Q8N1E6 418 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 CA13Q8N1Q1 262 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 POU5F2Q8N7G0 328 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 ACTRT2Q8TDY3 377 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 APIPQ96GX9 242 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 TM9SF2Q99805 663 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 MS4A8Q9BY19 250 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 NARFLQ9H6Q4 476 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 HEY2Q9UBP5 337 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 SAGE2PA6NJ88 616 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 M0R1B8 84 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 SUV39H1O43463 412 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 PROM1O43490 865 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 HCN1O60741 890 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 SEMA3DO95025 777 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 DHRS4L1P0CG22 281 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 ATP6V1B2P21281 511 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 PAICSP22234 425 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 ENPP1P22413 925 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 RAD52P43351 418 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 HTR6P50406 440 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 PTGR1Q14914 329 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 CDKL4Q5MAI5 379 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 PLAG1Q6DJT9 500 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 XKRXQ6PP77 449 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 SPATA19Q7Z5L4 167 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 RNF130Q86XS8 419 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 ARMC8Q8IUR7 673 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 OR7A2PQ8NGA2 310 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 OR10G3Q8NGC4 313 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 OR52N5Q8NH56 324 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 PMM1Q92871 262 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 APH1AQ96BI3 265 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 DDIT4LQ96D03 193 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 OR2A5Q96R48 311 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF382Q96SR6 550 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 UCK2Q9BZX2 261 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 NEK6Q9HC98 313 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 ACSL6Q9UKU0 697 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM233B4DJY2 109 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 H3BUI4 141 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 P2RX6O15547 441 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 SNX3O60493 162 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 TGM1P22735 817 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 IDH2P48735 452 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 PON3Q15166 354 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 ZIC1Q15915 447 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 MAPK14Q16539 360 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 RUNDC3AQ59EK9 446 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 ARL9Q6T311 187 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 THAP5Q7Z6K1 395 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 DHDDSQ86SQ9 333 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF781Q8N8C0 355 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 WDR60Q8WVS4 1066 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 FBXL20Q96IG2 436 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 GPR78Q96P69 363 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC134Q9H6E4 229 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 NANOGQ9H9S0 305 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 KLHL9Q9P2J3 617 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 TMED5Q9Y3A6 229 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 MED12Q93074 2177 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
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PTPRC-201ENST00000348564 A0A1W2PRG6 482 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 TTC36A6NLP5 189 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 AGAP14A8MT82 685 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 ZNHIT1O43257 154 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 NRP2O60462 931 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 UGT2B17O75795 530 aa4.1□□□□□ -1.75
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PTPRC-201ENST00000348564 ANGPTL1O95841 491 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 OPN1SWP03999 348 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 G6PDP11413 515 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 UBL4AP11441 157 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 TDGF1P13385 188 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 CNR1P21554 472 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 TNFSF4P23510 183 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 ATP5J2P56134 94 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 MYBPC1Q00872 1141 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 SPANXN4Q5MJ08 99 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 SMARCD3Q6STE5 483 aa4.1□□□□□ -1.75
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