RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326715.4

VWDE-202, Transcript of von Willebrand factor D and EGF domains, humanhuman

TSL 5

Gene VWDE, Length 1,394 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWDE-202ENST00000326715 C3orf14Q9HBI5 128 aa13.12□□□□□ -0.31
VWDE-202ENST00000326715 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
VWDE-202ENST00000326715 AIG1Q9NVV5 245 aa13.12□□□□□ -0.31
VWDE-202ENST00000326715 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa13.12□□□□□ -0.31
VWDE-202ENST00000326715 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa13.11□□□□□ -0.31
VWDE-202ENST00000326715 HDAC3O15379 428 aa13.11□□□□□ -0.31
VWDE-202ENST00000326715 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
VWDE-202ENST00000326715 IFI6P09912 130 aa13.11□□□□□ -0.31
VWDE-202ENST00000326715 ALOX5P09917 674 aa13.11□□□□□ -0.31
VWDE-202ENST00000326715 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
VWDE-202ENST00000326715 CDKN2CP42773 168 aa13.11□□□□□ -0.31
VWDE-202ENST00000326715 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
VWDE-202ENST00000326715 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
VWDE-202ENST00000326715 CLDN15P56746 228 aa13.11□□□□□ -0.31
VWDE-202ENST00000326715 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
VWDE-202ENST00000326715 CD226Q15762 336 aa13.11□□□□□ -0.31
VWDE-202ENST00000326715 NDUFAF6Q330K2 333 aa13.11□□□□□ -0.31
VWDE-202ENST00000326715 SPDYE7PQ495Y7 208 aa13.11□□□□□ -0.31
VWDE-202ENST00000326715 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
VWDE-202ENST00000326715 NXNQ6DKJ4 435 aa13.11□□□□□ -0.31
VWDE-202ENST00000326715 MTFR2Q6P444 385 aa13.11□□□□□ -0.31
VWDE-202ENST00000326715 ARSKQ6UWY0 536 aa13.11□□□□□ -0.31
VWDE-202ENST00000326715 CAMKMTQ7Z624 323 aa13.11□□□□□ -0.31
VWDE-202ENST00000326715 HMGN2P46Q86SG4 172 aa13.11□□□□□ -0.31
VWDE-202ENST00000326715 COX18Q8N8Q8 333 aa13.11□□□□□ -0.31
VWDE-202ENST00000326715 CEP70Q8NHQ1 597 aa13.11□□□□□ -0.31
VWDE-202ENST00000326715 RND1Q92730 232 aa13.11□□□□□ -0.31
VWDE-202ENST00000326715 TUBA1CQ9BQE3 449 aa13.11□□□□□ -0.31
VWDE-202ENST00000326715 INPP5KQ9BT40 448 aa13.11□□□□□ -0.31
VWDE-202ENST00000326715 TAS2R10Q9NYW0 307 aa13.11□□□□□ -0.31
VWDE-202ENST00000326715 GPR45Q9Y5Y3 372 aa13.11□□□□□ -0.31
VWDE-202ENST00000326715 FIGNL2A6NMB9 653 aa13.1□□□□□ -0.31
VWDE-202ENST00000326715 CBR3O75828 277 aa13.1□□□□□ -0.31
VWDE-202ENST00000326715 ANGPTL1O95841 491 aa13.1□□□□□ -0.31
VWDE-202ENST00000326715 DPP4P27487 766 aa13.1□□□□□ -0.31
VWDE-202ENST00000326715 LHX2P50458 406 aa13.1□□□□□ -0.31
VWDE-202ENST00000326715 GFRA1P56159 465 aa13.1□□□□□ -0.31
VWDE-202ENST00000326715 TFF3Q07654 80 aa13.1□□□□□ -0.31
VWDE-202ENST00000326715 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
VWDE-202ENST00000326715 SMU1Q2TAY7 513 aa13.1□□□□□ -0.31
VWDE-202ENST00000326715 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa13.1□□□□□ -0.31
VWDE-202ENST00000326715 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP13.1□□□□□ -0.31
VWDE-202ENST00000326715 ATG16L1Q676U5 607 aa13.1□□□□□ -0.31
VWDE-202ENST00000326715 OGFOD2Q6N063 350 aa13.1□□□□□ -0.31
VWDE-202ENST00000326715 CDC73Q6P1J9 531 aa13.1□□□□□ -0.31
VWDE-202ENST00000326715 OR4K17Q8NGC6 315 aa13.1□□□□□ -0.31
VWDE-202ENST00000326715 OR4A15Q8NGL6 344 aa13.1□□□□□ -0.31
VWDE-202ENST00000326715 OR9I1Q8NGQ6 314 aa13.1□□□□□ -0.31
VWDE-202ENST00000326715 MARVELD3Q96A59 401 aa13.1□□□□□ -0.31
VWDE-202ENST00000326715 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
VWDE-202ENST00000326715 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
VWDE-202ENST00000326715 OR7D2Q96RA2 312 aa13.1□□□□□ -0.31
VWDE-202ENST00000326715 PRDM14Q9GZV8 571 aa13.1□□□□□ -0.31
VWDE-202ENST00000326715 SLC6A13Q9NSD5 602 aa13.1□□□□□ -0.31
VWDE-202ENST00000326715 ZNF446Q9NWS9 450 aa13.1□□□□□ -0.31
VWDE-202ENST00000326715 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
VWDE-202ENST00000326715 DKKL1Q9UK85 242 aa13.1□□□□□ -0.31
VWDE-202ENST00000326715 MPDZO75970 2070 aa13.1□□□□□ -0.31
VWDE-202ENST00000326715 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa13.09□□□□□ -0.31
VWDE-202ENST00000326715 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa13.09□□□□□ -0.31
VWDE-202ENST00000326715 WDR1O75083 606 aa13.09□□□□□ -0.31
VWDE-202ENST00000326715 KCNH1O95259 989 aa13.09□□□□□ -0.31
VWDE-202ENST00000326715 OPN1LWP04000 364 aa13.09□□□□□ -0.31
VWDE-202ENST00000326715 GSNP06396 782 aa13.09□□□□□ -0.31
VWDE-202ENST00000326715 SRD5A2P31213 254 aa13.09□□□□□ -0.31
VWDE-202ENST00000326715 RPL3P39023 403 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
VWDE-202ENST00000326715 PRIM2P49643 509 aa13.09□□□□□ -0.31
VWDE-202ENST00000326715 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
VWDE-202ENST00000326715 PRR5P85299 388 aa13.09□□□□□ -0.31
VWDE-202ENST00000326715 NHSL2Q5HYW2 709 aa13.09□□□□□ -0.31
VWDE-202ENST00000326715 TMEM211Q6ICI0 200 aa13.09□□□□□ -0.31
VWDE-202ENST00000326715 POMZP3Q6PJE2 187 aa13.09□□□□□ -0.31
VWDE-202ENST00000326715 C6orf120Q7Z4R8 191 aa13.09□□□□□ -0.31
VWDE-202ENST00000326715 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa13.09□□□□□ -0.31
VWDE-202ENST00000326715 C9orf106Q8NAJ2 232 aa13.09□□□□□ -0.31
VWDE-202ENST00000326715 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
VWDE-202ENST00000326715 LILRB4Q8NHJ6 448 aa13.09□□□□□ -0.31
VWDE-202ENST00000326715 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa13.09□□□□□ -0.31
VWDE-202ENST00000326715 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
VWDE-202ENST00000326715 TRIB1Q96RU8 372 aa13.09□□□□□ -0.31
VWDE-202ENST00000326715 EBF4Q9BQW3 602 aa13.09□□□□□ -0.31
VWDE-202ENST00000326715 BTBD2Q9BX70 525 aa13.09□□□□□ -0.31
VWDE-202ENST00000326715 ACTRT3Q9BYD9 372 aa13.09□□□□□ -0.31
VWDE-202ENST00000326715 PIGUQ9H490 435 aa13.09□□□□□ -0.31
VWDE-202ENST00000326715 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
VWDE-202ENST00000326715 ATAD3AQ9NVI7 634 aa13.09□□□□□ -0.31
VWDE-202ENST00000326715 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
VWDE-202ENST00000326715 PDZD2O15018 2839 aa13.09□□□□□ -0.31
VWDE-202ENST00000326715 AKAP6Q13023 2319 aa13.09□□□□□ -0.31
VWDE-202ENST00000326715 HK1P19367 917 aa13.08□□□□□ -0.31
VWDE-202ENST00000326715 AGAP20933 346 aa13.08□□□□□ -0.31
VWDE-202ENST00000326715 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.31
VWDE-202ENST00000326715 DLX5P56178 289 aa13.08□□□□□ -0.31
VWDE-202ENST00000326715 CLDN18P56856 261 aa13.08□□□□□ -0.31
VWDE-202ENST00000326715 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP13.08□□□□□ -0.313e-6■■□□□ 12.3
VWDE-202ENST00000326715 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.31
VWDE-202ENST00000326715 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.31
VWDE-202ENST00000326715 HDXQ7Z353 690 aa13.08□□□□□ -0.31
VWDE-202ENST00000326715 UBQLNLQ8IYU4 475 aa13.08□□□□□ -0.31
VWDE-202ENST00000326715 OR8J2Q8NGG1 315 aa13.08□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.2 ms