RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320857.7

SSR4-201, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene SSR4, Length 1,671 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4-201ENST00000320857 TMEM150CB9EJG8 249 aa15.77■□□□□ 0.12
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SSR4-201ENST00000320857 BCL10O95999 233 aa15.77■□□□□ 0.12
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SSR4-201ENST00000320857 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
SSR4-201ENST00000320857 CFHR1Q03591 330 aa15.75■□□□□ 0.11
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