RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285199.11

USP43-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 43, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP43, Length 4,169 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43-201ENST00000285199 MCM3APO60318 1980 aa14.79□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 PDCD5O14737 125 aa14.79□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 FARS2O95363 451 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 IGLV3-25P01717 112 aa14.79□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 GZMKP49863 264 aa14.79□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 KATNB1Q9BVA0 655 aa14.79□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 COPZ2Q9P299 210 aa14.79□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 NTNG1Q9Y2I2 539 aa14.79□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 CCDC88CQ9P219 2028 aa14.79□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 DOCK5Q9H7D0 1870 aa14.79□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 UNCXA6NJT0 531 aa14.78□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 ACOD1A6NK06 481 aa14.78□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 SLC16A5O15375 505 aa14.78□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 B3GALT2O43825 422 aa14.78□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 FZD7O75084 574 aa14.78□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 KRT33AO76009 404 aa14.78□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 PDGFRLQ15198 375 aa14.78□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 SMUG1Q53HV7 270 aa14.78□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa14.78□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 ACOT12Q8WYK0 555 aa14.78□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 ST8SIA2Q92186 375 aa14.78□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 HHATLQ9HCP6 504 aa14.78□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 FBXL2Q9UKC9 423 aa14.78□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 RREB1Q92766 1687 aa14.78□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 GOSR2O14653 212 aa14.78□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 PRH1P02810 166 aa14.78□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 CD2P06729 351 aa14.78□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 HLA-FP30511 346 aa14.78□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 RAB40BQ12829 278 aa14.78□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 DDOQ99489 341 aa14.78□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa14.78□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 TRAV18A0A075B6X5 111 aa14.78□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 SLC2A10O95528 541 aa14.78□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 CERS1P27544 350 aa14.78□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 VEGFCP49767 419 aa14.78□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 E2F1Q01094 437 aa14.78□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 SEC23BQ15437 767 aa14.78□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 SYT14P1Q58G82 188 aa14.78□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 ZNF805Q5CZA5 627 aa14.78□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 SIAH3Q8IW03 269 aa14.78□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 GPR135Q8IZ08 494 aa14.78□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 TRAM1L1Q8N609 369 aa14.78□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 ORAI1Q96D31 301 aa14.78□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 SEC22CQ9BRL7 303 aa14.78□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 EDARQ9UNE0 448 aa14.78□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa14.78□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa14.77□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 SLC22A5O76082 557 aa14.77□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 S100A10P60903 97 aa14.77□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 TAP2Q03519 686 aa14.77□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 GPR176Q14439 515 aa14.77□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 EIPR1Q53HC9 387 aa14.77□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 TPGS2Q68CL5 300 aa14.77□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 BEST3Q8N1M1 668 aa14.77□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa14.77□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 ZNF248Q8NDW4 579 aa14.77□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 KCNN1Q92952 543 aa14.77□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 SLC6A7Q99884 636 aa14.77□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 SYT17Q9BSW7 474 aa14.77□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 IFT46Q9NQC8 304 aa14.77□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 BABAM2Q9NXR7 383 aa14.77□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 ACP2P11117 423 aa14.77□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 IL1RNP18510 177 aa14.77□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 ELK1P19419 428 aa14.77□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 ENPP7Q6UWV6 458 aa14.77□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 APOOLQ6UXV4 268 aa14.77□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 GID4Q8IVV7 300 aa14.77□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 THAP6Q8TBB0 222 aa14.77□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 SRRQ9GZT4 340 aa14.77□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 PCBD2Q9H0N5 130 aa14.77□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 ATG5Q9H1Y0 275 aa14.77□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 ZNF639Q9UID6 485 aa14.77□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa14.77□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa14.77□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 TCRBP04435 133 aa14.77□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 FURINP09958 794 aa14.77□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 TYRP1P17643 537 aa14.77□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 AQP2P41181 271 aa14.77□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 ILKQ13418 452 aa14.77□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 FAAP20Q6NZ36 180 aa14.77□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 TMEFF1Q8IYR6 380 aa14.77□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 L3MBTL4Q8NA19 623 aa14.77□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 SLC25A46Q96AG3 418 aa14.77□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 ZNF559Q9BR84 538 aa14.77□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 FZD3Q9NPG1 666 aa14.77□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 FBXL12Q9NXK8 326 aa14.77□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 RTTNQ86VV8 2226 aa14.77□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 M0R036 132 aa14.77□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 AKR1C2P52895 323 aa14.77□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 FABP5Q01469 135 aa14.77□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 AKR1C1Q04828 323 aa14.77□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 PCGF3Q3KNV8 242 aa14.77□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 TMEM163Q8TC26 289 aa14.77□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 ZNF566Q969W8 418 aa14.77□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 SLC23A1Q9UHI7 598 aa14.77□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms