RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 HMX3A6NHT5 357 aa19.95■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 CAPNS1P04632 268 aa19.95■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 RAB5BP61020 215 aa19.95■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 KIR2DS3Q14952 304 aa19.95■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 ATAD3CQ5T2N8 411 aa19.95■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 CYB561A3Q8NBI2 242 aa19.95■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 OR6C4Q8NGE1 309 aa19.95■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 TANKQ92844 425 aa19.95■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 ATE1O95260 518 aa19.94■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 CDK4P11802 303 aa19.94■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 CCR7P32248 378 aa19.94■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 RGS6P49758 472 aa19.94■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 TAP2Q03519 686 aa19.94■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 HTR3DQ70Z44 454 aa19.94■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 ACOT4Q8N9L9 421 aa19.94■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 OR51L1Q8NGJ5 315 aa19.94■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 CACNG2Q9Y698 323 aa19.94■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 PGM2L1Q6PCE3 622 aa19.94■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 C3P1Q6ZMU1 363 aa19.94■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 B4GAT1O43505 415 aa19.94■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 FUT1P19526 365 aa19.94■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 PCGF3Q3KNV8 242 aa19.94■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 AWAT2Q6E213 333 aa19.94■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa19.94■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 DTD2Q96FN9 168 aa19.94■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF175Q9Y473 711 aa19.94■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 SYT7O43581 403 aa19.94■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 UBL4AP11441 157 aa19.94■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 FGFBP1Q14512 234 aa19.94■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 PKDCCQ504Y2 493 aa19.94■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 TP53I3Q53FA7 332 aa19.94■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 C17orf99Q6UX52 265 aa19.94■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa19.94■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 ZFP90Q8TF47 636 aa19.94■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 ASB11Q8WXH4 323 aa19.94■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 DIO2Q92813 273 aa19.94■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 PHB2Q99623 299 aa19.94■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa19.94■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 LINC00597Q9H2U6 94 aa19.94■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 ACOT7O00154 380 aa19.93■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 FAM69AQ5T7M9 428 aa19.93■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 UEVLDQ8IX04 471 aa19.93■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 C3orf58Q8NDZ4 430 aa19.93■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 CDC6Q99741 560 aa19.93■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 SAP130Q9H0E3 1048 aa19.93■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 FAM86C1Q9NVL1 165 aa19.93■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 LATO43561 262 aa19.93■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 PLATP00750 562 aa19.93■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 PROS1P07225 676 aa19.93■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 CSF1P09603 554 aa19.93■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 THEGLP0DJG4 465 aa19.93■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 ADRA1AP35348 466 aa19.93■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP19.93■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 RSU1Q15404 277 aa19.93■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP19.93■□□□□ 0.781e-6■■■□□ 16.5
CCSAP-201ENST00000284617 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa19.93■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 LMF1Q96S06 567 aa19.93■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 CWH43Q9H720 699 aa19.93■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 AOAHP28039 575 aa19.93■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF616Q08AN1 781 aa19.93■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM151BQ8IW70 566 aa19.93■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 UBXN10Q96LJ8 280 aa19.93■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa19.93■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 APMAPQ9HDC9 416 aa19.93■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 A6NIZ1 184 aa19.93■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 OR2T1O43869 369 aa19.93■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP19.93■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 TUBG1P23258 451 aa19.93■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 RAP1BP61224 184 aa19.93■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 RAP1AP62834 184 aa19.93■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 FAM69BQ5VUD6 431 aa19.93■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 LIPIQ6XZB0 460 aa19.93■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 USP53Q70EK8 1073 aa19.93■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM150AQ86TG1 271 aa19.93■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 INPP5EQ9NRR6 644 aa19.93■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 RNF215Q9Y6U7 377 aa19.93■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 LILRB3O75022 631 aa19.92■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 HBQ1P09105 142 aa19.92■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF43P17038 809 aa19.92■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 CPOXP36551 454 aa19.92■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 NOXA1Q86UR1 476 aa19.92■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 A0A0U1RQS6 177 aa19.92■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF217O75362 1048 aa19.92■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP19.92■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 GM2AP17900 193 aa19.92■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 RNF186Q9NXI6 227 aa19.92■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP19.92■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa19.92■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 SLC22A5O76082 557 aa19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.7 ms