RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273482.10

TRPC1-201, Transcript of transient receptor potential cation channel subfamily C member 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPC1, Length 4,324 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1-201ENST00000273482 THEGLP0DJG4 465 aa16.08■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 GNSP15586 552 aa16.08■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 GIFP27352 417 aa16.08■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 IFITM3Q01628 133 aa16.08■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 GALEQ14376 348 aa16.08■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 PODNL1Q6PEZ8 512 aa16.08■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa16.08■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 FANK1Q8TC84 345 aa16.08■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 FCAMRQ8WWV6 532 aa16.08■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 COMMD4Q9H0A8 199 aa16.08■□□□□ 0.17
TRPC1-201ENST00000273482 FRS3O43559 492 aa16.08■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 TSPAN12O95859 305 aa16.08■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 PRKACAP17612 351 aa16.08■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 MMP12P39900 470 aa16.08■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 PLK5Q496M5 336 aa16.08■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 MTFR2Q6P444 385 aa16.08■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 LILRA6Q6PI73 481 aa16.08■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 WASH2PQ6VEQ5 465 aa16.08■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 NRMQ8IXM6 262 aa16.08■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 CHST4Q8NCG5 386 aa16.08■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 SLC6A13Q9NSD5 602 aa16.08■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 GLTPQ9NZD2 209 aa16.08■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 CSN2P05814 226 aa16.08■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 FOSL2P15408 326 aa16.08■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 CAMK1Q14012 370 aa16.08■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 IRF4Q15306 451 aa16.08■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 SLC22A10Q63ZE4 541 aa16.08■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa16.08■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 OR4F15Q8NGB8 312 aa16.08■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 UBTD2Q8WUN7 234 aa16.08■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 APOOQ9BUR5 198 aa16.08■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 LGR4Q9BXB1 951 aa16.08■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP16.08■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa16.08■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 TAS2R3Q9NYW6 316 aa16.08■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 SPTBN2O15020 2390 aa16.08■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 K7ESM1 405 aa16.08■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 MAOBP27338 520 aa16.08■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 NXNL2Q5VZ03 156 aa16.08■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 USP53Q70EK8 1073 aa16.08■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa16.08■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 C15orf40Q8WUR7 153 aa16.08■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 CCDC107Q8WV48 283 aa16.08■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 ZNF354BQ96LW1 612 aa16.08■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa16.08■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 P2RY12Q9H244 342 aa16.08■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 EXO5Q9H790 373 aa16.08■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 RASD1Q9Y272 281 aa16.08■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 DRD1P21728 446 aa16.07■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 PSMB5P28074 263 aa16.07■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 CTBP2P56545 445 aa16.07■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 ILKQ13418 452 aa16.07■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 FCN2Q15485 313 aa16.07■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 BAK1Q16611 211 aa16.07■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 ZMAT1Q5H9K5 638 aa16.07■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 FAM198BQ6UWH4 519 aa16.07■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 LRRN1Q6UXK5 716 aa16.07■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 Q6ZNB5 142 aa16.07■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 KLHL42Q9P2K6 505 aa16.07■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 FAM186AA6NE01 2351 aa16.07■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 M0R082 166 aa16.07■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 LINC01565O15544 149 aa16.07■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 PRSS23O95084 383 aa16.07■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 ACADLP28330 430 aa16.07■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 SOX2P48431 317 aa16.07■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 ASAH1Q13510 395 aa16.07■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 TRAM1Q15629 374 aa16.07■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 IL20RBQ6UXL0 311 aa16.07■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 B3GLCTQ6Y288 498 aa16.07■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 OR6F1Q8NGZ6 308 aa16.07■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 PMEPA1Q969W9 287 aa16.07■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 GABARAPL3Q9BY60 117 aa16.07■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa16.07■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 TMEM202A6NGA9 273 aa16.07■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 B4DXG7 233 aa16.07■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 TAP2Q03519 686 aa16.07■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 SEC23BQ15437 767 aa16.07■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 C12orf40Q86WS4 652 aa16.07■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 TMC8Q8IU68 726 aa16.07■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 OR5D16Q8NGK9 328 aa16.07■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 PITX2Q99697 317 aa16.07■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 CDCA4Q9BXL8 241 aa16.07■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 CFHR5Q9BXR6 569 aa16.07■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 DMRT3Q9NQL9 472 aa16.07■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa16.07■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 KCNJ10P78508 379 aa16.06■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 GPNMBQ14956 572 aa16.06■□□□□ 0.16
TRPC1-201ENST00000273482 DUSP6Q16828 381 aa16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms