RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000269740.8

SLC39A3-201, Transcript of solute carrier family 39 member 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC39A3, Length 1,502 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3-201ENST00000269740 UTS2O95399 124 aa21.89■■□□□ 1.09
SLC39A3-201ENST00000269740 SNTA1Q13424 505 aa21.89■■□□□ 1.09
SLC39A3-201ENST00000269740 OR1C1Q15619 314 aa21.89■■□□□ 1.09
SLC39A3-201ENST00000269740 ZNF141Q15928 474 aa21.89■■□□□ 1.09
SLC39A3-201ENST00000269740 CCDC80Q76M96 950 aa21.89■■□□□ 1.09
SLC39A3-201ENST00000269740 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
SLC39A3-201ENST00000269740 ZNF227Q86WZ6 799 aa21.89■■□□□ 1.09
SLC39A3-201ENST00000269740 KRT73Q86Y46 540 aa21.89■■□□□ 1.09
SLC39A3-201ENST00000269740 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
SLC39A3-201ENST00000269740 ZADH2Q8N4Q0 377 aa21.89■■□□□ 1.09
SLC39A3-201ENST00000269740 ZNF527Q8NB42 609 aa21.89■■□□□ 1.09
SLC39A3-201ENST00000269740 RNF138Q8WVD3 245 aa21.89■■□□□ 1.09
SLC39A3-201ENST00000269740 ZNF607Q96SK3 696 aa21.89■■□□□ 1.09
SLC39A3-201ENST00000269740 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa21.89■■□□□ 1.09
SLC39A3-201ENST00000269740 PACSIN3Q9UKS6 424 aa21.89■■□□□ 1.09
SLC39A3-201ENST00000269740 ANKRD33BA6NCL7 494 aa21.88■■□□□ 1.09
SLC39A3-201ENST00000269740 ME2P23368 584 aa21.88■■□□□ 1.09
SLC39A3-201ENST00000269740 PGM1P36871 562 aa21.88■■□□□ 1.09
SLC39A3-201ENST00000269740 DCTP40126 519 aa21.88■■□□□ 1.09
SLC39A3-201ENST00000269740 ST13P50502 369 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
SLC39A3-201ENST00000269740 TNFSF10P50591 281 aa21.88■■□□□ 1.09
SLC39A3-201ENST00000269740 BNIP2Q12982 314 aa21.88■■□□□ 1.09
SLC39A3-201ENST00000269740 KCNAB2Q13303 367 aa21.88■■□□□ 1.09
SLC39A3-201ENST00000269740 COL28A1Q2UY09 1125 aa21.88■■□□□ 1.09
SLC39A3-201ENST00000269740 DESI1Q6ICB0 168 aa21.88■■□□□ 1.09
SLC39A3-201ENST00000269740 C19orf48Q6RUI8 117 aa21.88■■□□□ 1.09
SLC39A3-201ENST00000269740 OLIG3Q7RTU3 272 aa21.88■■□□□ 1.09
SLC39A3-201ENST00000269740 MDS2Q8NDY4 140 aa21.88■■□□□ 1.09
SLC39A3-201ENST00000269740 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa21.88■■□□□ 1.09
SLC39A3-201ENST00000269740 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
SLC39A3-201ENST00000269740 NINQ8N4C6 2090 aa21.88■■□□□ 1.09
SLC39A3-201ENST00000269740 AGAP5A6NIR3 686 aa21.87■■□□□ 1.09
SLC39A3-201ENST00000269740 GSTA4O15217 222 aa21.87■■□□□ 1.09
SLC39A3-201ENST00000269740 FADS1O60427 444 aa21.87■■□□□ 1.09
SLC39A3-201ENST00000269740 SERPINB7O75635 380 aa21.87■■□□□ 1.09
SLC39A3-201ENST00000269740 UGT2B17O75795 530 aa21.87■■□□□ 1.09
SLC39A3-201ENST00000269740 HPGDP15428 266 aa21.87■■□□□ 1.09
SLC39A3-201ENST00000269740 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
SLC39A3-201ENST00000269740 CLK3P49761 638 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
SLC39A3-201ENST00000269740 GRAMD1BQ3KR37 738 aa21.87■■□□□ 1.09
SLC39A3-201ENST00000269740 TBCELQ5QJ74 424 aa21.87■■□□□ 1.09
SLC39A3-201ENST00000269740 SPINK14Q6IE38 97 aa21.87■■□□□ 1.09
SLC39A3-201ENST00000269740 PGM2L1Q6PCE3 622 aa21.87■■□□□ 1.09
SLC39A3-201ENST00000269740 MDGA2Q7Z553 956 aa21.87■■□□□ 1.09
SLC39A3-201ENST00000269740 PEX5LQ8IYB4 626 aa21.87■■□□□ 1.09
SLC39A3-201ENST00000269740 FBXW8Q8N3Y1 598 aa21.87■■□□□ 1.09
SLC39A3-201ENST00000269740 PSD4Q8NDX1 1056 aa21.87■■□□□ 1.09
SLC39A3-201ENST00000269740 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa21.87■■□□□ 1.09
SLC39A3-201ENST00000269740 NODALQ96S42 347 aa21.87■■□□□ 1.09
SLC39A3-201ENST00000269740 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa21.87■■□□□ 1.09
SLC39A3-201ENST00000269740 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
SLC39A3-201ENST00000269740 A0A1W2PQD3 144 aa21.86■■□□□ 1.09
SLC39A3-201ENST00000269740 ALG1L2C9J202 215 aa21.86■■□□□ 1.09
SLC39A3-201ENST00000269740 SCDO00767 359 aa21.86■■□□□ 1.09
SLC39A3-201ENST00000269740 GMNNO75496 209 aa21.86■■□□□ 1.09
SLC39A3-201ENST00000269740 SLC25A12O75746 678 aa21.86■■□□□ 1.09
SLC39A3-201ENST00000269740 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
SLC39A3-201ENST00000269740 F10P00742 488 aa21.86■■□□□ 1.09
SLC39A3-201ENST00000269740 DBIP07108 87 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
SLC39A3-201ENST00000269740 CD46P15529 392 aa21.86■■□□□ 1.09
SLC39A3-201ENST00000269740 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
SLC39A3-201ENST00000269740 EVI2BP34910 448 aa21.86■■□□□ 1.09
SLC39A3-201ENST00000269740 KLHL26Q53HC5 615 aa21.86■■□□□ 1.09
SLC39A3-201ENST00000269740 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
SLC39A3-201ENST00000269740 POGLUT1Q8NBL1 392 aa21.86■■□□□ 1.09
SLC39A3-201ENST00000269740 ZG16BQ96DA0 208 aa21.86■■□□□ 1.09
SLC39A3-201ENST00000269740 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP21.86■■□□□ 1.09
SLC39A3-201ENST00000269740 MUC13Q9H3R2 512 aa21.86■■□□□ 1.09
SLC39A3-201ENST00000269740 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
SLC39A3-201ENST00000269740 HHATLQ9HCP6 504 aa21.86■■□□□ 1.09
SLC39A3-201ENST00000269740 SACM1LQ9NTJ5 587 aa21.86■■□□□ 1.09
SLC39A3-201ENST00000269740 KCNE5Q9UJ90 142 aa21.86■■□□□ 1.09
SLC39A3-201ENST00000269740 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
SLC39A3-201ENST00000269740 IFT52Q9Y366 437 aa21.86■■□□□ 1.09
SLC39A3-201ENST00000269740 CXCR6O00574 342 aa21.85■■□□□ 1.09
SLC39A3-201ENST00000269740 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
SLC39A3-201ENST00000269740 IFNA14P01570 189 aa21.85■■□□□ 1.09
SLC39A3-201ENST00000269740 P04436 131 aa21.85■■□□□ 1.09
SLC39A3-201ENST00000269740 FAM87AP0C7U9 286 aa21.85■■□□□ 1.09
SLC39A3-201ENST00000269740 CCL3P10147 92 aa21.85■■□□□ 1.09
SLC39A3-201ENST00000269740 GGT1P19440 569 aa21.85■■□□□ 1.09
SLC39A3-201ENST00000269740 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
SLC39A3-201ENST00000269740 CASP3P42574 277 aa21.85■■□□□ 1.09
SLC39A3-201ENST00000269740 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
SLC39A3-201ENST00000269740 SLC30A6Q6NXT4 461 aa21.85■■□□□ 1.09
SLC39A3-201ENST00000269740 FAM156AQ8NDB6 213 aa21.85■■□□□ 1.09
SLC39A3-201ENST00000269740 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
SLC39A3-201ENST00000269740 GRHL3Q8TE85 626 aa21.85■■□□□ 1.09
SLC39A3-201ENST00000269740 ANGPTL4Q9BY76 406 aa21.85■■□□□ 1.09
SLC39A3-201ENST00000269740 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa21.85■■□□□ 1.09
SLC39A3-201ENST00000269740 METTL7AQ9H8H3 244 aa21.85■■□□□ 1.09
SLC39A3-201ENST00000269740 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa21.85■■□□□ 1.09
SLC39A3-201ENST00000269740 ZNF232Q9UNY5 417 aa21.85■■□□□ 1.09
SLC39A3-201ENST00000269740 DTNAQ9Y4J8 743 aa21.85■■□□□ 1.09
SLC39A3-201ENST00000269740 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa21.85■■□□□ 1.09
SLC39A3-201ENST00000269740 TRAV17A0A0B4J275 112 aa21.85■■□□□ 1.09
SLC39A3-201ENST00000269740 PRAMEF25A6NGN4 478 aa21.85■■□□□ 1.09
SLC39A3-201ENST00000269740 M0QX08 132 aa21.85■■□□□ 1.09
SLC39A3-201ENST00000269740 DPM1O60762 260 aa21.85■■□□□ 1.09
SLC39A3-201ENST00000269740 THBS1P07996 1170 aa21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms