RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249504.6

HOXD11-201, Transcript of homeobox D11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene HOXD11, Length 1,533 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11-201ENST00000249504 PLCXD2Q0VAA5 305 aa17.91■□□□□ 0.46
HOXD11-201ENST00000249504 VEZF1Q14119 521 aa17.91■□□□□ 0.46
HOXD11-201ENST00000249504 GNA13Q14344 377 aa17.91■□□□□ 0.46
HOXD11-201ENST00000249504 RCN1Q15293 331 aa17.91■□□□□ 0.46
HOXD11-201ENST00000249504 OR1C1Q15619 314 aa17.91■□□□□ 0.46
HOXD11-201ENST00000249504 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP17.91■□□□□ 0.46
HOXD11-201ENST00000249504 NADK2Q4G0N4 442 aa17.91■□□□□ 0.46
HOXD11-201ENST00000249504 GPAT3Q53EU6 434 aa17.91■□□□□ 0.46
HOXD11-201ENST00000249504 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa17.91■□□□□ 0.46
HOXD11-201ENST00000249504 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa17.91■□□□□ 0.46
HOXD11-201ENST00000249504 AP1ARQ63HQ0 302 aa17.91■□□□□ 0.46
HOXD11-201ENST00000249504 LYPD8Q6UX82 237 aa17.91■□□□□ 0.46
HOXD11-201ENST00000249504 IL20RBQ6UXL0 311 aa17.91■□□□□ 0.46
HOXD11-201ENST00000249504 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa17.91■□□□□ 0.46
HOXD11-201ENST00000249504 Q6ZS92 163 aa17.91■□□□□ 0.46
HOXD11-201ENST00000249504 SLC30A8Q8IWU4 369 aa17.91■□□□□ 0.46
HOXD11-201ENST00000249504 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa17.91■□□□□ 0.46
HOXD11-201ENST00000249504 PRR22Q8IZ63 422 aa17.91■□□□□ 0.46
HOXD11-201ENST00000249504 HIPK4Q8NE63 616 aa17.91■□□□□ 0.46
HOXD11-201ENST00000249504 CATSPER1Q8NEC5 780 aa17.91■□□□□ 0.46
HOXD11-201ENST00000249504 OMA1Q96E52 524 aa17.91■□□□□ 0.46
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF350Q9GZX5 532 aa17.91■□□□□ 0.46
HOXD11-201ENST00000249504 RUBCNLQ9H714 662 aa17.91■□□□□ 0.46
HOXD11-201ENST00000249504 S100A14Q9HCY8 104 aa17.91■□□□□ 0.46
HOXD11-201ENST00000249504 FBXO34Q9NWN3 711 aa17.91■□□□□ 0.46
HOXD11-201ENST00000249504 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
HOXD11-201ENST00000249504 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa17.91■□□□□ 0.46
HOXD11-201ENST00000249504 SNX13Q9Y5W8 968 aa17.91■□□□□ 0.46
HOXD11-201ENST00000249504 IGSF10Q6WRI0 2623 aa17.9■□□□□ 0.46
HOXD11-201ENST00000249504 TRAV17A0A0B4J275 112 aa17.9■□□□□ 0.46
HOXD11-201ENST00000249504 C5orf58C9J3I9 102 aa17.9■□□□□ 0.46
HOXD11-201ENST00000249504 TSPAN2O60636 221 aa17.9■□□□□ 0.46
HOXD11-201ENST00000249504 STX11O75558 287 aa17.9■□□□□ 0.46
HOXD11-201ENST00000249504 OR6B1O95007 311 aa17.9■□□□□ 0.46
HOXD11-201ENST00000249504 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP17.9■□□□□ 0.46
HOXD11-201ENST00000249504 H6PDO95479 791 aa17.9■□□□□ 0.46
HOXD11-201ENST00000249504 NAGAP17050 411 aa17.9■□□□□ 0.46
HOXD11-201ENST00000249504 TMED10P49755 219 aaKnown RBP17.9■□□□□ 0.46
HOXD11-201ENST00000249504 SLC6A19Q695T7 634 aa17.9■□□□□ 0.46
HOXD11-201ENST00000249504 LCN8Q6JVE9 175 aa17.9■□□□□ 0.46
HOXD11-201ENST00000249504 REEP3Q6NUK4 255 aa17.9■□□□□ 0.46
HOXD11-201ENST00000249504 OLIG3Q7RTU3 272 aa17.9■□□□□ 0.46
HOXD11-201ENST00000249504 GOLM1Q8NBJ4 401 aa17.9■□□□□ 0.46
HOXD11-201ENST00000249504 DIO2Q92813 273 aa17.9■□□□□ 0.46
HOXD11-201ENST00000249504 PNPLA2Q96AD5 504 aa17.9■□□□□ 0.46
HOXD11-201ENST00000249504 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP17.9■□□□□ 0.46
HOXD11-201ENST00000249504 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa17.9■□□□□ 0.46
HOXD11-201ENST00000249504 G6PC3Q9BUM1 346 aa17.9■□□□□ 0.46
HOXD11-201ENST00000249504 SAP130Q9H0E3 1048 aa17.9■□□□□ 0.46
HOXD11-201ENST00000249504 BCL2L10Q9HD36 194 aa17.9■□□□□ 0.46
HOXD11-201ENST00000249504 POLE3Q9NRF9 147 aa17.9■□□□□ 0.46
HOXD11-201ENST00000249504 CALML5Q9NZT1 146 aa17.9■□□□□ 0.46
HOXD11-201ENST00000249504 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa17.9■□□□□ 0.46
HOXD11-201ENST00000249504 ANGPT4Q9Y264 503 aa17.9■□□□□ 0.46
HOXD11-201ENST00000249504 COL6A6A6NMZ7 2263 aa17.9■□□□□ 0.46
HOXD11-201ENST00000249504 EML6Q6ZMW3 1958 aa17.89■□□□□ 0.45
HOXD11-201ENST00000249504 AQP12BA6NM10 295 aa17.89■□□□□ 0.45
HOXD11-201ENST00000249504 H0Y3Z8 333 aa17.89■□□□□ 0.45
HOXD11-201ENST00000249504 FCMRO60667 390 aa17.89■□□□□ 0.45
HOXD11-201ENST00000249504 REM1O75628 298 aa17.89■□□□□ 0.45
HOXD11-201ENST00000249504 PPM1BO75688 479 aa17.89■□□□□ 0.45
HOXD11-201ENST00000249504 FBXO45P0C2W1 286 aa17.89■□□□□ 0.45
HOXD11-201ENST00000249504 KRT20P35900 424 aa17.89■□□□□ 0.45
HOXD11-201ENST00000249504 PNLIPRP2P54317 469 aa17.89■□□□□ 0.45
HOXD11-201ENST00000249504 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP17.89■□□□□ 0.45
HOXD11-201ENST00000249504 HPCAP84074 193 aa17.89■□□□□ 0.45
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP17.89■□□□□ 0.45
HOXD11-201ENST00000249504 SPINK14Q6IE38 97 aa17.89■□□□□ 0.45
HOXD11-201ENST00000249504 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP17.89■□□□□ 0.45
HOXD11-201ENST00000249504 FRRS1Q6ZNA5 592 aa17.89■□□□□ 0.45
HOXD11-201ENST00000249504 ZAR1Q86SH2 424 aa17.89■□□□□ 0.45
HOXD11-201ENST00000249504 GALNT10Q86SR1 603 aa17.89■□□□□ 0.45
HOXD11-201ENST00000249504 SPATA24Q86W54 205 aa17.89■□□□□ 0.45
HOXD11-201ENST00000249504 AQP12AQ8IXF9 295 aa17.89■□□□□ 0.45
HOXD11-201ENST00000249504 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP17.89■□□□□ 0.45
HOXD11-201ENST00000249504 C5orf34Q96MH7 638 aa17.89■□□□□ 0.45
HOXD11-201ENST00000249504 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP17.89■□□□□ 0.45
HOXD11-201ENST00000249504 SLC38A1Q9H2H9 487 aa17.89■□□□□ 0.45
HOXD11-201ENST00000249504 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP17.89■□□□□ 0.45
HOXD11-201ENST00000249504 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP17.89■□□□□ 0.45
HOXD11-201ENST00000249504 DSPPQ9NZW4 1301 aa17.88■□□□□ 0.45
HOXD11-201ENST00000249504 A0A0G2JPF8 293 aa17.88■□□□□ 0.45
HOXD11-201ENST00000249504 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa17.88■□□□□ 0.45
HOXD11-201ENST00000249504 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa17.88■□□□□ 0.45
HOXD11-201ENST00000249504 ARPC2O15144 300 aa17.88■□□□□ 0.45
HOXD11-201ENST00000249504 GSTA4O15217 222 aa17.88■□□□□ 0.45
HOXD11-201ENST00000249504 SLC25A12O75746 678 aa17.88■□□□□ 0.45
HOXD11-201ENST00000249504 PGM3O95394 542 aa17.88■□□□□ 0.45
HOXD11-201ENST00000249504 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa17.88■□□□□ 0.45
HOXD11-201ENST00000249504 CD46P15529 392 aa17.88■□□□□ 0.45
HOXD11-201ENST00000249504 GGT1P19440 569 aa17.88■□□□□ 0.45
HOXD11-201ENST00000249504 RFX3P48380 749 aa17.88■□□□□ 0.45
HOXD11-201ENST00000249504 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP17.88■□□□□ 0.45
HOXD11-201ENST00000249504 CHRNEQ04844 493 aa17.88■□□□□ 0.45
HOXD11-201ENST00000249504 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP17.88■□□□□ 0.45
HOXD11-201ENST00000249504 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP17.88■□□□□ 0.45
HOXD11-201ENST00000249504 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP17.88■□□□□ 0.45
HOXD11-201ENST00000249504 MDS2Q8NDY4 140 aa17.88■□□□□ 0.45
HOXD11-201ENST00000249504 BBS10Q8TAM1 723 aa17.88■□□□□ 0.45
HOXD11-201ENST00000249504 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.9 ms