RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 ZBTB26Q9HCK0 441 aa14.56□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 RYR3Q15413 4870 aa14.55□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 A0A0A6YYD5 115 aa14.55□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa14.55□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 HMX2A2RU54 273 aa14.55□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 GOLGA8OA6NCC3 632 aa14.55□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 GOLGA8NF8WBI6 632 aa14.55□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 GOLGA8RI6L899 631 aa14.55□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 TO15178 435 aa14.55□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 EEDO75530 441 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 HK1P19367 917 aa14.55□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 IL32P24001 234 aa14.55□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 CRABP2P29373 138 aa14.55□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 AGTR1P30556 359 aa14.55□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 STX2P32856 288 aa14.55□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 MAGEA4P43358 317 aa14.55□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 NAB1Q13506 487 aa14.55□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 SGCBQ16585 318 aa14.55□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 OR52E8Q6IFG1 317 aa14.55□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 RAPH1Q70E73 1250 aa14.55□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 CCDC25Q86WR0 208 aa14.55□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 LRRC17Q8N6Y2 441 aa14.55□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 TMBIM1Q969X1 311 aa14.55□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 RGMAQ96B86 450 aa14.55□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 C3orf49Q96BT1 292 aa14.55□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 C12orf49Q9H741 205 aa14.55□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 NMRAL1Q9HBL8 299 aa14.55□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 FBXO34Q9NWN3 711 aa14.55□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 CFL2Q9Y281 166 aa14.55□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa14.55□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 E7EQL1 145 aa14.54□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 ABCD4O14678 606 aa14.54□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 PGRMC2O15173 223 aa14.54□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 RAP1GDS1P52306 607 aa14.54□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 MGAT2Q10469 447 aa14.54□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 PPP4R4Q6NUP7 873 aa14.54□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 TFAP2EQ6VUC0 442 aa14.54□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 MUC15Q8N387 334 aa14.54□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 TEX9Q8N6V9 391 aa14.54□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 OR2M3Q8NG83 312 aa14.54□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 RHEBL1Q8TAI7 183 aa14.54□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 FAM216AQ8WUB2 273 aa14.54□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 IFT81Q8WYA0 676 aa14.54□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 DHRS9Q9BPW9 319 aa14.54□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 PIMREGQ9BSJ6 248 aa14.54□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 PRRG4Q9BZD6 226 aa14.54□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 DSN1Q9H410 356 aa14.54□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 GLRX2Q9NS18 164 aa14.54□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 NDUFS8O00217 210 aa14.53□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 EPB42P16452 691 aa14.53□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 NT5EP21589 574 aa14.53□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 PIK3R1P27986 724 aa14.53□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 PIK3CBP42338 1070 aa14.53□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 CAV1Q03135 178 aa14.53□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 GANABQ14697 944 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 C6orf163Q5TEZ5 329 aa14.53□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 MFSD12Q6NUT3 480 aa14.53□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 EMBQ6PCB8 327 aa14.53□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 EXOC3L1Q86VI1 746 aa14.53□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 ADCY4Q8NFM4 1077 aa14.53□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 GPR78Q96P69 363 aa14.53□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 WDR41Q9HAD4 459 aa14.53□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 NPAP1Q9NZP6 1156 aa14.53□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF639Q9UID6 485 aa14.53□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 PLLPQ9Y342 182 aa14.53□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 AP4B1Q9Y6B7 739 aa14.53□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
SPCS1-201ENST00000233025 TSPAN2O60636 221 aa14.52□□□□□ -0.09
SPCS1-201ENST00000233025 REM1O75628 298 aa14.52□□□□□ -0.09
SPCS1-201ENST00000233025 CBX7O95931 251 aa14.52□□□□□ -0.09
SPCS1-201ENST00000233025 C2P06681 752 aa14.52□□□□□ -0.09
SPCS1-201ENST00000233025 FAM58BPP0C7Q3 252 aa14.52□□□□□ -0.09
SPCS1-201ENST00000233025 CPMP14384 443 aa14.52□□□□□ -0.09
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF23P17027 643 aa14.52□□□□□ -0.09
SPCS1-201ENST00000233025 DRD5P21918 477 aa14.52□□□□□ -0.09
SPCS1-201ENST00000233025 BSGP35613 385 aa14.52□□□□□ -0.09
SPCS1-201ENST00000233025 PPICP45877 212 aa14.52□□□□□ -0.09
SPCS1-201ENST00000233025 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
SPCS1-201ENST00000233025 PDLIM4P50479 330 aa14.52□□□□□ -0.09
SPCS1-201ENST00000233025 ARFIP1P53367 373 aa14.52□□□□□ -0.09
SPCS1-201ENST00000233025 PRSS12P56730 875 aa14.52□□□□□ -0.09
SPCS1-201ENST00000233025 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa14.52□□□□□ -0.09
SPCS1-201ENST00000233025 AWAT1Q58HT5 328 aa14.52□□□□□ -0.09
SPCS1-201ENST00000233025 LIPJQ5W064 366 aa14.52□□□□□ -0.09
SPCS1-201ENST00000233025 FAM111BQ6SJ93 734 aa14.52□□□□□ -0.09
SPCS1-201ENST00000233025 TREML4Q6UXN2 200 aa14.52□□□□□ -0.09
SPCS1-201ENST00000233025 DEF8Q6ZN54 512 aa14.52□□□□□ -0.09
SPCS1-201ENST00000233025 OR10D3Q8NH80 312 aa14.52□□□□□ -0.09
SPCS1-201ENST00000233025 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
SPCS1-201ENST00000233025 ADGRG7Q96K78 797 aa14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.8 ms