RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000000442.10

ESRRA-201, Transcript of estrogen related receptor alpha, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene ESRRA, Length 2,215 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRA-201ENST00000000442 RNF31Q96EP0 1072 aa24.75■■□□□ 1.55
ESRRA-201ENST00000000442 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
ESRRA-201ENST00000000442 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
ESRRA-201ENST00000000442 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa24.75■■□□□ 1.55
ESRRA-201ENST00000000442 ZNF232Q9UNY5 417 aa24.75■■□□□ 1.55
ESRRA-201ENST00000000442 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa24.75■■□□□ 1.55
ESRRA-201ENST00000000442 SLC2A10O95528 541 aa24.74■■□□□ 1.55
ESRRA-201ENST00000000442 FCARP24071 287 aa24.74■■□□□ 1.55
ESRRA-201ENST00000000442 MAP2K3P46734 347 aa24.74■■□□□ 1.55
ESRRA-201ENST00000000442 EVX1P49640 407 aa24.74■■□□□ 1.55
ESRRA-201ENST00000000442 TANGO2Q6ICL3 276 aa24.74■■□□□ 1.55
ESRRA-201ENST00000000442 MZT2AQ6P582 158 aa24.74■■□□□ 1.55
ESRRA-201ENST00000000442 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
ESRRA-201ENST00000000442 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
ESRRA-201ENST00000000442 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
ESRRA-201ENST00000000442 WDR45Q9Y484 360 aa24.74■■□□□ 1.55
ESRRA-201ENST00000000442 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa24.74■■□□□ 1.55
ESRRA-201ENST00000000442 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa24.74■■□□□ 1.55
ESRRA-201ENST00000000442 SHISA3A0PJX4 238 aa24.74■■□□□ 1.55
ESRRA-201ENST00000000442 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
ESRRA-201ENST00000000442 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
ESRRA-201ENST00000000442 CA3P07451 260 aa24.74■■□□□ 1.55
ESRRA-201ENST00000000442 GALP22466 123 aa24.74■■□□□ 1.55
ESRRA-201ENST00000000442 RIN1Q13671 783 aa24.74■■□□□ 1.55
ESRRA-201ENST00000000442 ENPP2Q13822 863 aa24.74■■□□□ 1.55
ESRRA-201ENST00000000442 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa24.74■■□□□ 1.55
ESRRA-201ENST00000000442 VASNQ6EMK4 673 aa24.74■■□□□ 1.55
ESRRA-201ENST00000000442 PLET1Q6UQ28 207 aa24.74■■□□□ 1.55
ESRRA-201ENST00000000442 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
ESRRA-201ENST00000000442 VN1R4Q7Z5H5 301 aa24.74■■□□□ 1.55
ESRRA-201ENST00000000442 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
ESRRA-201ENST00000000442 SAMD8Q96LT4 415 aa24.74■■□□□ 1.55
ESRRA-201ENST00000000442 TTYH2Q9BSA4 534 aa24.74■■□□□ 1.55
ESRRA-201ENST00000000442 TRPV4Q9HBA0 871 aa24.74■■□□□ 1.55
ESRRA-201ENST00000000442 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
ESRRA-201ENST00000000442 IL20RAQ9UHF4 553 aa24.74■■□□□ 1.55
ESRRA-201ENST00000000442 SLC7A7Q9UM01 511 aa24.74■■□□□ 1.55
ESRRA-201ENST00000000442 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa24.74■■□□□ 1.55
ESRRA-201ENST00000000442 SOCS6O14544 535 aa24.73■■□□□ 1.55
ESRRA-201ENST00000000442 CDC42EP2O14613 210 aa24.73■■□□□ 1.55
ESRRA-201ENST00000000442 NCR1O76036 304 aa24.73■■□□□ 1.55
ESRRA-201ENST00000000442 CPN2P22792 545 aa24.73■■□□□ 1.55
ESRRA-201ENST00000000442 HLA-DMAP28067 261 aa24.73■■□□□ 1.55
ESRRA-201ENST00000000442 GCGRP47871 477 aa24.73■■□□□ 1.55
ESRRA-201ENST00000000442 P2RY14Q15391 338 aa24.73■■□□□ 1.55
ESRRA-201ENST00000000442 EOGTQ5NDL2 527 aa24.73■■□□□ 1.55
ESRRA-201ENST00000000442 ZNF836Q6ZNA1 936 aa24.73■■□□□ 1.55
ESRRA-201ENST00000000442 PAQR7Q86WK9 346 aa24.73■■□□□ 1.55
ESRRA-201ENST00000000442 CPOQ8IVL8 374 aa24.73■■□□□ 1.55
ESRRA-201ENST00000000442 LILRB4Q8NHJ6 448 aa24.73■■□□□ 1.55
ESRRA-201ENST00000000442 RNF170Q96K19 258 aa24.73■■□□□ 1.55
ESRRA-201ENST00000000442 GDF15Q99988 308 aa24.73■■□□□ 1.55
ESRRA-201ENST00000000442 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
ESRRA-201ENST00000000442 C5orf42Q9H799 3197 aa24.73■■□□□ 1.55
ESRRA-201ENST00000000442 SCN3AQ9NY46 2000 aa24.73■■□□□ 1.55
ESRRA-201ENST00000000442 IGFALSP35858 605 aa24.73■■□□□ 1.55
ESRRA-201ENST00000000442 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
ESRRA-201ENST00000000442 IL18Q14116 193 aa24.73■■□□□ 1.55
ESRRA-201ENST00000000442 MZT2BQ6NZ67 158 aa24.73■■□□□ 1.55
ESRRA-201ENST00000000442 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
ESRRA-201ENST00000000442 NOXA1Q86UR1 476 aa24.73■■□□□ 1.55
ESRRA-201ENST00000000442 KLBQ86Z14 1044 aa24.73■■□□□ 1.55
ESRRA-201ENST00000000442 UBASH3BQ8TF42 649 aa24.73■■□□□ 1.55
ESRRA-201ENST00000000442 COL26A1Q96A83 441 aa24.73■■□□□ 1.55
ESRRA-201ENST00000000442 MALT1Q9UDY8 824 aa24.73■■□□□ 1.55
ESRRA-201ENST00000000442 J3QRE1 110 aa24.72■■□□□ 1.55
ESRRA-201ENST00000000442 YES1P07947 543 aa24.72■■□□□ 1.55
ESRRA-201ENST00000000442 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
ESRRA-201ENST00000000442 EN2P19622 333 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
ESRRA-201ENST00000000442 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
ESRRA-201ENST00000000442 TNFRSF17Q02223 184 aa24.72■■□□□ 1.55
ESRRA-201ENST00000000442 RGS1Q08116 209 aa24.72■■□□□ 1.55
ESRRA-201ENST00000000442 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa24.72■■□□□ 1.55
ESRRA-201ENST00000000442 C6orf183Q5T699 404 aa24.72■■□□□ 1.55
ESRRA-201ENST00000000442 GID4Q8IVV7 300 aa24.72■■□□□ 1.55
ESRRA-201ENST00000000442 SIRT6Q8N6T7 355 aa24.72■■□□□ 1.55
ESRRA-201ENST00000000442 SIMC1Q8NDZ2 872 aa24.72■■□□□ 1.55
ESRRA-201ENST00000000442 SLC17A9Q9BYT1 436 aa24.72■■□□□ 1.55
ESRRA-201ENST00000000442 UBQLN3Q9H347 655 aa24.72■■□□□ 1.55
ESRRA-201ENST00000000442 SFXN1Q9H9B4 322 aa24.72■■□□□ 1.55
ESRRA-201ENST00000000442 GDE1Q9NZC3 331 aa24.72■■□□□ 1.55
ESRRA-201ENST00000000442 OR6C2Q9NZP2 312 aa24.72■■□□□ 1.55
ESRRA-201ENST00000000442 ADAM30Q9UKF2 790 aa24.72■■□□□ 1.55
ESRRA-201ENST00000000442 A0A1W2PQU0 124 aa24.71■■□□□ 1.55
ESRRA-201ENST00000000442 CD8B2A6NJW9 211 aa24.71■■□□□ 1.55
ESRRA-201ENST00000000442 CD8BP10966 210 aa24.71■■□□□ 1.55
ESRRA-201ENST00000000442 BDH1Q02338 343 aa24.71■■□□□ 1.55
ESRRA-201ENST00000000442 FZD5Q13467 585 aa24.71■■□□□ 1.55
ESRRA-201ENST00000000442 INSL4Q14641 139 aa24.71■■□□□ 1.55
ESRRA-201ENST00000000442 AMIGO1Q86WK6 493 aa24.71■■□□□ 1.55
ESRRA-201ENST00000000442 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
ESRRA-201ENST00000000442 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
ESRRA-201ENST00000000442 APOOQ9BUR5 198 aa24.71■■□□□ 1.55
ESRRA-201ENST00000000442 SCAMP1O15126 338 aa24.71■■□□□ 1.55
ESRRA-201ENST00000000442 PRKAR1AP10644 381 aa24.71■■□□□ 1.55
ESRRA-201ENST00000000442 EIPR1Q53HC9 387 aa24.71■■□□□ 1.55
ESRRA-201ENST00000000442 TMEM91Q6ZNR0 172 aa24.71■■□□□ 1.55
ESRRA-201ENST00000000442 ASPGQ86U10 573 aa24.71■■□□□ 1.55
ESRRA-201ENST00000000442 TRIM48Q8IWZ4 208 aa24.71■■□□□ 1.55
ESRRA-201ENST00000000442 OR2L13Q8N349 312 aa24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms