RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637015.1

ARID1B-223, Transcript of AT-rich interaction domain 1B, human

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene ARID1B, Length 5,284 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARID1B-223	ENST00000637015	RSC1A1	Q92681	617 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ARID1B-223	ENST00000637015	FAM46A	Q96IP4	442 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
ARID1B-223	ENST00000637015	HIPK2	Q9H2X6	1198 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ARID1B-223	ENST00000637015	PTRH2	Q9Y3E5	179 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
ARID1B-223	ENST00000637015	ZFAND5	O76080	213 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ARID1B-223	ENST00000637015	CNOT4	O95628	575 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
ARID1B-223	ENST00000637015	MAS1	P04201	325 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ARID1B-223	ENST00000637015	FGF4	P08620	206 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ARID1B-223	ENST00000637015	F7	P08709	466 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
ARID1B-223	ENST00000637015	CKMT1A	P12532	417 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ARID1B-223	ENST00000637015	CAMLG	P49069	296 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ARID1B-223	ENST00000637015	LAPTM4A	Q15012	233 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ARID1B-223	ENST00000637015	GPR139	Q6DWJ6	353 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ARID1B-223	ENST00000637015	ZNF695	Q8IW36	515 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ARID1B-223	ENST00000637015	OR5B2	Q96R09	309 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ARID1B-223	ENST00000637015	TSPAN10	Q9H1Z9	355 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
ARID1B-223	ENST00000637015	ABCG5	Q9H222	651 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ARID1B-223	ENST00000637015	DMRT3	Q9NQL9	472 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ARID1B-223	ENST00000637015	B3GNT3	Q9Y2A9	372 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ARID1B-223	ENST00000637015	PCDHGA8	Q9Y5G5	932 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ARID1B-223	ENST00000637015	PRAF2	O60831	178 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ARID1B-223	ENST00000637015	SNAP29	O95721	258 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ARID1B-223	ENST00000637015	ELK4	P28324	431 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ARID1B-223	ENST00000637015	YPEL5	P62699	121 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ARID1B-223	ENST00000637015	OR4D1	Q15615	310 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ARID1B-223	ENST00000637015	UGT8	Q16880	541 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ARID1B-223	ENST00000637015	HACD4	Q5VWC8	232 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ARID1B-223	ENST00000637015	MISP	Q8IVT2	679 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ARID1B-223	ENST00000637015	BIRC8	Q96P09	236 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ARID1B-223	ENST00000637015	CCNL2	Q96S94	520 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
ARID1B-223	ENST00000637015	HINT2	Q9BX68	163 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ARID1B-223	ENST00000637015	ZNF395	Q9H8N7	513 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
ARID1B-223	ENST00000637015	MARCH4	Q9P2E8	410 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
ARID1B-223	ENST00000637015	NXT1	Q9UKK6	140 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
ARID1B-223	ENST00000637015	GALR3	O60755	368 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
ARID1B-223	ENST00000637015	PRSS3	P35030	304 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ARID1B-223	ENST00000637015	RRAS2	P62070	204 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
ARID1B-223	ENST00000637015	SLC7A9	P82251	487 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ARID1B-223	ENST00000637015	MEF2D	Q14814	521 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ARID1B-223	ENST00000637015	TBRG1	Q3YBR2	411 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ARID1B-223	ENST00000637015	CLVS2	Q5SYC1	327 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ARID1B-223	ENST00000637015	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ARID1B-223	ENST00000637015	OR51D1	Q8NGF3	324 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ARID1B-223	ENST00000637015	FNDC8	Q8TC99	324 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ARID1B-223	ENST00000637015	POT1	Q9NUX5	634 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ARID1B-223	ENST00000637015		A8MXE2	369 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ARID1B-223	ENST00000637015	PLAT	P00750	562 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ARID1B-223	ENST00000637015	IL4R	P24394	825 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ARID1B-223	ENST00000637015	LSS	P48449	732 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ARID1B-223	ENST00000637015	USF2	Q15853	346 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
ARID1B-223	ENST00000637015	ZNF542P	Q5EBM4	170 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ARID1B-223	ENST00000637015	PLBD1	Q6P4A8	553 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ARID1B-223	ENST00000637015	TMEM150A	Q86TG1	271 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ARID1B-223	ENST00000637015	SYNPO	Q8N3V7	929 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ARID1B-223	ENST00000637015	LSM14A	Q8ND56	463 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
ARID1B-223	ENST00000637015	ADAMTS19	Q8TE59	1207 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ARID1B-223	ENST00000637015	LGALS12	Q96DT0	336 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ARID1B-223	ENST00000637015	MAEL	Q96JY0	434 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
ARID1B-223	ENST00000637015	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ARID1B-223	ENST00000637015	PRMT8	Q9NR22	394 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
ARID1B-223	ENST00000637015	SLC7A7	Q9UM01	511 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ARID1B-223	ENST00000637015	LRRC37A3	O60309	1634 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ARID1B-223	ENST00000637015	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
ARID1B-223	ENST00000637015	SMAD9	O15198	467 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
ARID1B-223	ENST00000637015	AMY2A	P04746	511 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ARID1B-223	ENST00000637015	SERPINE2	P07093	398 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ARID1B-223	ENST00000637015	OR8U9	P0C7N5	309 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ARID1B-223	ENST00000637015	IL7	P13232	177 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ARID1B-223	ENST00000637015	OR1J2	Q8NGS2	313 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ARID1B-223	ENST00000637015	DTD2	Q96FN9	168 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ARID1B-223	ENST00000637015	TOX2	Q96NM4	488 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ARID1B-223	ENST00000637015	IFT172	Q9UG01	1749 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ARID1B-223	ENST00000637015	OTOL1	A6NHN0	477 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
ARID1B-223	ENST00000637015	CD8B2	A6NJW9	211 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ARID1B-223	ENST00000637015	DRGX	A6NNA5	263 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ARID1B-223	ENST00000637015	SRPX2	O60687	465 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
ARID1B-223	ENST00000637015	SLC16A8	O95907	504 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ARID1B-223	ENST00000637015	SERPINA5	P05154	406 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ARID1B-223	ENST00000637015	CA3	P07451	260 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ARID1B-223	ENST00000637015	ZNF888	P0CJ79	500 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
ARID1B-223	ENST00000637015	CD8B	P10966	210 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ARID1B-223	ENST00000637015	CD79A	P11912	226 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ARID1B-223	ENST00000637015	PKLR	P30613	574 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ARID1B-223	ENST00000637015	CPZ	Q66K79	652 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ARID1B-223	ENST00000637015	PPP1R3B	Q86XI6	285 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ARID1B-223	ENST00000637015	OR14A16	Q8NHC5	309 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ARID1B-223	ENST00000637015	ASB17	Q8WXJ9	295 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ARID1B-223	ENST00000637015	ASB12	Q8WXK4	309 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ARID1B-223	ENST00000637015	C7orf34	Q96L11	122 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ARID1B-223	ENST00000637015	INIP	Q9NRY2	104 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ARID1B-223	ENST00000637015	PRELID1	Q9Y255	219 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ARID1B-223	ENST00000637015	FUOM	A2VDF0	154 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ARID1B-223	ENST00000637015	ANKRD33B	A6NCL7	494 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ARID1B-223	ENST00000637015	EGF	P01133	1207 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ARID1B-223	ENST00000637015	ETFA	P13804	333 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ARID1B-223	ENST00000637015	RAB5B	P61020	215 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ARID1B-223	ENST00000637015	SELENOW	P63302	87 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ARID1B-223	ENST00000637015	CLDN10	P78369	228 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ARID1B-223	ENST00000637015	KEAP1	Q14145	624 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ARID1B-223	ENST00000637015	GPR176	Q14439	515 aa		11.67	□□□□□ -0.54

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