RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628545.1

GLIS1-202, Transcript of GLIS family zinc finger 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene GLIS1, Length 2,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLIS1-202ENST00000628545 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 MROH8Q9H579 483 aa16.56■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 BACE2Q9Y5Z0 518 aa16.56■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 NINQ8N4C6 2090 aa16.56■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa16.55■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 CD96P40200 585 aa16.55■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 RNF4P78317 190 aa16.55■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
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GLIS1-202ENST00000628545 GSG1LQ6UXU4 331 aa16.55■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 NPAS3Q8IXF0 933 aa16.55■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa16.55■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 ZFP3Q96NJ6 502 aa16.55■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 C11orf49Q9H6J7 331 aa16.55■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 TMEM248Q9NWD8 314 aa16.55■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 PRMT3O60678 531 aa16.55■□□□□ 0.24
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GLIS1-202ENST00000628545 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 OR10K1Q8NGX5 313 aa16.55■□□□□ 0.24
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GLIS1-202ENST00000628545 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
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GLIS1-202ENST00000628545 CLEC4AQ9UMR7 237 aa16.55■□□□□ 0.24
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GLIS1-202ENST00000628545 SLC31A2O15432 143 aa16.55■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 TXNL1O43396 289 aa16.55■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
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GLIS1-202ENST00000628545 RAD1O60671 282 aa16.55■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 GAAP10253 952 aa16.55■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 LAP3P28838 519 aa16.55■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 RAB40BQ12829 278 aa16.55■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 CMIPQ8IY22 773 aa16.55■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 TCEAL4Q96EI5 215 aa16.55■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 MTG2Q9H4K7 406 aa16.55■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 ZFP57Q9NU63 452 aa16.55■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 KCND3Q9UK17 655 aa16.55■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 GIPP09681 153 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 CASP6P55212 293 aa16.54■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 TAS2R60P59551 318 aa16.54■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 TMEM44Q2T9K0 475 aa16.54■□□□□ 0.24
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GLIS1-202ENST00000628545 UAP1L1Q3KQV9 507 aa16.54■□□□□ 0.24
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GLIS1-202ENST00000628545 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
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GLIS1-202ENST00000628545 SPAG16Q8N0X2 631 aa16.54■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 ZNF485Q8NCK3 441 aa16.54■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa16.54■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 CCDC88CQ9P219 2028 aa16.54■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa16.54■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 RAMP2O60895 175 aa16.54■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 LGALS2P05162 132 aa16.54■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 KCNE1P15382 129 aa16.54■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 RAB5BP61020 215 aa16.54■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 CDK6Q00534 326 aa16.54■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 E2F1Q01094 437 aa16.54■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 SLC3A1Q07837 685 aa16.54■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 RAB33AQ14088 237 aa16.54■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 ERV3-1Q14264 604 aa16.54■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 MBTPS1Q14703 1052 aa16.54■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 SSX2Q16385 188 aa16.54■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 MANEAQ5SRI9 462 aa16.54■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 DCST1Q5T197 706 aa16.54■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 SLC9B2Q86UD5 537 aa16.54■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 CHST14Q8NCH0 376 aa16.54■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 TMIEQ8NEW7 156 aa16.54■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 THAP6Q8TBB0 222 aa16.54■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 KAT2AQ92830 837 aa16.54■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP16.54■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 MOGAT1Q96PD6 335 aa16.54■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 SLC25A32Q9H2D1 315 aa16.54■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 WBP1LQ9NX94 342 aa16.54■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 A0A1B0GW55 424 aa16.53■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 PRAMEF2O60811 474 aa16.53■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 SPDEFO95238 335 aa16.53■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 ZNF286BP0CG31 522 aa16.53■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 DUX4L2P0CJ85 424 aa16.53■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 DUX4L3P0CJ86 424 aa16.53■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 DUX4L4P0CJ87 422 aa16.53■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 DUX4L5P0CJ88 424 aa16.53■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 DUX4L6P0CJ89 424 aa16.53■□□□□ 0.24
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