RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627440.2

SNAP23-223, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-223	ENST00000627440	ABAT	P80404	500 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	CTBP1	Q13363	440 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	TTMP	Q5BVD1	217 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440		Q5VSD8	79 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	GJB7	Q6PEY0	223 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	BTNL3	Q6UXE8	466 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF572	Q7Z3I7	529 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	GALNT10	Q86SR1	603 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	LRRC49	Q8IUZ0	686 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	TUSC5	Q8IXB3	177 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF433	Q8N7K0	673 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	BLOC1S5	Q8TDH9	187 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	RAB1C	Q92928	201 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC35C1	Q96A29	364 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	TM4SF19	Q96DZ7	209 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	PRAP1	Q96NZ9	151 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	PITX2	Q99697	317 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	HEMGN	Q9BXL5	484 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM129A	Q9BZQ8	928 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	MS4A5	Q9H3V2	200 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM96A	Q9H5X1	160 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	ZWILCH	Q9H900	591 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	ETNK2	Q9NVF9	386 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	SDAD1	Q9NVU7	687 aa	Known RBP eCLIP	5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	PAQR5	Q9NXK6	330 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	HACD3	Q9P035	362 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	KLHL13	Q9P2N7	655 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	IMPACT	Q9P2X3	320 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	VTI1B	Q9UEU0	232 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	NIPSNAP3A	Q9UFN0	247 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	PRSS50	Q9UI38	385 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	FBXO2	Q9UK22	296 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	MRPS33	Q9Y291	106 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF256	Q9Y2P7	627 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	MRFAP1	Q9Y605	127 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	DNAH5	Q8TE73	4624 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM129	A0AVI4	362 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	AGAP14	A8MT82	685 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	CETN3	O15182	167 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	CDC14B	O60729	498 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	NIPSNAP2	O75323	286 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	NCR1	O76036	304 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	CRYAA	P02489	173 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	DES	P17661	470 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	KRT15	P19012	456 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	NT5E	P21589	574 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	BUD31	P41223	144 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	RPS13	P62277	151 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	NOMO3	P69849	1222 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	HSPA14	Q0VDF9	509 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	STX4	Q12846	297 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	PMS2P11	Q13670	270 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	PTPRCAP	Q14761	206 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	NOMO1	Q15155	1222 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	CCSMST1	Q4G0I0	132 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	AARS2	Q5JTZ9	985 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	ANKRD22	Q5VYY1	191 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	CAPN13	Q6MZZ7	669 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	LRRN1	Q6UXK5	716 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	PACS1	Q6VY07	963 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	KRBA2	Q6ZNG9	492 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	CA13	Q8N1Q1	262 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	MUC20	Q8N307	709 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	CEP112	Q8N8E3	955 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	OR10D3	Q8NH80	312 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	KIF18A	Q8NI77	898 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	ITLN1	Q8WWA0	313 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	DHX58	Q96C10	678 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	C3orf30	Q96M34	536 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	PANX2	Q96RD6	677 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	DIRC2	Q96SL1	478 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	WWTR1	Q9GZV5	400 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF442	Q9H7R0	627 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	PRM3	Q9NNZ6	103 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	PPAN	Q9NQ55	473 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	SNX15	Q9NRS6	342 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	RAB6B	Q9NRW1	208 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	ABCF3	Q9NUQ8	709 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	CWC15	Q9P013	229 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	MDFIC	Q9P1T7	246 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	AKAP8L	Q9ULX6	646 aa	Known RBP eCLIP	5.18	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	OR6C76	A6NM76	312 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	AP4M1	O00189	453 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	NDUFS4	O43181	175 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	SYNGR3	O43761	229 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	ESRRB	O95718	433 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	KRT3	P12035	628 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	COX7A2	P14406	83 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	FER	P16591	822 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	COIL	P38432	576 aa	Predicted RBP	5.17	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	FEN1	P39748	380 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	PTGDS	P41222	190 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	OR3A2	P47893	321 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	HCAR3	P49019	387 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	MTNR1B	P49286	362 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	RNF144A	P50876	292 aa	Predicted RBP	5.17	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	HNRNPF	P52597	415 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	NRG3	P56975	720 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	RAB10	P61026	200 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	SNTA1	Q13424	505 aa		5.17	□□□□□ -1.58

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