RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616559.4

PTPRQ-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type Q, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRQ, Length 8,165 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQ-209ENST00000616559 LHX1P48742 406 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRQ-209ENST00000616559 RABGGTBP53611 331 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRQ-209ENST00000616559 SLC12A3P55017 1021 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRQ-209ENST00000616559 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP1.99□□□□□ -2.09
PTPRQ-209ENST00000616559 GAB1Q13480 694 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRQ-209ENST00000616559 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP1.99□□□□□ -2.09
PTPRQ-209ENST00000616559 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP1.99□□□□□ -2.09
PTPRQ-209ENST00000616559 RTL8BQ17RB0 113 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRQ-209ENST00000616559 ZNF674Q2M3X9 581 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRQ-209ENST00000616559 DPCR1Q3MIW9 517 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRQ-209ENST00000616559 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP1.99□□□□□ -2.09
PTPRQ-209ENST00000616559 SMUG1Q53HV7 270 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRQ-209ENST00000616559 PYDC2Q56P42 97 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRQ-209ENST00000616559 FAM209BQ5JX69 171 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRQ-209ENST00000616559 NT5DC1Q5TFE4 455 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRQ-209ENST00000616559 STEAP1BQ6NZ63 245 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRQ-209ENST00000616559 PID1Q7Z2X4 250 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRQ-209ENST00000616559 CALHM1Q8IU99 346 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRQ-209ENST00000616559 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRQ-209ENST00000616559 REXO1L1PQ8IX06 675 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRQ-209ENST00000616559 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP1.99□□□□□ -2.09
PTPRQ-209ENST00000616559 ZNF540Q8NDQ6 660 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRQ-209ENST00000616559 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP1.99□□□□□ -2.09
PTPRQ-209ENST00000616559 OR11H7Q8NGC8 314 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRQ-209ENST00000616559 OR5L2Q8NGL0 311 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRQ-209ENST00000616559 OR4L1Q8NH43 312 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRQ-209ENST00000616559 FIBINQ8TAL6 211 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRQ-209ENST00000616559 PEX13Q92968 403 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRQ-209ENST00000616559 AZIN2Q96A70 460 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRQ-209ENST00000616559 TIFAQ96CG3 184 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRQ-209ENST00000616559 ZNF681Q96N22 645 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRQ-209ENST00000616559 ZNF583Q96ND8 569 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRQ-209ENST00000616559 CCDC32Q9BV29 185 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRQ-209ENST00000616559 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP1.99□□□□□ -2.09
PTPRQ-209ENST00000616559 SRMSQ9H3Y6 488 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRQ-209ENST00000616559 FKRPQ9H9S5 495 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRQ-209ENST00000616559 ISYNA1Q9NPH2 558 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRQ-209ENST00000616559 TMEM74BQ9NUR3 256 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRQ-209ENST00000616559 ASIC5Q9NY37 505 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRQ-209ENST00000616559 BARHL2Q9NY43 387 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRQ-209ENST00000616559 TAS2R13Q9NYV9 303 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRQ-209ENST00000616559 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP1.99□□□□□ -2.09
PTPRQ-209ENST00000616559 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP1.99□□□□□ -2.09
PTPRQ-209ENST00000616559 TUBD1Q9UJT1 453 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRQ-209ENST00000616559 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRQ-209ENST00000616559 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRQ-209ENST00000616559 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP1.99□□□□□ -2.09
PTPRQ-209ENST00000616559 XDHP47989 1333 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRQ-209ENST00000616559 ABCC12Q96J65 1359 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRQ-209ENST00000616559 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP1.99□□□□□ -2.09
PTPRQ-209ENST00000616559 ITSN2Q9NZM3 1697 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRQ-209ENST00000616559 A0A0U1RQK1 487 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRQ-209ENST00000616559 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRQ-209ENST00000616559 USP17L15C9J2P7 530 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRQ-209ENST00000616559 USP17L13C9JLJ4 530 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRQ-209ENST00000616559 USP17L11C9JVI0 530 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRQ-209ENST00000616559 USP17L18D6R9N7 530 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRQ-209ENST00000616559 USP17L22D6RA61 530 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRQ-209ENST00000616559 USP17L17D6RBQ6 530 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRQ-209ENST00000616559 USP17L19D6RCP7 530 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRQ-209ENST00000616559 USP17L20D6RJB6 530 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRQ-209ENST00000616559 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP1.99□□□□□ -2.09
PTPRQ-209ENST00000616559 FAAHO00519 579 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRQ-209ENST00000616559 ISLRO14498 428 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRQ-209ENST00000616559 ZBTB5O15062 677 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRQ-209ENST00000616559 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP1.99□□□□□ -2.09
PTPRQ-209ENST00000616559 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP1.99□□□□□ -2.09
PTPRQ-209ENST00000616559 C21orf2O43822 256 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRQ-209ENST00000616559 PCDH7O60245 1069 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRQ-209ENST00000616559 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP1.99□□□□□ -2.09
PTPRQ-209ENST00000616559 HPGDSO60760 199 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRQ-209ENST00000616559 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP1.99□□□□□ -2.09
PTPRQ-209ENST00000616559 NIPSNAP2O75323 286 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRQ-209ENST00000616559 CDK14O94921 469 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRQ-209ENST00000616559 NKX2-2O95096 273 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRQ-209ENST00000616559 PIGRP01833 764 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRQ-209ENST00000616559 GPX1P07203 203 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRQ-209ENST00000616559 HTN1P15515 57 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRQ-209ENST00000616559 CTRB1P17538 263 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRQ-209ENST00000616559 CTPS1P17812 591 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRQ-209ENST00000616559 PKLRP30613 574 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRQ-209ENST00000616559 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP1.99□□□□□ -2.09
PTPRQ-209ENST00000616559 ACOT2P49753 483 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRQ-209ENST00000616559 OR12D2P58182 307 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRQ-209ENST00000616559 CSNK1G2P78368 415 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRQ-209ENST00000616559 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP1.99□□□□□ -2.09
PTPRQ-209ENST00000616559 FOXO4P98177 505 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRQ-209ENST00000616559 ZNF33BQ06732 778 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRQ-209ENST00000616559 ELP6Q0PNE2 266 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRQ-209ENST00000616559 USP17L24Q0WX57 530 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRQ-209ENST00000616559 KLF10Q13118 480 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRQ-209ENST00000616559 OR2F1Q13607 317 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRQ-209ENST00000616559 DECR1Q16698 335 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRQ-209ENST00000616559 LRRC73Q5JTD7 316 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRQ-209ENST00000616559 DCAF12Q5T6F0 453 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRQ-209ENST00000616559 CTRB2Q6GPI1 263 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRQ-209ENST00000616559 FAM198BQ6UWH4 519 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRQ-209ENST00000616559 SLC51AQ86UW1 340 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRQ-209ENST00000616559 DTWD2Q8NBA8 298 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRQ-209ENST00000616559 BEND2Q8NDZ0 799 aa1.99□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.9 ms