RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 HMOX2P30519 316 aa23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1-211ENST00000590874 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1-211ENST00000590874 CYP27C1Q4G0S4 372 aa23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM107Q6UX40 140 aa23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1-211ENST00000590874 SYT10Q6XYQ8 523 aa23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM214BQ7L5A3 538 aa23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1-211ENST00000590874 MARCH3Q86UD3 253 aa23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1-211ENST00000590874 METTL6Q8TCB7 284 aa23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1-211ENST00000590874 DUSP19Q8WTR2 217 aa23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1-211ENST00000590874 CAVIN3Q969G5 261 aa23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1-211ENST00000590874 BBS4Q96RK4 519 aa23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1-211ENST00000590874 PTGES2Q9H7Z7 377 aa23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1-211ENST00000590874 SDHAF3Q9NRP4 125 aa23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF180Q9UJW8 692 aa23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1-211ENST00000590874 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
CAPNS1-211ENST00000590874 MYO1GB0I1T2 1018 aa23.03■■□□□ 1.28
CAPNS1-211ENST00000590874 SHISA8B8ZZ34 492 aa23.03■■□□□ 1.28
CAPNS1-211ENST00000590874 JUNP05412 331 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
CAPNS1-211ENST00000590874 TBXA2RP21731 343 aa23.03■■□□□ 1.28
CAPNS1-211ENST00000590874 BTKQ06187 659 aa23.03■■□□□ 1.28
CAPNS1-211ENST00000590874 GALNT18Q6P9A2 607 aa23.03■■□□□ 1.28
CAPNS1-211ENST00000590874 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A087WV62 115 aa23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-211ENST00000590874 DLX3O60479 287 aa23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-211ENST00000590874 PSMG1O95456 288 aa23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-211ENST00000590874 DDCP20711 480 aa23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC6A8P48029 635 aa23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-211ENST00000590874 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-211ENST00000590874 PPP2R2BQ00005 443 aa23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-211ENST00000590874 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-211ENST00000590874 GGNQ86UU5 652 aa23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-211ENST00000590874 KCNA7Q96RP8 456 aa23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM216Q9P0N5 145 aa23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-211ENST00000590874 ADAM21Q9UKJ8 722 aa23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-211ENST00000590874 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-211ENST00000590874 TIMM22Q9Y584 194 aa23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-211ENST00000590874 AP4B1Q9Y6B7 739 aa23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-211ENST00000590874 FBN3Q75N90 2809 aa23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-211ENST00000590874 ARID1AO14497 2285 aa23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-211ENST00000590874 JMJD1CQ15652 2540 aa23.02■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 UPK1AO00322 258 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 KLF4O43474 513 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 GMFGO60234 142 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 IL33O95760 270 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 RFX3P48380 749 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 ETF1P62495 437 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 OCRLQ01968 901 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 SGCBQ16585 318 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 DECR1Q16698 335 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM44Q2T9K0 475 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 LGSNQ5TDP6 509 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 LRRN4CLQ8ND94 238 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 CDC26Q8NHZ8 85 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 Q9N2J8 555 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 CLEC4AQ9UMR7 237 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 NFU1Q9UMS0 254 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 FCGR2AP12318 317 aa23■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 TAC1P20366 129 aa23■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF763Q0D2J5 394 aa23■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 C2orf80Q0P641 193 aa23■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 BEX5Q5H9J7 111 aa23■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 APOOLQ6UXV4 268 aa23■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 OR2L13Q8N349 312 aa23■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 GLIPR2Q9H4G4 154 aa23■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa23■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 SIRT5Q9NXA8 310 aa23■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 PLAUP00749 431 aa22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 PAX1P15863 534 aa22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 IMPDH1P20839 514 aa22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 GSTM5P46439 218 aa22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 CLK3P49761 638 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 PPP4R4Q6NUP7 873 aa22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 STAC2Q6ZMT1 411 aa22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 OR6K3Q8NGY3 331 aa22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 EMC9Q9Y3B6 208 aa22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 ESPNB1AK53 854 aa22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 SLITRK5O94991 958 aa22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 UTS2O95399 124 aa22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 ANGPTL1O95841 491 aa22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 ENO1P06733 434 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 LCP2Q13094 533 aa22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM71E1Q6IPT2 247 aa22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 SH2D5Q6ZV89 423 aa22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM171Q8WVE6 324 aa22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 MIEF1Q9NQG6 463 aa22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms