RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587860.1

CTIF-205, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 2,940 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-205ENST00000587860 SLC9A5Q14940 896 aa14.13□□□□□ -0.15
CTIF-205ENST00000587860 DEFB134Q4QY38 66 aa14.13□□□□□ -0.15
CTIF-205ENST00000587860 TMEM196Q5HYL7 178 aa14.13□□□□□ -0.15
CTIF-205ENST00000587860 ZER1Q7Z7L7 766 aa14.13□□□□□ -0.15
CTIF-205ENST00000587860 RAB43Q86YS6 212 aa14.13□□□□□ -0.15
CTIF-205ENST00000587860 UBE2J2Q8N2K1 259 aa14.13□□□□□ -0.15
CTIF-205ENST00000587860 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP14.13□□□□□ -0.15
CTIF-205ENST00000587860 MS4A6EQ96DS6 147 aa14.13□□□□□ -0.15
CTIF-205ENST00000587860 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP14.13□□□□□ -0.15
CTIF-205ENST00000587860 TEX101Q9BY14 249 aa14.13□□□□□ -0.15
CTIF-205ENST00000587860 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP14.13□□□□□ -0.151e-6■□□□□ 9.2
CTIF-205ENST00000587860 DIABLOQ9NR28 239 aa14.13□□□□□ -0.15
CTIF-205ENST00000587860 SEC16AO15027 2179 aa14.13□□□□□ -0.15
CTIF-205ENST00000587860 FUT1P19526 365 aa14.13□□□□□ -0.15
CTIF-205ENST00000587860 MMP11P24347 488 aa14.13□□□□□ -0.15
CTIF-205ENST00000587860 GPR68Q15743 365 aa14.13□□□□□ -0.15
CTIF-205ENST00000587860 ZNF404Q494X3 552 aa14.13□□□□□ -0.15
CTIF-205ENST00000587860 PGBD2Q6P3X8 592 aa14.13□□□□□ -0.15
CTIF-205ENST00000587860 PRSS41Q7RTY9 318 aa14.13□□□□□ -0.15
CTIF-205ENST00000587860 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa14.13□□□□□ -0.15
CTIF-205ENST00000587860 OR8H3Q8N146 312 aa14.13□□□□□ -0.15
CTIF-205ENST00000587860 OR4K5Q8NGD3 323 aa14.13□□□□□ -0.15
CTIF-205ENST00000587860 SLC9A6Q92581 669 aa14.13□□□□□ -0.15
CTIF-205ENST00000587860 FNDC11Q9BVV2 318 aa14.13□□□□□ -0.15
CTIF-205ENST00000587860 BTBD1Q9H0C5 482 aa14.13□□□□□ -0.15
CTIF-205ENST00000587860 TMEM168Q9H0V1 697 aa14.13□□□□□ -0.15
CTIF-205ENST00000587860 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP14.13□□□□□ -0.15
CTIF-205ENST00000587860 COL4A3Q01955 1670 aa14.12□□□□□ -0.15
CTIF-205ENST00000587860 ALPK3Q96L96 1907 aa14.12□□□□□ -0.15
CTIF-205ENST00000587860 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa14.12□□□□□ -0.15
CTIF-205ENST00000587860 K7EQS6 105 aa14.12□□□□□ -0.15
CTIF-205ENST00000587860 UGT2B17O75795 530 aa14.12□□□□□ -0.15
CTIF-205ENST00000587860 OR2B3O76000 313 aa14.12□□□□□ -0.15
CTIF-205ENST00000587860 OR5F1O95221 314 aa14.12□□□□□ -0.15
CTIF-205ENST00000587860 IFNA16P05015 189 aa14.12□□□□□ -0.15
CTIF-205ENST00000587860 FCER2P06734 321 aa14.12□□□□□ -0.15
CTIF-205ENST00000587860 PROS1P07225 676 aa14.12□□□□□ -0.15
CTIF-205ENST00000587860 ACSL1P33121 698 aa14.12□□□□□ -0.15
CTIF-205ENST00000587860 KCNJ5P48544 419 aa14.12□□□□□ -0.15
CTIF-205ENST00000587860 SRP54P61011 504 aaKnown RBP14.12□□□□□ -0.15
CTIF-205ENST00000587860 EFR3AQ14156 821 aa14.12□□□□□ -0.15
CTIF-205ENST00000587860 LIPKQ5VXJ0 399 aa14.12□□□□□ -0.15
CTIF-205ENST00000587860 PAMR1Q6UXH9 720 aa14.12□□□□□ -0.15
CTIF-205ENST00000587860 OR2L3Q8NG85 312 aa14.12□□□□□ -0.15
CTIF-205ENST00000587860 SUN3Q8TAQ9 357 aa14.12□□□□□ -0.15
CTIF-205ENST00000587860 ASB12Q8WXK4 309 aa14.12□□□□□ -0.15
CTIF-205ENST00000587860 SLC6A18Q96N87 628 aa14.12□□□□□ -0.15
CTIF-205ENST00000587860 SLC23A1Q9UHI7 598 aa14.12□□□□□ -0.15
CTIF-205ENST00000587860 A4GNTQ9UNA3 340 aa14.12□□□□□ -0.15
CTIF-205ENST00000587860 A0A0A6YYD5 115 aa14.12□□□□□ -0.15
CTIF-205ENST00000587860 ZAR1LA6NP61 321 aa14.12□□□□□ -0.15
CTIF-205ENST00000587860 AGR2O95994 175 aa14.12□□□□□ -0.15
CTIF-205ENST00000587860 RPN2P04844 631 aa14.12□□□□□ -0.15
CTIF-205ENST00000587860 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP14.12□□□□□ -0.15
CTIF-205ENST00000587860 FAPQ12884 760 aa14.12□□□□□ -0.15
CTIF-205ENST00000587860 SSX1Q16384 188 aa14.12□□□□□ -0.15
CTIF-205ENST00000587860 RPE65Q16518 533 aa14.12□□□□□ -0.15
CTIF-205ENST00000587860 OR2G6Q5TZ20 316 aa14.12□□□□□ -0.15
CTIF-205ENST00000587860 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP14.12□□□□□ -0.15
CTIF-205ENST00000587860 IKBIPQ70UQ0 350 aa14.12□□□□□ -0.15
CTIF-205ENST00000587860 FANK1Q8TC84 345 aa14.12□□□□□ -0.15
CTIF-205ENST00000587860 LCN9Q8WX39 176 aa14.12□□□□□ -0.15
CTIF-205ENST00000587860 MTERF3Q96E29 417 aa14.12□□□□□ -0.15
CTIF-205ENST00000587860 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa14.12□□□□□ -0.15
CTIF-205ENST00000587860 PRDM7Q9NQW5 492 aa14.12□□□□□ -0.15
CTIF-205ENST00000587860 CLN6Q9NWW5 311 aa14.12□□□□□ -0.15
CTIF-205ENST00000587860 OSGIN1Q9UJX0 560 aa14.12□□□□□ -0.15
CTIF-205ENST00000587860 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP14.12□□□□□ -0.15
CTIF-205ENST00000587860 OR2W5A6NFC9 320 aa14.11□□□□□ -0.15
CTIF-205ENST00000587860 ZNF98A6NK75 572 aa14.11□□□□□ -0.15
CTIF-205ENST00000587860 GPX5O75715 221 aa14.11□□□□□ -0.15
CTIF-205ENST00000587860 RASGRP1O95267 797 aa14.11□□□□□ -0.15
CTIF-205ENST00000587860 CCNYL3P0C7X3 344 aa14.11□□□□□ -0.15
CTIF-205ENST00000587860 CD79BP40259 229 aa14.11□□□□□ -0.15
CTIF-205ENST00000587860 GINS1Q14691 196 aa14.11□□□□□ -0.15
CTIF-205ENST00000587860 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa14.11□□□□□ -0.15
CTIF-205ENST00000587860 SFXN1Q9H9B4 322 aa14.11□□□□□ -0.15
CTIF-205ENST00000587860 MAPRE3Q9UPY8 281 aa14.11□□□□□ -0.15
CTIF-205ENST00000587860 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa14.11□□□□□ -0.15
CTIF-205ENST00000587860 WDFY4Q6ZS81 3184 aa14.11□□□□□ -0.15
CTIF-205ENST00000587860 MAN2B1O00754 1011 aa14.11□□□□□ -0.15
CTIF-205ENST00000587860 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP14.11□□□□□ -0.15
CTIF-205ENST00000587860 TRIM23P36406 574 aa14.11□□□□□ -0.15
CTIF-205ENST00000587860 ACTR1BP42025 376 aa14.11□□□□□ -0.15
CTIF-205ENST00000587860 ACTR1AP61163 376 aa14.11□□□□□ -0.15
CTIF-205ENST00000587860 RPA4Q13156 261 aa14.11□□□□□ -0.15
CTIF-205ENST00000587860 TAB1Q15750 504 aa14.11□□□□□ -0.15
CTIF-205ENST00000587860 DUSP6Q16828 381 aa14.11□□□□□ -0.15
CTIF-205ENST00000587860 CASP12Q6UXS9 341 aa14.11□□□□□ -0.15
CTIF-205ENST00000587860 SLC16A11Q8NCK7 471 aa14.11□□□□□ -0.15
CTIF-205ENST00000587860 OR1E3Q8WZA6 343 aa14.11□□□□□ -0.15
CTIF-205ENST00000587860 ZNF354BQ96LW1 612 aa14.11□□□□□ -0.15
CTIF-205ENST00000587860 RBCK1Q9BYM8 510 aa14.11□□□□□ -0.15
CTIF-205ENST00000587860 NPAP1Q9NZP6 1156 aa14.11□□□□□ -0.15
CTIF-205ENST00000587860 MUC3AQ02505 3323 aa14.11□□□□□ -0.15
CTIF-205ENST00000587860 GSAPA4D1B5 854 aa14.11□□□□□ -0.15
CTIF-205ENST00000587860 C5orf67F2Z3F1 127 aa14.11□□□□□ -0.15
CTIF-205ENST00000587860 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP14.11□□□□□ -0.15
CTIF-205ENST00000587860 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP14.11□□□□□ -0.15
CTIF-205ENST00000587860 GRK3P35626 688 aa14.11□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms