RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 M0QZQ0 153 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 PBX2P40425 430 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 MAGEA3P43357 314 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 CCINQ13939 588 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 TP53I3Q53FA7 332 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 POC1BQ8TC44 478 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 MS4A4EQ96PG1 132 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 DHRS4Q9BTZ2 278 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 TGM5O43548 720 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 IFNA10P01566 189 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 IFNA4P05014 189 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 C5AR1P21730 350 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 SLC2A5P22732 501 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 SELENOVP59797 346 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 RSU1Q15404 277 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 OR51L1Q8NGJ5 315 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 OR5H2Q8NGV7 314 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP20.18■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 CPOQ8IVL8 374 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 ADGRG5Q8IZF4 528 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 OR9A2Q8NGT5 310 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 DMRT3Q9NQL9 472 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 LTBP3Q9NS15 1303 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 RPS17P08708 135 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 IFNGR1P15260 489 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 MALLQ13021 153 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 PCGF3Q3KNV8 242 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 BMFQ96LC9 184 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 RIMS3Q9UJD0 308 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 FAM171A2A8MVW0 826 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 SC5DO75845 299 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 FAPQ12884 760 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 PPA1Q15181 289 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 SERINC2Q96SA4 455 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 OR51E2Q9H255 320 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 VAPAQ9P0L0 249 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 EMCNQ9ULC0 261 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 CSF2RAP15509 400 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 MC2RQ01718 297 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 GRIN2CQ14957 1233 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 SCD5Q86SK9 330 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 SPARTQ8N0X7 666 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 PINK1Q9BXM7 581 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 PRAMEF2O60811 474 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 ATE1O95260 518 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 TSPAN15O95858 294 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 PLAG1Q6DJT9 500 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 B3GNT7Q8NFL0 401 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 BEST4Q8NFU0 473 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 OR7G3Q8NG95 312 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 TFAP2CQ92754 450 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 STRADBQ9C0K7 418 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 CWH43Q9H720 699 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 SULT1C2O00338 296 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 KIAA0355O15063 1070 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 SDC1P18827 310 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 SSTP61278 116 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 VEZF1Q14119 521 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 HOXD1Q9GZZ0 328 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 GPR157Q5UAW9 335 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 TMPPEQ6ZT21 453 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 CDC6Q99741 560 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 SULT4A1Q9BR01 284 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 IRS2Q9Y4H2 1338 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 MYH6P13533 1939 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 MC3RP41968 323 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 SERPINA11Q86U17 422 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF619Q8N2I2 560 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 OR5L2Q8NGL0 311 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 SLC17A9Q9BYT1 436 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 THSD1Q9NS62 852 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 REV1Q9UBZ9 1251 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 CACNG2Q9Y698 323 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 DDCP20711 480 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 INHBCP55103 352 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 NKX3-2P78367 333 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 VIPR2P41587 438 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 KCNJ8Q15842 424 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM185AQ8NFB2 350 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 CEPT1Q9Y6K0 416 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 RNF215Q9Y6U7 377 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 B4GAT1O43505 415 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 OR8U9P0C7N5 309 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 FASLGP48023 281 aa20.16■□□□□ 0.82
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