RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 HMGN4O00479 90 aa30.32■■■□□ 2.44
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP30.32■■■□□ 2.44
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CTDNEP1-209ENST00000574205 RFC3P40938 356 aa30.32■■■□□ 2.44
CTDNEP1-209ENST00000574205 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP30.32■■■□□ 2.44
CTDNEP1-209ENST00000574205 COQ5Q5HYK3 327 aa30.32■■■□□ 2.44
CTDNEP1-209ENST00000574205 COX20Q5RI15 118 aa30.32■■■□□ 2.44
CTDNEP1-209ENST00000574205 DLEU7Q6UYE1 221 aa30.32■■■□□ 2.44
CTDNEP1-209ENST00000574205 C16orf62Q7Z3J2 963 aa30.32■■■□□ 2.44
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF605Q86T29 641 aa30.32■■■□□ 2.44
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF597Q96LX8 424 aa30.32■■■□□ 2.44
CTDNEP1-209ENST00000574205 CCDC106Q9BWC9 280 aa30.32■■■□□ 2.44
CTDNEP1-209ENST00000574205 TTTY12Q9BZ98 90 aa30.32■■■□□ 2.44
CTDNEP1-209ENST00000574205 IL1RL2Q9HB29 575 aa30.32■■■□□ 2.44
CTDNEP1-209ENST00000574205 SVILO95425 2214 aa30.31■■■□□ 2.44
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CTDNEP1-209ENST00000574205 BBIP1A8MTZ0 92 aa30.31■■■□□ 2.44
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa30.31■■■□□ 2.44
CTDNEP1-209ENST00000574205 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP30.31■■■□□ 2.444e-7■■■■■ 66.4
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CTDNEP1-209ENST00000574205 MYLK2Q9H1R3 596 aa30.31■■■□□ 2.44
CTDNEP1-209ENST00000574205 RAD21L1Q9H4I0 556 aa30.31■■■□□ 2.44
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ZFP64Q9NPA5 681 aa30.31■■■□□ 2.44
CTDNEP1-209ENST00000574205 FLRT3Q9NZU0 649 aa30.31■■■□□ 2.44
CTDNEP1-209ENST00000574205 GMEB1Q9Y692 573 aa30.31■■■□□ 2.44
CTDNEP1-209ENST00000574205 NBASA2RRP1 2371 aa30.31■■■□□ 2.44
CTDNEP1-209ENST00000574205 ACOT7O00154 380 aa30.3■■■□□ 2.44
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CTDNEP1-209ENST00000574205 RNFT1Q5M7Z0 435 aa30.3■■■□□ 2.44
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZAR1Q86SH2 424 aa30.3■■■□□ 2.44
CTDNEP1-209ENST00000574205 SNX32Q86XE0 403 aa30.3■■■□□ 2.44
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLX1AQ9BQ83 275 aa30.3■■■□□ 2.44
CTDNEP1-209ENST00000574205 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP30.29■■■□□ 2.44
CTDNEP1-209ENST00000574205 LOC100653049A0A140TA62 436 aa30.29■■■□□ 2.44
CTDNEP1-209ENST00000574205 FADS1O60427 444 aa30.29■■■□□ 2.44
CTDNEP1-209ENST00000574205 KRT34O76011 436 aa30.29■■■□□ 2.44
CTDNEP1-209ENST00000574205 GLSO94925 669 aaPredicted RBP30.29■■■□□ 2.44
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CTDNEP1-209ENST00000574205 STX5Q13190 355 aa30.29■■■□□ 2.44
CTDNEP1-209ENST00000574205 GRAMD1BQ3KR37 738 aa30.29■■■□□ 2.44
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC22A16Q86VW1 577 aa30.29■■■□□ 2.44
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CTDNEP1-209ENST00000574205 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP30.28■■■□□ 2.44
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CTDNEP1-209ENST00000574205 MIB2Q96AX9 1013 aa30.28■■■□□ 2.44
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CTDNEP1-209ENST00000574205 LIPT1Q9Y234 373 aa30.28■■■□□ 2.44
CTDNEP1-209ENST00000574205 LRRC3CA6NJW4 275 aa30.27■■■□□ 2.44
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CTDNEP1-209ENST00000574205 STX11O75558 287 aa30.27■■■□□ 2.44
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF350Q9GZX5 532 aa30.27■■■□□ 2.44
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CTDNEP1-209ENST00000574205 MST1P26927 711 aa30.27■■■□□ 2.44
CTDNEP1-209ENST00000574205 GAS1P54826 345 aa30.27■■■□□ 2.44
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CTDNEP1-209ENST00000574205 REP15Q6BDI9 236 aa30.27■■■□□ 2.44
CTDNEP1-209ENST00000574205 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP30.27■■■□□ 2.44
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CTDNEP1-209ENST00000574205 CGREF1Q99674 301 aa30.27■■■□□ 2.44
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CTDNEP1-209ENST00000574205 B4GALT7Q9UBV7 327 aa30.27■■■□□ 2.44
CTDNEP1-209ENST00000574205 CORO2BQ9UQ03 480 aa30.27■■■□□ 2.44
CTDNEP1-209ENST00000574205 ALG1L2C9J202 215 aa30.26■■■□□ 2.43
CTDNEP1-209ENST00000574205 SCO2O43819 266 aa30.26■■■□□ 2.43
CTDNEP1-209ENST00000574205 HPGDP15428 266 aa30.26■■■□□ 2.43
CTDNEP1-209ENST00000574205 TDGF1P3P51864 188 aa30.26■■■□□ 2.43
CTDNEP1-209ENST00000574205 DSTNP60981 165 aa30.26■■■□□ 2.43
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP30.26■■■□□ 2.43
CTDNEP1-209ENST00000574205 TIGD3Q6B0B8 471 aa30.26■■■□□ 2.43
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