RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561405.1

UBE2CP4-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 C pseudogene 4, humanhuman

BASIC

Gene UBE2CP4, Length 535 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2CP4-201ENST00000561405 ADH7P40394 386 aa6.74□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 SLC18A1P54219 525 aa6.74□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 MANFP55145 182 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 GFRA1P56159 465 aa6.74□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 EMX2Q04743 252 aa6.74□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 HSPB3Q12988 150 aa6.74□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 CHI3L2Q15782 390 aa6.74□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 DECR1Q16698 335 aa6.74□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa6.74□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 DCST1Q5T197 706 aa6.74□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 LCE2CQ5TA81 110 aa6.74□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa6.74□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa6.74□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa6.74□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 CAMKMTQ7Z624 323 aa6.74□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 PM20D2Q8IYS1 436 aa6.74□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 KIRREL3Q8IZU9 778 aa6.74□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 NATD1Q8N6N6 113 aa6.74□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 FADS6Q8N9I5 356 aa6.74□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 CDRT4Q8N9R6 151 aa6.74□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 CEP70Q8NHQ1 597 aa6.74□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 CLHC1Q8NHS4 586 aa6.74□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 FAM110BQ8TC76 370 aa6.74□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 AGR3Q8TD06 166 aa6.74□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 DTNBP1Q96EV8 351 aa6.74□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 WDYHV1Q96HA8 205 aa6.74□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 UGT2B28Q9BY64 529 aa6.74□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 RUBCNLQ9H714 662 aa6.74□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 EXO5Q9H790 373 aa6.74□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 Q9N2J8 555 aa6.74□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 SERHLQ9NQF3 203 aa6.74□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 SH3BP4Q9P0V3 963 aa6.74□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 Q9UFV3 132 aa6.74□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 GIMAP2Q9UG22 337 aa6.74□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 FBXL2Q9UKC9 423 aa6.74□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 SLC6A5Q9Y345 797 aa6.74□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 RAP2CQ9Y3L5 183 aa6.74□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 OR10H1Q9Y4A9 318 aa6.74□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa6.73□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa6.73□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 GXYLT2A0PJZ3 443 aa6.73□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 EMC8O43402 210 aa6.73□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 TRAPPC6AO75865 159 aa6.73□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 HSPA4LO95757 839 aa6.73□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 IGKV1D-16P01601 117 aa6.73□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 NGFRP08138 427 aa6.73□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 MYZAPP0CAP1 466 aa6.73□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 LAMP1P11279 417 aa6.73□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 COX6B1P14854 86 aa6.73□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 PRPS1L1P21108 318 aa6.73□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 CHMP24386 653 aa6.73□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 LCN1P31025 176 aa6.73□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 GABRA3P34903 492 aa6.73□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 EVI2BP34910 448 aa6.73□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 HPCAL1P37235 193 aa6.73□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 SLC1A6P48664 564 aa6.73□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 RPL14P50914 215 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 DIO3P55073 304 aa6.73□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 CLDN8P56748 225 aa6.73□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 B3GALT5-AS1P59052 145 aa6.73□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 PRR5P85299 388 aa6.73□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 PTGR1Q14914 329 aa6.73□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP6.73□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP6.73□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa6.73□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 VPS26BQ4G0F5 336 aa6.73□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 IL23RQ5VWK5 629 aa6.73□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 MFSD12Q6NUT3 480 aa6.73□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 POMZP3Q6PJE2 187 aa6.73□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 LACC1Q8IV20 430 aa6.73□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 LIX1LQ8IVB5 337 aa6.73□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 MCEMP1Q8IX19 187 aa6.73□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 ZNF781Q8N8C0 355 aa6.73□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 FNDC5Q8NAU1 212 aa6.73□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 SLC16A11Q8NCK7 471 aa6.73□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 NUP43Q8NFH3 380 aa6.73□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 OR7A2PQ8NGA2 310 aa6.73□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa6.73□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 ZPLD1Q8TCW7 415 aa6.73□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms