RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 GPLD1P80108 840 aa8.02□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 ID2Q02363 134 aa8.02□□□□□ -1.12
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PTPRB-208ENST00000550358 TPRA1Q86W33 373 aa8.02□□□□□ -1.12
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PTPRB-208ENST00000550358 TMEM239Q8WW34 195 aa8.02□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.12
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PTPRB-208ENST00000550358 KCND3Q9UK17 655 aa8.02□□□□□ -1.13
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PTPRB-208ENST00000550358 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa8.01□□□□□ -1.13
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PTPRB-208ENST00000550358 ZBTB42B2RXF5 422 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 SLC1A7O00341 560 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 OLFM2O95897 454 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 GPX3P22352 226 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 GNRHRP30968 328 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 CSNK1A1P48729 337 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
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