RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537686.5

GGA3-201, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GGA3, Length 4,069 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-201ENST00000537686 BTBD16Q32M84 506 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 GLT8D1Q68CQ7 371 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 SYCE2Q6PIF2 218 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 MAVSQ7Z434 540 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 ANKK1Q8NFD2 765 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 OR9A4Q8NGU2 314 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 OR2L8Q8NGY9 312 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 OR5K2Q8NHB8 316 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 TFAP2CQ92754 450 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 ZNF597Q96LX8 424 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 ADOQ96SZ5 270 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 TRPV4Q9HBA0 871 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 POLE4Q9NR33 117 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 RXFP3Q9NSD7 469 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 OR14I1A6ND48 311 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 KIAA0355O15063 1070 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 CD97P48960 835 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 APOFQ13790 326 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 TBC1D25Q3MII6 688 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 CCSMST1Q4G0I0 132 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 FRMPD2BQ6IN97 320 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 TMEM207Q6UWW9 146 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 FOXRED2Q8IWF2 684 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 METTL4Q8N3J2 472 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 METTL25Q8N6Q8 603 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 CFHR5Q9BXR6 569 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 LHPPQ9H008 270 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 TAAR2Q9P1P5 351 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 SLC7A7Q9UM01 511 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 PTPRFP10586 1907 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 FAM171A2A8MVW0 826 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 LRRN3E7EW58 273 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 HSPA12AO43301 675 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 IGLV3-25P01717 112 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 CLUP10909 449 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 MTHFD2P13995 350 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 S100A1P23297 94 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 HOXA9P31269 272 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 GNG2P59768 71 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 TMEM240Q5SV17 173 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 ANKRD54Q6NXT1 300 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 CHRDL2Q6WN34 429 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 CBLL1Q75N03 491 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 CCDC80Q76M96 950 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 SPNS2Q8IVW8 549 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 OR2T11Q8NH01 316 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 CDS1Q92903 461 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 LRRN3Q9H3W5 708 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 TMEM165Q9HC07 324 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 H0YGG7 62 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 H3BML4 177 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 PLOD2O00469 737 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 PPP1R3DO95685 299 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 GPR75O95800 540 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 CD6P30203 668 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 CTHP32929 405 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 LEG1Q6P5S2 330 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 MS4A15Q8N5U1 240 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 TMEM239Q8WW34 195 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 ZNF583Q96ND8 569 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 HOXD1Q9GZZ0 328 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 TMEM185BQ9H7F4 350 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 LRIT1Q9P2V4 623 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 CASC3O15234 703 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 SYNGR4O95473 234 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 FXYD6P3P58550 94 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 NKX3-2P78367 333 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 MAB21L1Q13394 359 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 ZER1Q7Z7L7 766 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 FUNDC1Q8IVP5 155 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 L3MBTL4Q8NA19 623 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 GATA6Q92908 595 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 ABCG5Q9H222 651 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 ZNF576Q9H609 170 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 SMURF1Q9HCE7 757 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 MED11Q9P086 117 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 ABCG2Q9UNQ0 655 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 PARP14Q460N5 1801 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.8 ms