RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528462.5

PACSIN3-205, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 2

Gene PACSIN3, Length 1,560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-205ENST00000528462 ABI3Q9P2A4 366 aa20.26■□□□□ 0.83
PACSIN3-205ENST00000528462 PACSIN3Q9UKS6 424 aa20.26■□□□□ 0.83
PACSIN3-205ENST00000528462 ANGPT4Q9Y264 503 aa20.26■□□□□ 0.83
PACSIN3-205ENST00000528462 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa20.26■□□□□ 0.83
PACSIN3-205ENST00000528462 PKD1L2Q7Z442 2459 aa20.26■□□□□ 0.83
PACSIN3-205ENST00000528462 A6NL46 340 aa20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-205ENST00000528462 KIAA0513O60268 411 aa20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-205ENST00000528462 REM1O75628 298 aa20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-205ENST00000528462 NGFRP08138 427 aa20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-205ENST00000528462 IL12BP29460 328 aa20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-205ENST00000528462 SOX3P41225 446 aa20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-205ENST00000528462 MFAP5Q13361 173 aa20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-205ENST00000528462 EFR3AQ14156 821 aa20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-205ENST00000528462 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-205ENST00000528462 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-205ENST00000528462 IGFL2Q6UWQ7 119 aa20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-205ENST00000528462 NUP54Q7Z3B4 507 aa20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-205ENST00000528462 HPS6Q86YV9 775 aa20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-205ENST00000528462 PRR22Q8IZ63 422 aa20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-205ENST00000528462 TMEM156Q8N614 296 aa20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-205ENST00000528462 ASB15Q8WXK1 588 aa20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-205ENST00000528462 SGCZQ96LD1 299 aa20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-205ENST00000528462 ADOQ96SZ5 270 aa20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-205ENST00000528462 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-205ENST00000528462 NPIPB9F8W1W9 429 aa20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-205ENST00000528462 OR6B1O95007 311 aa20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-205ENST00000528462 ALPPP05187 535 aa20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-205ENST00000528462 GGT1P19440 569 aa20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-205ENST00000528462 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-205ENST00000528462 HLCSP50747 726 aa20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-205ENST00000528462 CHRNEQ04844 493 aa20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-205ENST00000528462 ZAR1Q86SH2 424 aa20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-205ENST00000528462 BEST3Q8N1M1 668 aa20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-205ENST00000528462 ZNF619Q8N2I2 560 aa20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-205ENST00000528462 FAM156AQ8NDB6 213 aa20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-205ENST00000528462 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-205ENST00000528462 ASB9Q96DX5 294 aa20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-205ENST00000528462 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-205ENST00000528462 HOXD1Q9GZZ0 328 aa20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-205ENST00000528462 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
PACSIN3-205ENST00000528462 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa20.24■□□□□ 0.83
PACSIN3-205ENST00000528462 HS6ST1O60243 411 aa20.24■□□□□ 0.83
PACSIN3-205ENST00000528462 UGT2B11O75310 529 aa20.24■□□□□ 0.83
PACSIN3-205ENST00000528462 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
PACSIN3-205ENST00000528462 PDE5AO76074 875 aa20.24■□□□□ 0.83
PACSIN3-205ENST00000528462 CXADRP78310 365 aa20.24■□□□□ 0.83
PACSIN3-205ENST00000528462 FLYWCH1Q4VC44 716 aa20.24■□□□□ 0.83
PACSIN3-205ENST00000528462 TMEM81Q6P7N7 255 aa20.24■□□□□ 0.83
PACSIN3-205ENST00000528462 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
PACSIN3-205ENST00000528462 RNF138Q8WVD3 245 aa20.24■□□□□ 0.83
PACSIN3-205ENST00000528462 GORASP2Q9H8Y8 452 aa20.24■□□□□ 0.83
PACSIN3-205ENST00000528462 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
PACSIN3-205ENST00000528462 UBQLN4Q9NRR5 601 aa20.24■□□□□ 0.83
PACSIN3-205ENST00000528462 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa20.24■□□□□ 0.83
PACSIN3-205ENST00000528462 MKLN1Q9UL63 735 aa20.24■□□□□ 0.83
PACSIN3-205ENST00000528462 ERICH4A6NGS2 130 aa20.23■□□□□ 0.83
PACSIN3-205ENST00000528462 PDE9AO76083 593 aa20.23■□□□□ 0.83
PACSIN3-205ENST00000528462 CYB561P49447 251 aa20.23■□□□□ 0.83
PACSIN3-205ENST00000528462 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
PACSIN3-205ENST00000528462 ZNF141Q15928 474 aa20.23■□□□□ 0.83
PACSIN3-205ENST00000528462 TBR1Q16650 682 aa20.23■□□□□ 0.83
PACSIN3-205ENST00000528462 KRT73Q86Y46 540 aa20.23■□□□□ 0.83
PACSIN3-205ENST00000528462 GOLM1Q8NBJ4 401 aa20.23■□□□□ 0.83
PACSIN3-205ENST00000528462 OR52E4Q8NGH9 312 aa20.23■□□□□ 0.83
PACSIN3-205ENST00000528462 HGDQ93099 445 aa20.23■□□□□ 0.83
PACSIN3-205ENST00000528462 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
PACSIN3-205ENST00000528462 ZNF607Q96SK3 696 aa20.23■□□□□ 0.83
PACSIN3-205ENST00000528462 SH2D2AQ9NP31 389 aa20.23■□□□□ 0.83
PACSIN3-205ENST00000528462 HPF1Q9NWY4 346 aa20.23■□□□□ 0.83
PACSIN3-205ENST00000528462 ACTR3BQ9P1U1 418 aa20.23■□□□□ 0.83
PACSIN3-205ENST00000528462 SLC7A8Q9UHI5 535 aa20.23■□□□□ 0.83
PACSIN3-205ENST00000528462 SNX13Q9Y5W8 968 aa20.23■□□□□ 0.83
PACSIN3-205ENST00000528462 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
PACSIN3-205ENST00000528462 AGAP5A6NIR3 686 aa20.22■□□□□ 0.83
PACSIN3-205ENST00000528462 CXCR6O00574 342 aa20.22■□□□□ 0.83
PACSIN3-205ENST00000528462 CYP4B1P13584 511 aa20.22■□□□□ 0.83
PACSIN3-205ENST00000528462 TBXA2RP21731 343 aa20.22■□□□□ 0.83
PACSIN3-205ENST00000528462 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
PACSIN3-205ENST00000528462 KDELR2P33947 212 aa20.22■□□□□ 0.83
PACSIN3-205ENST00000528462 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
PACSIN3-205ENST00000528462 RFX3P48380 749 aa20.22■□□□□ 0.83
PACSIN3-205ENST00000528462 ATP12AP54707 1039 aa20.22■□□□□ 0.83
PACSIN3-205ENST00000528462 FBXW4P57775 412 aa20.22■□□□□ 0.83
PACSIN3-205ENST00000528462 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
PACSIN3-205ENST00000528462 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
PACSIN3-205ENST00000528462 GALNT10Q86SR1 603 aa20.22■□□□□ 0.83
PACSIN3-205ENST00000528462 OR4C3Q8NH37 302 aa20.22■□□□□ 0.83
PACSIN3-205ENST00000528462 HAS2Q92819 552 aa20.22■□□□□ 0.83
PACSIN3-205ENST00000528462 ZG16BQ96DA0 208 aa20.22■□□□□ 0.83
PACSIN3-205ENST00000528462 TMCO6Q96DC7 493 aa20.22■□□□□ 0.83
PACSIN3-205ENST00000528462 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
PACSIN3-205ENST00000528462 EGFL7Q9UHF1 273 aa20.22■□□□□ 0.83
PACSIN3-205ENST00000528462 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa20.22■□□□□ 0.83
PACSIN3-205ENST00000528462 ABCG2Q9UNQ0 655 aa20.22■□□□□ 0.83
PACSIN3-205ENST00000528462 TP53I11O14683 189 aa20.21■□□□□ 0.83
PACSIN3-205ENST00000528462 GSTA4O15217 222 aa20.21■□□□□ 0.83
PACSIN3-205ENST00000528462 UGT2B17O75795 530 aa20.21■□□□□ 0.83
PACSIN3-205ENST00000528462 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
PACSIN3-205ENST00000528462 UTS2O95399 124 aa20.21■□□□□ 0.83
PACSIN3-205ENST00000528462 CASRP41180 1078 aa20.21■□□□□ 0.83
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