RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524325.5

TSNARE1-208, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
TSNARE1-208ENST00000524325 ANGPT4Q9Y264 503 aa20.92■□□□□ 0.94
TSNARE1-208ENST00000524325 V9GYQ6 96 aa20.92■□□□□ 0.94
TSNARE1-208ENST00000524325 KRT20P35900 424 aa20.91■□□□□ 0.94
TSNARE1-208ENST00000524325 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
TSNARE1-208ENST00000524325 MEP1AQ16819 746 aa20.91■□□□□ 0.94
TSNARE1-208ENST00000524325 ABHD17BQ5VST6 288 aa20.91■□□□□ 0.94
TSNARE1-208ENST00000524325 ERICH5Q6P6B1 374 aa20.91■□□□□ 0.94
TSNARE1-208ENST00000524325 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa20.91■□□□□ 0.94
TSNARE1-208ENST00000524325 ACOT8O14734 319 aa20.9■□□□□ 0.94
TSNARE1-208ENST00000524325 ABCB7O75027 752 aa20.9■□□□□ 0.94
TSNARE1-208ENST00000524325 PPM1BO75688 479 aa20.9■□□□□ 0.94
TSNARE1-208ENST00000524325 UTS2O95399 124 aa20.9■□□□□ 0.94
TSNARE1-208ENST00000524325 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
TSNARE1-208ENST00000524325 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa20.9■□□□□ 0.94
TSNARE1-208ENST00000524325 VRK2Q86Y07 508 aa20.9■□□□□ 0.94
TSNARE1-208ENST00000524325 ARMC10Q8N2F6 343 aa20.9■□□□□ 0.94
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF614Q8N883 585 aa20.9■□□□□ 0.94
TSNARE1-208ENST00000524325 WDR60Q8WVS4 1066 aa20.9■□□□□ 0.94
TSNARE1-208ENST00000524325 EXTL1Q92935 676 aa20.9■□□□□ 0.94
TSNARE1-208ENST00000524325 TAMM41Q96BW9 452 aa20.9■□□□□ 0.94
TSNARE1-208ENST00000524325 ARSGQ96EG1 525 aa20.9■□□□□ 0.94
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF354BQ96LW1 612 aa20.9■□□□□ 0.94
TSNARE1-208ENST00000524325 AGAP4Q96P64 663 aa20.9■□□□□ 0.94
TSNARE1-208ENST00000524325 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
TSNARE1-208ENST00000524325 SNX13Q9Y5W8 968 aa20.9■□□□□ 0.94
TSNARE1-208ENST00000524325 WDPCPO95876 746 aa20.9■□□□□ 0.94
TSNARE1-208ENST00000524325 FBXO45P0C2W1 286 aa20.9■□□□□ 0.94
TSNARE1-208ENST00000524325 KDELR2P33947 212 aa20.9■□□□□ 0.94
TSNARE1-208ENST00000524325 DMTNQ08495 405 aa20.9■□□□□ 0.94
TSNARE1-208ENST00000524325 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP20.9■□□□□ 0.94
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
TSNARE1-208ENST00000524325 GRAMD1BQ3KR37 738 aa20.9■□□□□ 0.94
TSNARE1-208ENST00000524325 APOOLQ6UXV4 268 aa20.9■□□□□ 0.94
TSNARE1-208ENST00000524325 GATSQ8NAP1 163 aa20.9■□□□□ 0.94
TSNARE1-208ENST00000524325 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM162AQ96A26 154 aa20.9■□□□□ 0.94
TSNARE1-208ENST00000524325 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
TSNARE1-208ENST00000524325 NODALQ96S42 347 aa20.9■□□□□ 0.94
TSNARE1-208ENST00000524325 G6PC3Q9BUM1 346 aa20.9■□□□□ 0.94
TSNARE1-208ENST00000524325 RTN4RQ9BZR6 473 aa20.9■□□□□ 0.94
TSNARE1-208ENST00000524325 C2orf72A6NCS6 295 aa20.89■□□□□ 0.93
TSNARE1-208ENST00000524325 KIAA0513O60268 411 aa20.89■□□□□ 0.93
TSNARE1-208ENST00000524325 UGT2B17O75795 530 aa20.89■□□□□ 0.93
TSNARE1-208ENST00000524325 AK1P00568 194 aa20.89■□□□□ 0.93
TSNARE1-208ENST00000524325 SOX8P57073 446 aa20.89■□□□□ 0.93
TSNARE1-208ENST00000524325 AP2B1P63010 937 aa20.89■□□□□ 0.93
TSNARE1-208ENST00000524325 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
TSNARE1-208ENST00000524325 VEZF1Q14119 521 aa20.89■□□□□ 0.93
TSNARE1-208ENST00000524325 FXNQ16595 210 aa20.89■□□□□ 0.93
TSNARE1-208ENST00000524325 PDZK1Q5T2W1 519 aa20.89■□□□□ 0.93
TSNARE1-208ENST00000524325 MDGA2Q7Z553 956 aa20.89■□□□□ 0.93
TSNARE1-208ENST00000524325 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
TSNARE1-208ENST00000524325 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF619Q8N2I2 560 aa20.89■□□□□ 0.93
TSNARE1-208ENST00000524325 ASB9Q96DX5 294 aa20.89■□□□□ 0.93
TSNARE1-208ENST00000524325 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
TSNARE1-208ENST00000524325 TEKT2Q9UIF3 430 aa20.89■□□□□ 0.93
TSNARE1-208ENST00000524325 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa20.89■□□□□ 0.93
TSNARE1-208ENST00000524325 DSPP15924 2871 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
TSNARE1-208ENST00000524325 TPRP12270 2363 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
TSNARE1-208ENST00000524325 A0A0G2JPF8 293 aa20.88■□□□□ 0.93
TSNARE1-208ENST00000524325 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa20.88■□□□□ 0.93
TSNARE1-208ENST00000524325 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa20.88■□□□□ 0.93
TSNARE1-208ENST00000524325 G3V3Y1 287 aa20.88■□□□□ 0.93
TSNARE1-208ENST00000524325 TPST1O60507 370 aa20.88■□□□□ 0.93
TSNARE1-208ENST00000524325 SERPINA1P01009 418 aa20.88■□□□□ 0.93
TSNARE1-208ENST00000524325 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa20.88■□□□□ 0.93
TSNARE1-208ENST00000524325 DCTP40126 519 aa20.88■□□□□ 0.93
TSNARE1-208ENST00000524325 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa20.88■□□□□ 0.93
TSNARE1-208ENST00000524325 CRB2Q5IJ48 1285 aa20.88■□□□□ 0.93
TSNARE1-208ENST00000524325 SPINK14Q6IE38 97 aa20.88■□□□□ 0.93
TSNARE1-208ENST00000524325 COMTD1Q86VU5 262 aa20.88■□□□□ 0.93
TSNARE1-208ENST00000524325 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
TSNARE1-208ENST00000524325 BCL2L10Q9HD36 194 aa20.88■□□□□ 0.93
TSNARE1-208ENST00000524325 RLIMQ9NVW2 624 aa20.88■□□□□ 0.93
TSNARE1-208ENST00000524325 DSPPQ9NZW4 1301 aa20.88■□□□□ 0.93
TSNARE1-208ENST00000524325 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
TSNARE1-208ENST00000524325 SOX30O94993 753 aa20.88■□□□□ 0.93
TSNARE1-208ENST00000524325 CD96P40200 585 aa20.88■□□□□ 0.93
TSNARE1-208ENST00000524325 BNIP2Q12982 314 aa20.88■□□□□ 0.93
TSNARE1-208ENST00000524325 GNA13Q14344 377 aa20.88■□□□□ 0.93
TSNARE1-208ENST00000524325 C1orf146Q5VVC0 180 aa20.88■□□□□ 0.93
TSNARE1-208ENST00000524325 ISLR2Q6UXK2 745 aa20.88■□□□□ 0.93
TSNARE1-208ENST00000524325 DHFR2Q86XF0 187 aa20.88■□□□□ 0.93
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM86B1Q8N7N1 296 aa20.88■□□□□ 0.93
TSNARE1-208ENST00000524325 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
TSNARE1-208ENST00000524325 TNIP2Q8NFZ5 429 aa20.88■□□□□ 0.93
TSNARE1-208ENST00000524325 BBS10Q8TAM1 723 aa20.88■□□□□ 0.93
TSNARE1-208ENST00000524325 HGDQ93099 445 aa20.88■□□□□ 0.93
TSNARE1-208ENST00000524325 SAP130Q9H0E3 1048 aa20.88■□□□□ 0.93
TSNARE1-208ENST00000524325 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
TSNARE1-208ENST00000524325 HPF1Q9NWY4 346 aa20.88■□□□□ 0.93
TSNARE1-208ENST00000524325 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
TSNARE1-208ENST00000524325 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa20.88■□□□□ 0.93
TSNARE1-208ENST00000524325 CSAG2Q9Y5P2 127 aa20.88■□□□□ 0.93
TSNARE1-208ENST00000524325 DOCK10Q96BY6 2186 aa20.87■□□□□ 0.93
TSNARE1-208ENST00000524325 OR6C70A6NIJ9 312 aa20.87■□□□□ 0.93
TSNARE1-208ENST00000524325 PNLIPRP2P54317 469 aa20.87■□□□□ 0.93
TSNARE1-208ENST00000524325 TBR1Q16650 682 aa20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms