RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524131.5

MEG3-223, Transcript of maternally expressed 3, human

TSL 5 BASIC

Gene MEG3, Length 721 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MEG3-223	ENST00000524131	ORC6	Q9Y5N6	252 aa		10.83	□□□□□ -0.68
MEG3-223	ENST00000524131	GPC6	Q9Y625	555 aa	Predicted RBP	10.83	□□□□□ -0.68
MEG3-223	ENST00000524131	SVIL	O95425	2214 aa		10.82	□□□□□ -0.68
MEG3-223	ENST00000524131	MEN1	O00255	615 aa		10.82	□□□□□ -0.68
MEG3-223	ENST00000524131	CLDN4	O14493	209 aa		10.82	□□□□□ -0.68
MEG3-223	ENST00000524131	CHST10	O43529	356 aa		10.82	□□□□□ -0.68
MEG3-223	ENST00000524131	B4GALT2	O60909	372 aa		10.82	□□□□□ -0.68
MEG3-223	ENST00000524131	COQ9	O75208	318 aa		10.82	□□□□□ -0.68
MEG3-223	ENST00000524131	PRKRA	O75569	313 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
MEG3-223	ENST00000524131	TNFAIP8	O95379	198 aa		10.82	□□□□□ -0.68
MEG3-223	ENST00000524131	C1QC	P02747	245 aa		10.82	□□□□□ -0.68
MEG3-223	ENST00000524131	ALB	P02768	609 aa		10.82	□□□□□ -0.68
MEG3-223	ENST00000524131	MT-ND1	P03886	318 aa		10.82	□□□□□ -0.68
MEG3-223	ENST00000524131	ALPL	P05186	524 aa		10.82	□□□□□ -0.68
MEG3-223	ENST00000524131	HMGN2	P05204	90 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
MEG3-223	ENST00000524131	BCHE	P06276	602 aa		10.82	□□□□□ -0.68
MEG3-223	ENST00000524131	LYN	P07948	512 aa		10.82	□□□□□ -0.68
MEG3-223	ENST00000524131	NR2F1	P10589	423 aa		10.82	□□□□□ -0.68
MEG3-223	ENST00000524131	THRB	P10828	461 aa		10.82	□□□□□ -0.68
MEG3-223	ENST00000524131	CDH2	P19022	906 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
MEG3-223	ENST00000524131	MYF6	P23409	242 aa		10.82	□□□□□ -0.68
MEG3-223	ENST00000524131	CAPG	P40121	348 aa		10.82	□□□□□ -0.68
MEG3-223	ENST00000524131	PPP2R2B	Q00005	443 aa		10.82	□□□□□ -0.68
MEG3-223	ENST00000524131	MERTK	Q12866	999 aa		10.82	□□□□□ -0.68
MEG3-223	ENST00000524131	IL18R1	Q13478	541 aa		10.82	□□□□□ -0.68
MEG3-223	ENST00000524131	ATP1A4	Q13733	1029 aa		10.82	□□□□□ -0.68
MEG3-223	ENST00000524131	IQCC	Q4KMZ1	466 aa		10.82	□□□□□ -0.68
MEG3-223	ENST00000524131	ZNF628	Q5EBL2	1059 aa		10.82	□□□□□ -0.68
MEG3-223	ENST00000524131	TTC23	Q5W5X9	447 aa		10.82	□□□□□ -0.68
MEG3-223	ENST00000524131	UGT2A3	Q6UWM9	527 aa		10.82	□□□□□ -0.68
MEG3-223	ENST00000524131	TMEM107	Q6UX40	140 aa		10.82	□□□□□ -0.68
MEG3-223	ENST00000524131	STK32C	Q86UX6	486 aa		10.82	□□□□□ -0.68
MEG3-223	ENST00000524131	CARM1	Q86X55	608 aa		10.82	□□□□□ -0.68
MEG3-223	ENST00000524131	OR9A2	Q8NGT5	310 aa		10.82	□□□□□ -0.68
MEG3-223	ENST00000524131	PROX1	Q92786	737 aa		10.82	□□□□□ -0.68
MEG3-223	ENST00000524131	UCN3	Q969E3	161 aa		10.82	□□□□□ -0.68
MEG3-223	ENST00000524131	TPD52L3	Q96J77	140 aa		10.82	□□□□□ -0.68
MEG3-223	ENST00000524131	TRNT1	Q96Q11	434 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
MEG3-223	ENST00000524131	CSF3R	Q99062	836 aa		10.82	□□□□□ -0.68
MEG3-223	ENST00000524131	BARD1	Q99728	777 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
MEG3-223	ENST00000524131	YTHDF1	Q9BYJ9	559 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
MEG3-223	ENST00000524131	SERHL2	Q9H4I8	314 aa		10.82	□□□□□ -0.68
MEG3-223	ENST00000524131	FANCE	Q9HB96	536 aa		10.82	□□□□□ -0.68
MEG3-223	ENST00000524131	PNPLA3	Q9NST1	481 aa		10.82	□□□□□ -0.68
MEG3-223	ENST00000524131	TRPC4	Q9UBN4	977 aa		10.82	□□□□□ -0.68
MEG3-223	ENST00000524131	C3orf18	Q9UK00	162 aa		10.82	□□□□□ -0.68
MEG3-223	ENST00000524131	C2CD3	Q4AC94	2353 aa		10.82	□□□□□ -0.68
MEG3-223	ENST00000524131	ARRDC5	A6NEK1	342 aa		10.81	□□□□□ -0.68
MEG3-223	ENST00000524131		A6NL46	340 aa		10.81	□□□□□ -0.68
MEG3-223	ENST00000524131	TMEM229A	B2RXF0	380 aa		10.81	□□□□□ -0.68
MEG3-223	ENST00000524131	PDLIM1	O00151	329 aa		10.81	□□□□□ -0.68
MEG3-223	ENST00000524131	SYT5	O00445	386 aa		10.81	□□□□□ -0.68
MEG3-223	ENST00000524131	DLGAP1	O14490	977 aa		10.81	□□□□□ -0.68
MEG3-223	ENST00000524131	ZNF749	O43361	778 aa		10.81	□□□□□ -0.68
MEG3-223	ENST00000524131	FOXS1	O43638	330 aa		10.81	□□□□□ -0.68
MEG3-223	ENST00000524131	CTNS	O60931	367 aa		10.81	□□□□□ -0.68
MEG3-223	ENST00000524131	RDH16	O75452	317 aa		10.81	□□□□□ -0.68
MEG3-223	ENST00000524131	MFN2	O95140	757 aa		10.81	□□□□□ -0.68
MEG3-223	ENST00000524131	IFNW1	P05000	195 aa		10.81	□□□□□ -0.68
MEG3-223	ENST00000524131	KLK3	P07288	261 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
MEG3-223	ENST00000524131	OR12D1	P0DN82	309 aa		10.81	□□□□□ -0.68
MEG3-223	ENST00000524131	RHCE	P18577	417 aa		10.81	□□□□□ -0.68
MEG3-223	ENST00000524131	POU3F2	P20265	443 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
MEG3-223	ENST00000524131	CD247	P20963	164 aa		10.81	□□□□□ -0.68
MEG3-223	ENST00000524131	MC3R	P41968	323 aa		10.81	□□□□□ -0.68
MEG3-223	ENST00000524131	MAN2A2	P49641	1150 aa		10.81	□□□□□ -0.68
MEG3-223	ENST00000524131	HSD17B7	P56937	341 aa		10.81	□□□□□ -0.68
MEG3-223	ENST00000524131	SMIM11A	P58511	58 aa		10.81	□□□□□ -0.68
MEG3-223	ENST00000524131	VLDLR	P98155	873 aa		10.81	□□□□□ -0.68
MEG3-223	ENST00000524131	DUSP2	Q05923	314 aa		10.81	□□□□□ -0.68
MEG3-223	ENST00000524131	MAP4K2	Q12851	820 aa		10.81	□□□□□ -0.68
MEG3-223	ENST00000524131	RAPSN	Q13702	412 aa		10.81	□□□□□ -0.68
MEG3-223	ENST00000524131	SERTAD2	Q14140	314 aa		10.81	□□□□□ -0.68
MEG3-223	ENST00000524131	NCF4	Q15080	339 aa		10.81	□□□□□ -0.68
MEG3-223	ENST00000524131	DEFB110	Q30KQ9	67 aa		10.81	□□□□□ -0.68
MEG3-223	ENST00000524131	PLEKHN1	Q494U1	663 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
MEG3-223	ENST00000524131	SLC36A3	Q495N2	470 aa		10.81	□□□□□ -0.68
MEG3-223	ENST00000524131	EXOSC6	Q5RKV6	272 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
MEG3-223	ENST00000524131	ZNF385C	Q66K41	422 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
MEG3-223	ENST00000524131	HEPHL1	Q6MZM0	1159 aa		10.81	□□□□□ -0.68
MEG3-223	ENST00000524131	MFSD12	Q6NUT3	480 aa		10.81	□□□□□ -0.68
MEG3-223	ENST00000524131	VTCN1	Q7Z7D3	282 aa		10.81	□□□□□ -0.68
MEG3-223	ENST00000524131	CYP4Z1	Q86W10	505 aa		10.81	□□□□□ -0.68
MEG3-223	ENST00000524131	CDRT4	Q8N9R6	151 aa		10.81	□□□□□ -0.68
MEG3-223	ENST00000524131	SPPL2A	Q8TCT8	520 aa		10.81	□□□□□ -0.68
MEG3-223	ENST00000524131	MAGEE2	Q8TD90	523 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
MEG3-223	ENST00000524131	ADAMTS15	Q8TE58	950 aa		10.81	□□□□□ -0.68
MEG3-223	ENST00000524131	HOXB13	Q92826	284 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
MEG3-223	ENST00000524131	C5orf34	Q96MH7	638 aa		10.81	□□□□□ -0.68
MEG3-223	ENST00000524131	OR1F2P	Q96R84	312 aa		10.81	□□□□□ -0.68
MEG3-223	ENST00000524131	OR7D2	Q96RA2	312 aa		10.81	□□□□□ -0.68
MEG3-223	ENST00000524131	ZNF300	Q96RE9	604 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
MEG3-223	ENST00000524131	STAC	Q99469	402 aa		10.81	□□□□□ -0.68
MEG3-223	ENST00000524131	TREX2	Q9BQ50	279 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
MEG3-223	ENST00000524131	PSD2	Q9BQI7	771 aa		10.81	□□□□□ -0.68
MEG3-223	ENST00000524131	RUBCNL	Q9H714	662 aa		10.81	□□□□□ -0.68
MEG3-223	ENST00000524131	ZNF696	Q9H7X3	374 aa		10.81	□□□□□ -0.68
MEG3-223	ENST00000524131	CACYBP	Q9HB71	228 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
MEG3-223	ENST00000524131	POLE3	Q9NRF9	147 aa		10.81	□□□□□ -0.68
MEG3-223	ENST00000524131	DUSP22	Q9NRW4	184 aa		10.81	□□□□□ -0.68

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