RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 HFEQ30201 348 aa9.49□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 CD276Q5ZPR3 534 aa9.49□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 Q6ZVL8 140 aa9.49□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 SLC16A13Q7RTY0 426 aa9.49□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 TRIM69Q86WT6 500 aa9.49□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 NANOGP1Q8N7R0 232 aa9.49□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 LINGO1Q96FE5 620 aa9.49□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 GABRG3Q99928 467 aa9.49□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 CHIAQ9BZP6 476 aa9.49□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 SLC25A19Q9HC21 320 aa9.49□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa9.49□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 POMT2Q9UKY4 750 aa9.49□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 OR51B4Q9Y5P0 310 aa9.49□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 PRR33A8MZF0 331 aa9.48□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 H0YC42 278 aa9.48□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 CASKO14936 926 aa9.48□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 MMP2P08253 660 aa9.48□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 SELLP14151 372 aa9.48□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 ATP12AP54707 1039 aa9.48□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 FABP5Q01469 135 aa9.48□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 GTF2H2Q13888 395 aa9.48□□□□□ -0.89
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TRPS1-211ENST00000520276 OR2G6Q5TZ20 316 aa9.48□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa9.48□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 ENPP7Q6UWV6 458 aa9.48□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 ARRDC3Q96B67 414 aa9.48□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
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TRPS1-211ENST00000520276 COPS8Q99627 209 aa9.48□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 FBXO4Q9UKT5 387 aa9.48□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 MEIKINA0A087WXM9 373 aa9.48□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 ANXA2P2A6NMY6 339 aa9.48□□□□□ -0.89
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TRPS1-211ENST00000520276 GUCA1CO95843 209 aa9.48□□□□□ -0.89
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TRPS1-211ENST00000520276 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 P2RY2P41231 377 aa9.48□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 ERVK-25P63136 954 aa9.48□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 MESP2Q0VG99 397 aa9.48□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 TTLL9Q3SXZ7 439 aa9.48□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 KIAA0895LQ68EN5 471 aa9.48□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 VASNQ6EMK4 673 aa9.48□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 SERPINA11Q86U17 422 aa9.48□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF687Q8N1G0 1237 aa9.48□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 WDR20Q8TBZ3 569 aa9.48□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 C2CD4CQ8TF44 421 aa9.48□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
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TRPS1-211ENST00000520276 MND1Q9BWT6 205 aa9.48□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 LRTM1Q9HBL6 345 aa9.48□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 SLC22A11Q9NSA0 550 aa9.48□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 OR6C2Q9NZP2 312 aa9.48□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 RHCGQ9UBD6 479 aa9.48□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 DOCK8Q8NF50 2099 aa9.48□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa9.48□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 H7C2Y5 167 aa9.48□□□□□ -0.89
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TRPS1-211ENST00000520276 HPXP02790 462 aa9.48□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 ALDOBP05062 364 aa9.48□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 C6P13671 934 aa9.48□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 TIMP2P16035 220 aa9.48□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 ELK1P19419 428 aa9.48□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 MC4RP32245 332 aa9.48□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 HSPA7P48741 367 aa9.48□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 CCR6P51684 374 aa9.48□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP9.48□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 NTRK2Q16620 822 aa9.48□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 AFTPHQ6ULP2 937 aa9.48□□□□□ -0.89
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TRPS1-211ENST00000520276 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF527Q8NB42 609 aa9.48□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 OR4C15Q8NGM1 316 aa9.48□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 AP3S1Q92572 193 aa9.48□□□□□ -0.89
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TRPS1-211ENST00000520276 POPDC3Q9HBV1 291 aa9.48□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 R4GN57 208 aa9.48□□□□□ -0.89
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TRPS1-211ENST00000520276 SGCEO43556 437 aa9.47□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 ALPPL2P10696 532 aa9.47□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 LCN1P31025 176 aa9.47□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 ACSL1P33121 698 aa9.47□□□□□ -0.89
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TRPS1-211ENST00000520276 RAB13P51153 203 aa9.47□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 GANABQ14697 944 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 C3orf38Q5JPI3 329 aa9.47□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 IL20RBQ6UXL0 311 aa9.47□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF621Q6ZSS3 439 aa9.47□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 OR4L1Q8NH43 312 aa9.47□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 NSMAFQ92636 917 aa9.47□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 SLC38A3Q99624 504 aa9.47□□□□□ -0.89
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